Job Description P26612 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 57 Aligned Residues 437 % Identity 19% Template c1zjaB_ PDB info PDB header:isomerase Chain: B: PDB Molecule:trehalulose synthase; PDBTitle: crystal structure of the trehalulose synthase mutb from2 pseudomonas mesoacidophila mx-45 (triclinic form) Resolution 1.60 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.					10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.
Query Sequence		R	N	P	T	L	L	Q	C	.	.	.	.	F	H	W	Y	Y	P	E	G	G	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y
Query Conservation										.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.																																						.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	S	A	V	F	Y	Q	V	Y	P	R	S	F	K	D	T	N	G	D	G	I	G	D	F	K	G	L	T	E	K	L	D	Y	L	K	G	L	G	I	D	A	I	W	I	N	P	H	Y	A	.	.	S	P	N	T	D	N	G	Y	D	I	S	D	Y	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	V	M	K	E	Y
Template Known Secondary structure											G	G	G	T			S	S	S	S	S	S									T								T												.	.				T	T	T	T	S	S		S				.	.	.	.	.	.	.	.	.				G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.			.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70										.	.	.	.	.	.
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F
Query Conservation
Alig confidence																																.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	T	M	E	D	F	D	R	L	M	A	E	L	K	K	R	G	M	R	L	M	V	D	V	V	I	N	H	S	S	.	.	D	Q	H	E	W	F	K	S	S	R	A	S	K	D	N	P	Y	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Y
Template Known Secondary structure																	T	T										S	B			.	.	T	T	S								T		S	S	S	T	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G
Template Predicted Secondary structure																																.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.			.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.																													.	.
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V
Query Conservation
Alig confidence																									.	.	.																																										.
Template Conservation																									.	.	.																																										.
Template Sequence		Y	F	W	R	D	G	K	D	G	H	E	P	N	N	Y	P	S	F	F	G	G	S	A	.	.	.	W	E	K	D	P	V	T	G	Q	Y	Y	L	H	Y	F	G	R	Q	Q	P	D	L	N	W	D	T	P	K	L	R	E	E	L	Y	A	M	L	R	F	W	L	.	D	K	G	V	S	G	M	R	F	D	T	V
Template Known Secondary structure		B						B	T	T	B		S	S			B		T	T	S	S	B	S	.	.	.					T	T	T	T						S	S		T	T			B	B		T	T																	.	T	T	T							T	T	G
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.																																										.
Template SS confidence
		127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.				150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190		.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
		238	.	240																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.		.	.	.	.	.	.	.	.	290
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.
Query Sequence		K	H	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	.	E	G	K	T	M	L	F	D	A
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																										.
Template Conservation																																													.	.
Template Sequence		A	T	Y	S	K	T	P	G	F	P	D	L	T	P	E	Q	M	K	N	F	A	E	A	Y	T	Q	G	P	N	L	H	R	Y	L	Q	E	M	H	E	K	V	F	D	.	.	H	Y	D	A	V	T	A	G	E	I	F	G	A	P	L	N	Q	V	P	L	F	I	D	S	R	R	K	E	L	D	M	A	F	T	F
Template Known Secondary structure		G	G	S	S			T	T											T					T	T			T	T												T	G	G	.	.	G	S										S			G	G	G							G	G	G		S		S					S
Template Predicted Secondary structure																																													.	.
Template SS confidence
		203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.			.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
		291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.						.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.				.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.																																								.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.																																								.	.	.
Query Sequence		P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	.	.	.	.	.	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	.	.	.	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V
Query Conservation																			.	.	.	.	.																																								.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.																																								.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	L	I	R	Y	D	R	A	L	D	R	W	H	T	I	P	R	T	L	A	D	F	R	Q	T	I	D	K	V	D	A	I	A	G	E	Y	G	W	N	T	F	F	L	G	N	H	D	N	P	R	A	V	S	H	F	G	D	D	R	P	Q	W	R	E	A	S	A	K	A	L	A	T	V	T	L	T	Q	R	G	T
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	T	T	B		T	T	S	S		B																				T	T	T			B				S			T	T	S								S			S	T	T	T													T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
		363	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	Q	T	Y	P	I	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	F	I	F	Q	G	D	E	L	G	M	T	N	Y	P	F	K	T	L	Q	D	F	D	D	I	E	V	K	G	F	F	Q	D	Y	V	E	T	G	K	A	T	A	E	E	L	L	T	N	V	A	L	T	S	R	D	N	A	R	T	P	F	Q	W	D	D	S	A	N	A	G	F	T	T	G	K	P	W	L	K	V
Template Known Secondary structure						T	T	G	G	G	T								S	G	G	G														T	T	T	T	S	S														G	G	G	G	T	S					S	S	S	G	G	G	G	S		S	S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		361	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440
																		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.				.	.	410	.	.	.		.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.							.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.							.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	H	.	.	.	G	V	Q	T	L	F	.	F	D	H	P	N	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	N	G	D	D	G	E	K	T	I	H
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.							.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.							.																	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.
Template Sequence		N	P	N	Y	T	E	I	N	A	A	R	E	I	G	D	P	K	S	V	Y	S	F	Y	R	N	L	I	S	I	R	H	E	T	P	A	L	S	T	G	S	Y	R	D	I	D	P	S	N	A	D	V	Y	A	Y	T	R	S	Q	D	G	E	.	.	.	T	Y	L	V	V	V	N	F	K	A	E	P	R	S	F	T
Template Known Secondary structure			G	G	G	G	T	S							T		T	T	S														T		T					S					S		T	T		S	S									T	T		.	.	.									S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.
Template SS confidence
		441	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.				.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.
		449	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	G	E	N	Y	G	N	K	T	W	R	D	F	L	G	N	R	Q	E	R	V	V	T	D	E	N	G	E	A	T	F	F	C	N	G	G	S	V	S	V	W	V	I	E
Query Conservation
Alig confidence									.														.	.	.
Template Conservation									.														.	.	.
Template Sequence		L	P	D	G	M	H	I	.	A	E	T	L	I	E	S	S	S	P	A	A	P	.	.	.	A	A	G	A	A	S	L	E	L	Q	P	W	Q	S	G	I	Y	K	V	K
Template Known Secondary structure				T	T				.								S		S	S			.	.	.		T	T		S						T	T
Template Predicted Secondary structure									.														.	.	.
Template SS confidence
		518	.	520	.	.	.	.		.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.				.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.