Job Description P26612 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 49 Aligned Residues 436 % Identity 17% Template c1m53A_ PDB info PDB header:isomerase Chain: A: PDB Molecule:isomaltulose synthase; PDBTitle: crystal structure of isomaltulose synthase (pali) from2 klebsiella sp. lx3 Resolution 2.20 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.					10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.
Query Sequence		R	N	P	T	L	L	Q	C	.	.	.	.	F	H	W	Y	Y	P	E	G	G	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y
Query Conservation										.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.																																						.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	E	A	V	F	Y	Q	I	Y	P	R	S	F	K	D	T	N	D	D	G	I	G	D	I	R	G	I	I	E	K	L	D	Y	L	K	S	L	G	I	D	A	I	W	I	N	P	H	Y	D	.	.	S	P	N	T	D	N	G	Y	D	I	S	N	Y	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	I	M	K	E	Y
Template Known Secondary structure											G	G	G	T			S	S	S	S	S	S									T								T												.	.				T	T	T	T	S	S		S				.	.	.	.	.	.	.	.	.				G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		49	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.			.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.										.	.	.	.	.	.
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F
Query Conservation
Alig confidence																																.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	T	M	E	D	F	D	S	L	V	A	E	M	K	K	R	N	M	R	L	M	I	D	V	V	I	N	H	T	S	.	.	D	Q	H	P	W	F	I	Q	S	K	S	D	K	N	N	P	Y	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Y
Template Known Secondary structure																	T	T										S	B			.	.	T	T	S										T	T		T	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G
Template Predicted Secondary structure																																.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		118	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.			.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.																													.	.
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.																																																												.
Template Conservation							.	.	.																																																												.
Template Sequence		Y	F	W	R	D	.	.	.	G	K	D	N	Q	P	P	N	N	Y	P	S	F	F	G	G	S	A	W	Q	K	D	A	K	S	G	Q	Y	Y	L	H	Y	F	A	R	Q	Q	P	D	L	N	W	D	N	P	K	V	R	E	D	L	Y	A	M	L	R	F	W	L	.	D	K	G	V	S	G	M	R	F	D	T	V
Template Known Secondary structure		B					.	.	.		S	S	S	S		S	S			B		T	T	S	S	B	S					T	T	T							S	S		T	T			B	B		T	T	S																.	T	T	T							T	T	G
Template Predicted Secondary structure							.	.	.																																																												.
Template SS confidence
		168	.	170	.	.				.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.		.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
		238	.	240	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.		.	.	.	.	.	.	.	.	290
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.
Query Sequence		K	H	I	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	.	E	G	K	T	M	L	F	D	A
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																									.
Template Conservation																																														.	.
Template Sequence		A	T	Y	S	K	I	P	G	F	P	N	L	T	P	E	Q	Q	K	N	F	A	E	Q	Y	T	M	G	P	N	I	H	R	Y	I	Q	E	M	N	R	K	V	L	S	R	.	.	Y	D	V	A	T	A	G	E	I	F	G	V	P	L	D	R	S	S	Q	F	F	D	R	R	R	H	E	L	N	M	A	F	M	F
Template Known Secondary structure		G	G	S	S			T	T											T					T	T			T	T												T	G	G	G	.	.	S									T	T			G	G	G	T						G	G	G		S		S
Template Predicted Secondary structure																																														.	.
Template SS confidence
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.			.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
		291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.							.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.				.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.																																							.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.																																							.	.	.
Query Sequence		P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	.	.	.	.	.	.	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	.	.	.	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.																																							.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.																																							.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	L	I	R	L	D	R	D	S	N	E	R	W	R	H	K	S	W	S	L	S	Q	F	R	Q	I	I	S	K	M	D	V	T	V	G	K	Y	G	W	N	T	F	F	L	D	N	H	D	N	P	R	A	V	S	H	F	G	D	D	R	P	Q	W	R	E	A	S	A	K	A	L	A	T	I	T	L	T	Q	R	A
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	T	T	B		S	S		T	T		B																				T	T	T			B				S			T	T	S								S			S	T	T	T													T	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
		362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	G	Q	T	Y	P	I	D	M	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	P	F	I	Y	Q	G	S	E	L	G	M	T	N	Y	P	F	R	Q	L	N	E	F	D	D	I	E	V	K	G	F	W	Q	D	Y	V	Q	S	G	K	V	T	A	T	E	F	L	D	N	V	R	L	T	S	R	D	N	S	R	T	P	F	Q	W	N	D	T	L	N	A	G	F	T	R	G	K	P	W	F	H
Template Known Secondary structure							T	T	T	T	T	T								S	G	G	G														T	T	T	T	S	S														G	G	G	G		S					S	S	S	G	G	G	G	S		S	S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.
																					391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.				.	.	410	.	.	.	.	.		.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.									.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.									.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	H	.	.	.	G	V	Q	T	L	F	F	D	.	H	P	N	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	N	G	D	D	G	E	K	T	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.									.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.									.															.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.
Template Sequence		I	N	P	N	Y	V	E	I	N	A	E	R	E	E	T	R	E	D	S	V	L	N	Y	Y	K	K	M	I	Q	L	R	H	H	I	P	A	L	V	Y	G	A	Y	Q	D	L	N	P	Q	D	N	T	V	Y	A	Y	T	R	T	L	G	N	E	.	.	.	R	Y	L	V	V	V	N	F	K	E	Y	P	V	R	Y
Template Known Secondary structure				G	G	G	G	T	S									T	T	S																					S					S		T	T		S	S									T	T		.	.	.									S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.
Template SS confidence
		482	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.				.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.
		448	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	L	G	E	N	Y	G	N	K	T	W	R	D	F	L	G	N	R	Q	E	R	V	V	T	D	E	N	G	E	A	T	F	F	C	N	G	G	S	V	S	V	W	V	I	E
Query Conservation
Alig confidence							.	.																.	.	.
Template Conservation							.	.																.	.	.
Template Sequence		T	L	P	A	N	.	.	D	A	I	E	E	V	V	I	D	T	Q	Q	Q	A	A	.	.	.	A	P	H	S	T	S	L	S	L	S	P	W	Q	A	G	V	Y	K	L	R
Template Known Secondary structure					T	T	.	.										S		S	S			.	.	.				S	S						T	T
Template Predicted Secondary structure							.	.																.	.	.
Template SS confidence
		559	560	.	.	.			.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.				.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.