Job Description P26612 Confidence 98.72% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 114 Aligned Residues 330 % Identity 13% Template c1uasA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of rice alpha-galactosidase Resolution 1.50 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.						.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.
Query Sequence		W	Y	Y	P	E	G	G	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	.	.	.	.	.	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A
Query Conservation																								.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Template Sequence		W	N	H	F	Y	C	G	I	N	E	Q	I	I	R	E	T	A	D	A	L	V	N	T	G	L	A	K	L	G	Y	Q	Y	V	N	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	C	W	A	E	Y	S	R	D	S	Q	G	N	F	V	P	N	R	Q	T	F	P	S	.	.	.	.	.	G	I	K	A	L
Template Known Secondary structure						T	T																	T	S					T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S		B		S	S			T	T	S				B		T	T	T		T	T	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Template SS confidence
		16	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50												.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.						.	.	.	.	.
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	D	Y	V	H	A	K	G	L	K	L	G	I	Y	S	D	A	G	S	Q	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								T	T									S	S	S	B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.				.	.
Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.
Query SS confidence																																																																													.	.	.
Query Sequence		E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	P	.	.	.	A	W
Query Conservation																																																																													.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.															.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	S	N	K	M	P	G	S	L	D	H	E	E	Q	D	V	K	T	F	A	S	W	.	G	V	D	Y	L	K	Y	D	N	C	N	D	A	G	R	S	V	M	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S	S	S	B			T	T													.	T												T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template SS confidence
																																								101	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.		.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H
Query Conservation
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	Y	T	R	M	S	N	A	M	K	T	Y	G	K	N	I	F	F	S	L	C	E	W	G	K	E	N	P	A	T	W	A	G	R	M	G	N	S	W	R	T	T	G	D	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	N	W	G	S	M	T	S	R	A	D	E	N	D	Q	W	A	A	Y	A
Template Known Secondary structure															T	T	S						S	T	T	T	T		G	G	G	T	G	G	G	T		S					S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S													T	T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.															.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	D	M	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q
Query Conservation
Alig confidence																																		.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	P	G	G	W	N	D	P	D	M	L	E	V	G	N	G	G	M	S	E	A	E	Y	R	S	H	F	S	I	W	A	L	.	.	.	.	A	K	A	P	L	L	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	C	D	V	R	S	M	S	Q	Q	T	K	N	I	L	S	N	S	E	V	I	A	V	N	Q
Template Known Secondary structure		B	T	T	B									T	T	S	S	S	S															.	.	.	.	T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S		T	T	S										T									T
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.					240	.	.	.	.	.	.													.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
		404	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.							.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	F	A	H	G	V	Q	T	L	F	F	D	H	P	N	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	N	G	D	D	G	E	K	T	I	H	L	G	E	N	.	.	.	.	.	.	Y	G	N	K	T	W	R	D	F	L	G	N	R	Q	E	R	V	V	T	D	E	N	G	E	A
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.																					.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.
Template Conservation																													.	.																																												.	.	.	.
Template Sequence		D	S	L	G	V	Q	G	K	K	V	Q	S	D	N	G	L	E	V	W	A	G	P	L	S	N	N	R	.	.	K	A	V	V	L	W	N	R	Q	S	Y	Q	A	T	I	T	A	H	W	S	N	I	G	L	A	G	S	V	A	V	T	A	R	D	L	W	A	H	S	S	F	A	A	.	.	.	.	Q	G	Q	I
Template Known Secondary structure			T	T											T	T									S	T	T		.	.									S	S	S								G	G	G	T	T			T	T								T	T	T	T						.	.	.	.		S
Template Predicted Secondary structure																													.	.																																												.	.	.	.
Template SS confidence
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.			.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.					.	.	.	.
		478	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	F	F	C	N	G	G	S	V	S	V	W	V	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	A	S	V	A	P	H	D	C	K	M	Y	V	L
Template Known Secondary structure							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.