Job Description P26612 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 15 Aligned Residues 417 % Identity 18% Template c1jaeA_ PDB info PDB header:glycosidase Chain: A: PDB Molecule:alpha-amylase; PDBTitle: structure of tenebrio molitor larval alpha-amylase Resolution 1.65 Å

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.		.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.				.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.																										.	.	.
Query SS confidence																											.																										.	.	.
Query Sequence		P	T	L	L	Q	C	F	H	W	Y	Y	P	E	G	G	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	.	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	.	.	.	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D
Query Conservation																											.																										.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.									.																										.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	S	I	V	H	L	F	E	W	K	.	.	.	.	.	.	.	W	N	D	I	A	D	E	C	E	R	F	L	Q	P	Q	G	F	G	G	V	Q	I	S	P	P	N	E	Y	L	V	A	D	G	R	P	W	W	E	R	Y	Q	P	V	S	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	I	N	T	R	S	G	D
Template Known Secondary structure								T	T			.	.	.	.	.	.	.											T	T	T	T	T	T										S		B	B			T	T			G	G	G	G	G	S	B			S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S			T	T
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20								.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.											.	.	.	.	70	.	.	.
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C
Query Conservation
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	S	A	F	T	D	M	T	R	R	C	N	D	A	G	V	R	I	Y	V	D	A	V	I	N	H	M	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	M	N	G	V	G	T	S	G
Template Known Secondary structure															T	T										S	B			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S				B	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	110
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H
Query Conservation
Alig confidence																																																																			.
Template Conservation																																																																			.
Template Sequence		S	S	A	D	H	D	G	M	N	Y	P	A	V	P	Y	G	S	G	D	F	H	S	P	C	E	V	N	N	Y	Q	D	A	D	N	V	R	N	C	E	L	V	G	L	R	D	L	N	Q	G	S	D	Y	V	R	G	V	L	I	D	Y	M	N	H	M	I	.	D	L	G	V	A	G	F	R	V	D	A	A	K	H
Template Known Secondary structure					B	T	T	T	T	B	B	T	T	T	T	B		G	G	G	B					B				T	T								S	B	B	T	T	B		B	B		T	T	S																.		T	T							T	T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																																			.
Template SS confidence
		111	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.		.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.								.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	P	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	.	.	.	.	.	.	.	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	M	T	Q	I	F
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template Conservation																																																			.	.
Template Sequence		M	S	P	G	D	L	S	V	I	F	S	G	L	K	N	L	N	T	D	Y	G	F	A	D	G	A	R	P	F	I	Y	Q	E	V	I	D	L	G	G	E	A	I	S	K	N	E	Y	T	G	.	.	F	G	C	V	L	E	F	Q	F	G	V	S	L	G	N	A	F	Q	G	G	N	Q	L	K	N	L	A	N	W
Template Known Secondary structure		S											T						G	G	G	T			T	T													S	S	S	S			G	G	G	T	T	T	.	.	S	S																T	T	T	S		G	G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.
Template SS confidence
		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.			.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.
		313	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.			.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.																																																	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.																																																	.	.	.	.
Query Sequence		T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	.	.	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	.	.	.	.
Query Conservation																												.	.																																																	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.																																																	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	P	E	W	G	L	L	E	G	L	D	A	V	V	F	V	D	N	H	D	N	Q	R	T	G	G	S	Q	I	L	T	Y	K	N	P	K	P	Y	K	M	A	I	A	F	M	L	A	H	P	Y	G	T	T	R	I	M	S	S	F	D	F	T	D	N	D	Q	G	P	P	Q	D	G	S	G	N	L	I	S	P	G
Template Known Secondary structure		S	G	G	G	T				G	G	G					S			T	T					S		T	T				T	T	S														S		S	S								B			S	S	T	T					B		T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		268	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.
													387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.		.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	M	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	H	G	V	Q	T	L	F	.	F	D	H	P	N	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	N	G	D	D	G	E	K	T	I	H	L	G	E	N	Y	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.												.	.	.	.	.																								.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.																								.	.
Template Sequence		I	N	D	D	N	T	C	S	N	G	Y	V	C	E	H	R	W	R	Q	V	Y	G	M	V	G	F	R	N	A	V	E	G	T	Q	V	E	N	W	W	S	N	D	D	N	Q	I	A	F	S	R	.	.	.	.	.	G	S	Q	G	F	V	A	F	T	N	G	G	D	L	N	Q	N	L	N	T	G	L	P	.	.
Template Known Secondary structure				T	T	S				T	T	B			G	G	G	S													T	T	T										S	S	S							.	.	.	.	.	T	T	T							S	S	S												.	.
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.																								.	.
Template SS confidence
		348	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.						.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
		455	.	.	.	.	460	.	.	.	.								.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	K	T	W	R	D	F	L	G	N	.	.	.	.	.	.	.	R	Q	E	R	V	V	T	D	E	N	G	E	A	T	F	F	C	N	G	G	S	V	S	V	W	V
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	G	T	Y	C	D	V	I	S	G	E	L	S	G	G	S	C	T	G	K	S	V	T	V	G	D	N	G	S	A	D	I	S	L	G	S	A	E	D	D	G	V	L
Template Known Secondary structure		S						T	T	T					T	T			S	S							T	T	S								T	T	S	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		421	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.