Job Description P26612 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 14 Aligned Residues 438 % Identity 21% Template c1tcmB_ PDB info PDB header:glycosyltransferase Chain: B: PDB Molecule:cyclodextrin glycosyltransferase; PDBTitle: cyclodextrin glycosyltransferase w616a mutant from bacillus2 circulans strain 251 Resolution 2.20 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.			30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.																							.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.																							.	.	.	.	.
Query Sequence		M	R	N	P	T	L	L	Q	C	F	H	W	Y	Y	P	E	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	.	.	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	.	.	.	.	.
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.																							.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.																							.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	S	T	D	V	I	Y	Q	I	F	T	D	R	F	S	D	G	N	P	A	N	N	P	T	G	A	A	F	D	G	T	C	T	N	L	R	L	Y	C	G	G	D	W	Q	G	I	I	N	K	I	N	D	G	Y	L	T	G	M	G	V	T	A	I	W	I	S	Q	P	V	E	N	I	Y	S	I	I	N	Y	S	G
Template Known Secondary structure			T	T								T	T	T	T			S		T	T	S				G	G	G	B		S	S			S	T	T	S	B														S	S	T	T	G	G	G	T																				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
						52	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	N	N	T	A	Y	H	G	Y	W	A	R	D	F	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	T	N	P	A	Y	G	T	I	A	D	F	Q	N	L	I	A	A	A	H	A	K	N	I	K	V	I	I	D	F	A	P	N	H	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A
Template Known Secondary structure							T	T			S						.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	T																T	T										S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.										.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.																			.	.
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F
Query Conservation
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	S	D	Q	P	S	F	A	E	N	G	R	L	Y	D	N	G	T	L	L	G	G	Y	T	N	D	T	Q	N	L	F	H	H	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	T	D	F	S	T	T	E	N	G	I	Y	K	N	L	Y	D	L	A	D	L	N	H
Template Known Secondary structure			S	S		T	T	S	T	T	T	T					T	T						S	T	T			S			B			S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		B				S	S						S	S	B	B	T	T	B			B		T
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.		.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																												.
Query SS confidence																																																																												.
Query Sequence		R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	P	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	.	E	G	K	T	M
Query Conservation																																																																												.
Alig confidence																			.																																	.	.																							.
Template Conservation																			.																																	.	.
Template Sequence		N	N	S	T	V	D	V	Y	L	K	D	A	I	K	M	W	L	.	D	L	G	I	D	G	I	R	M	D	A	V	K	H	M	P	F	G	W	Q	K	S	F	M	A	A	V	N	N	Y	K	P	.	.	V	F	T	F	G	E	W	F	L	G	V	N	E	V	S	P	E	N	H	K	F	A	N	E	S	G	M	S
Template Known Secondary structure		T	S																.		T	T							T	T	T	T	S	S														T	T	S		.	.											T	T													S	S
Template Predicted Secondary structure																			.																																	.	.
Template SS confidence
		203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.			.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.			.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.															.
Query SS confidence																					.	.															.
Query Sequence		L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	.	.	Y	D	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	.	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P
Query Conservation																					.	.															.
Alig confidence																					.	.															.																																	.	.	.
Template Conservation																																																																						.	.	.
Template Sequence		L	L	D	F	R	F	A	Q	K	V	R	Q	V	F	R	D	N	T	D	N	M	Y	G	L	K	A	M	L	E	G	S	A	A	D	Y	A	Q	V	D	D	Q	V	T	F	I	D	N	H	D	M	E	R	F	H	A	S	N	A	N	R	R	K	L	E	Q	A	L	A	.	.	.	F	T	L	T	S	R	G	V	P
Template Known Secondary structure			B													T	S		S	S																S	T	T	G	G	G	S				S			T	T	S			S	S		T	T	S											.	.	.			T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.
Template SS confidence
		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.				.	.	350	.	.	.	.	.	.
		364	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.				.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.				.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.																					.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.																					.	.	.
Query Sequence		S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	.	.	.	D	M	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	H	.	.	.	G	V	Q	T	L	F	F	D	H	P	N	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M
Query Conservation																										.	.	.																					.	.	.
Alig confidence																										.	.	.																					.	.	.																								.	.
Template Conservation																																																																											.	.
Template Sequence		A	I	Y	Y	G	T	E	Q	Y	M	S	G	G	T	D	P	D	N	R	A	R	I	P	S	F	S	T	S	T	T	A	Y	Q	V	I	Q	K	L	A	P	L	R	K	C	N	P	A	I	A	Y	G	S	T	Q	E	R	W	I	N	N	D	V	L	I	Y	E	R	K	F	G	S	N	V	.	.	A	V	V	A	V
Template Known Secondary structure		B			T	T	G	G	G	T					S	T	T	T	T	S								S		S										T	T										S										S	S									T	T			.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.
Template SS confidence
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.			430	.	.	.	.
		438	.	440	.	.	.	.	.	.	.		.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.				.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.																						.	.	.
Query SS confidence												.																						.	.	.
Query Sequence		S	N	G	D	D	G	E	K	T	I	.	H	L	G	E	N	Y	G	N	K	T	W	R	D	F	L	G	N	R	Q	E	R	.	.	.	V	V	T	D	E	N	G	E	A	T	F	F	C	N	G	G	S	V	S	V	W	V	I	E	E	V	I
Query Conservation												.																						.	.	.
Alig confidence												.																						.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	R	N	L	N	A	P	A	S	I	S	G	L	V	T	S	L	P	Q	G	S	Y	N	D	V	L	G	G	L	L	N	G	N	T	L	S	V	G	S	G	G	A	A	S	N	F	T	L	A	A	G	G	T	A	V	W	Q	Y	T	A	A	T
Template Known Secondary structure					T	T							S		B		S			S						T	T	T	T	S	S	S								T	T	S	B	B							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		435	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.