Job Description P26612 Confidence 97.33% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 150 Aligned Residues 329 % Identity 11% Template c1r46B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:alpha-galactosidase a; PDBTitle: structure of human alpha-galactosidase Resolution 3.25 Å

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		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.						.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.
Query Sequence		P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	.	.	.	.	.	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A
Query Conservation														.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template Sequence		K	L	F	M	E	M	A	E	L	M	V	S	E	G	W	K	D	A	G	Y	E	Y	L	C	I	.	.	.	.	.	.	D	D	C	W	M	A	P	Q	R	D	S	E	G	R	L	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	A	D	P	Q	R	F	P	H	.	.	G	I	R	Q	L	A	N	Y	V	H	S	K	G	L	K
Template Known Secondary structure														T	T					T							.	.	.	.	.	.		S	S		B		S	S			T	T	S			.	.	.	.	.	.	.	.		B		T	T	T		T	T	.	.	T	T	T									T	T
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template SS confidence
		67	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.							.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.									.	.	.	110	.	.	.	.	.			.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130
		97	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	G	I	Y	A	D	V	G	N	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								S	S	S	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		131	.	.	.	.	.	.	.	.	140
		177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.					240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.	.	.
Query Sequence		I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	.	.	.	.	I	P	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V
Query Conservation																																																																	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.													.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	C	A	G	F	P	G	S	F	G	Y	Y	D	I	D	A	Q	T	F	A	D	W	.	G	V	D	L	L	K	F	D	G	C	Y	C	D	S	L	E	N	L	A	D	G	Y	K	H	M	S	L	A	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S	S	B			T	T	T												.	T										S		S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template SS confidence
																														141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.		.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
		253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.							.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	.	.	.	.	.	.	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V	T
Query Conservation														.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	R	T	G	R	S	I	V	Y	S	C	E	W	P	L	Y	M	W	P	F	Q	K	P	N	Y	T	E	I	R	Q	Y	C	N	H	W	R	N	F	A	D	I	D	D	S	W	K	S	I	K	S	I	L	D	W	T	S	F	N	Q	E	R	I	V	D	V	A	G	P	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						S													T	T	T	S								T	T	T		S					S					S	S													T	T	T	T	T						B	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.			.	.	.	.	400	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.
Query SS confidence																																																																							.	.
Query Sequence		L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	D	M	P	I	I	E	Q	L	.	.	D	E	L	I	L	A	R	Q	R
Query Conservation																																																																							.	.
Alig confidence																															.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Template Conservation																															.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	W	N	D	P	D	M	L	V	I	G	N	F	G	L	S	W	N	Q	Q	V	T	Q	M	A	L	W	A	I	.	.	.	.	M	A	A	P	L	F	M	S	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	R	H	I	S	P	Q	A	K	A	L	L	Q	D	K	D	V	I	A	I	N	Q	D
Template Known Secondary structure		B							B		T	T	S	S	S	S															.	.	.	.	T	T							S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S																			T
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		261	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.					290	.	.	.	.	.	.	.	.															.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
		405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.										.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	A	H	G	V	Q	T	L	F	F	D	H	P	N	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	N	G	D	D	G	E	K	T	I	H	L	G	E	N	Y	G	N	K	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	R	D	F	L	G	N	R	Q	E	R	V	V	T	D	E	N	G
Query Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Template Conservation																																																																																.
Template Sequence		P	L	G	K	Q	G	Y	Q	L	R	Q	G	D	N	F	E	V	W	E	R	P	L	S	G	L	A	W	A	V	A	M	I	N	R	Q	E	I	G	G	P	R	S	Y	T	I	A	V	A	S	L	G	K	G	V	A	C	N	P	A	C	F	I	T	Q	L	L	P	V	K	R	K	L	G	F	Y	E	W	T	.	S
Template Known Secondary structure		T	T										S	S	S									S	S	S												S	S	S								S	T	T	T	B	T	T	T	B	S	S	S									S	S									S	S	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.
Template SS confidence
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400		.
		476	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	A	T	F	F	C	N	G	G	S	V	S	V	W	V	I	E	E	V	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	L	R	S	H	I	N	P	T	G	T	V	L	L	Q	L	E	N	T	M
Template Known Secondary structure									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.