Job Description P26612 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 34 Aligned Residues 420 % Identity 18% Template c1jgiA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:amylosucrase; PDBTitle: crystal structure of the active site mutant glu328gln of2 amylosucrase from neisseria polysaccharea in complex with3 the natural substrate sucrose Resolution 2.00 Å

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		18	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V
Query Conservation
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	G	D	L	K	G	L	K	D	K	I	P	Y	F	Q	E	L	G	L	T	Y	L	Y	L	M	P	L	F	K	C	P	E	G	K	S	D	G	G	Y	A	V	S	S	Y	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	V	N	P	A	L	G	T	I	G	D	L	R	E	V	I	A	A	L	H	E	A	G	I	S	A
Template Known Secondary structure			S	S							T								T		S								B				S	S		S	T	T	T	T	S		S		S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	B		T	T	T																T	T
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		109	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.										.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		98	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I
Query Conservation
Alig confidence												.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	V	D	F	I	F	N	H	T	S	.	.	N	E	H	E	W	A	Q	R	C	A	A	G	D	P	L	F	D	N	F	Y	Y	I	F	P	D	R	R	M	P	D	Q	Y	D	R	T	L	R	E	I	F	P	D	Q	H	P	G	G	F	S	Q	L	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								S				.	.	T	T	S									T		G	G	G	T	T	S	B				S	S	S								T	S				S		T	T	T		S	T	T					T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		180	.	.	.	.	.	.	.	.	.			190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
		178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240														.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	W	F
Query Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	R	W	V	W	T	T	F	N	S	F	Q	W	D	L	N	Y	S	N	P	W	V	F	R	A	M	A	G	E	M	L	F	L	A	.	N	L	G	V	D	I	L	R	M	D	A	V	A	F	I	W	K	Q	M	G	T	S	C	E	N	L	P	Q	A	H	A	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S						S	S		T	T				B		T	T	S																.	T	T	T								T	G	G	G	S				T	T	S		S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template SS confidence
															243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.		.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A
Query Conservation
Alig confidence															.																				.	.
Template Conservation															.																				.	.
Template Sequence		I	R	A	F	N	A	V	M	R	I	A	A	P	.	A	V	F	F	K	S	Q	A	I	V	H	P	D	Q	V	V	Q	Y	I	.	.	G	Q	D	E	C	Q	I	G	Y	N	P	L	Q	M	A	L	L	W	N	T	L	A	T	R	E	V	N	L	L	H	Q	A	L	T	Y	R	H	N	L	P	E	H	T	A	W
Template Known Secondary structure														T	.	T									S						G	G	G	B	.	.	S	T	T	S	B	S																														S					T	T
Template Predicted Secondary structure															.																				.	.
Template SS confidence
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.		.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340			.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																											340	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	P	V	E	P	W
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	N	Y	V	R	S	H	D	D	I	G	W	T	F	A	D	E	D	A	A	Y	L	G	I	S	G	Y	D	H	R	Q	F	L	N	R	F	F	V	N	R	F	D	G	S	F	A	R	G	V	P	F	Q	Y	N	P	S	T	G	D	C	R	V	S	G	T	A	A	A	L	V	G	L	A	Q	D	D	P	H	A	V
Template Known Secondary structure					S			S	S		B												T	T															T	T		S	T	T												T	T	T														T	T	T	T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		386	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.
		347	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380													.	.	.	.	.	.	.													.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	Q	T	Y	P	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	M	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R
Query Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	R	I	K	L	L	Y	S	I	A	L	S	T	G	G	L	P	L	I	Y	L	G	D	E	V	G	T	L	N	D	D	D	W	S	Q	D	S	N	K	S	D	D	S	R	W	A	H	R	P	R	Y	N	E	A	L	Y	A	Q	R	N	D	P	S	T	A	A	G	Q	I	Y	Q	D	L	R	H	M	I	A	V	R
Template Known Secondary structure														S	S	S						T	T	G	G	G	T					S	S	G	G	G		T	T	T	T	T		G	G	G	G	G										T	T	T	T		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		466	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.
		403	.	.	.	.				.	.	410	.	.	.	.	.	.	.		.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.											.
Query SS confidence							.	.	.											.
Query Sequence		Q	R	F	A	H	.	.	.	G	V	Q	T	L	F	F	D	H	P	.	N	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	N	G	D	D	G	E	K	T	I	H	L	G	E	N	Y	G	N	K	T	W	R	D	F	L	G	N	R	Q	E	R	V	V	T	D	E	N	G	E	A	T
Query Conservation							.	.	.											.
Alig confidence							.	.	.											.								.	.	.	.	.																																					.	.								.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.																																					.	.								.	.	.	.
Template Sequence		Q	S	N	P	R	F	D	G	G	R	L	V	T	F	N	T	N	N	K	H	I	I	G	Y	I	R	.	.	.	.	.	N	N	A	L	L	A	F	G	N	F	S	E	Y	P	Q	T	V	T	A	H	T	L	Q	A	M	P	F	K	A	H	D	L	I	G	G	K	.	.	T	V	S	L	N	Q	D	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					G	G	G		S	S								S		T	T							.	.	.	.	.	T	T	T								S	S	S						T	T	T	T	T	T	S		S					T	T	T			.	.				S	S	S		.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.																																					.	.								.	.	.	.
Template SS confidence
		546	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.						.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.			.	.	610	.	.	.	.
		479	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	F	C	N	G	G	S	V	S	V	W	V	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	T	L	Q	P	Y	Q	V	M	W	L	E	I
Template Known Secondary structure						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		615	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.