Job Description P26612 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 17 Aligned Residues 418 % Identity 20% Template c1gviA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:maltogenic amylase; PDBTitle: thermus maltogenic amylase in complex with beta-cd Resolution 3.3 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	R	N	P	T	L	L	Q	C	F	H	W	Y	Y	P	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.
Template Conservation																																																																										.	.	.
Template Sequence		V	K	D	T	V	W	Y	Q	I	F	P	E	R	F	A	N	G	N	P	A	I	S	P	K	G	A	R	P	W	G	S	E	D	P	T	P	T	S	F	F	G	G	D	L	Q	G	I	I	D	H	L	D	Y	L	A	D	L	G	I	T	G	I	Y	L	T	P	I	F	R	A	P	S	.	.	.	N	H	K	Y	D
Template Known Secondary structure		G	G	T								G	G	G	T				S					S	S			S				S	S				S	S													T								T										B	S		S	S	.	.	.	S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.
Template SS confidence
		132	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.				.	.	.	.	.
		58	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	A	D	Y	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	I	D	P	H	F	G	D	K	E	T	L	K	T	L	V	K	R	C	H	E	K	G	I	R	V	M	L	D	A	V	F	N	H	C	G	.	.	Y	E	F	A	P	F	Q	D	V	L	K	N	G	A	A	S	R	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	B		T	T	T																	T										S	B			.	.	T	T											G	G	G		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		209	210	.	.	.										.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.			250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.
		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	D	W	F	H	I	R	E	F	P	L	Q	T	E	P	R	P	N	Y	D	T	F	A	F	V	P	H	M	P	K	L	N	T	A	H	P	E	V	K	R	Y	L	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	B		B	S	S	S	S				S	S	S		S	B		B	S	S	S		T	T	S	B	B	B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																							268	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
		218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	P	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H
Query Conservation
Alig confidence																																										.																			.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.																			.	.	.	.	.
Template Sequence		D	V	A	T	Y	W	I	R	E	F	D	I	D	G	W	R	L	D	V	A	N	E	I	D	H	Q	F	W	R	E	F	R	Q	A	V	K	A	L	K	P	.	D	V	Y	I	L	G	L	I	W	H	D	A	M	P	W	L	R	G	.	.	.	.	.	D	Q	F	D	A	V	M	N	Y	P	L	A	D	A	A	L
Template Known Secondary structure											S								T	T	G	G	G	S																	T	.	T								S	S			T	T	T	T	T	T	.	.	.	.	.	T	S		S			B
Template Predicted Secondary structure																																										.																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350		.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.						.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
		298	.	300	.	.	.	.	.						.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.
Query Sequence		E	A	S	R	M	G	R	D	.	.	.	.	.	Y	D	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G
Query Conservation										.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.																																																.	.
Template Conservation																																																														.	.
Template Sequence		R	F	F	A	K	E	D	M	S	A	S	E	F	A	D	R	L	M	H	V	L	H	S	Y	P	K	Q	V	N	E	A	A	F	N	L	L	G	S	H	D	T	P	R	L	L	T	V	C	G	G	D	V	R	K	V	K	L	L	F	L	.	.	F	Q	L	T	F	T	G	S	P	C	I	Y	Y	G	D	E	I	G
Template Known Secondary structure					T	S			S														T	T	S							T		B		B	S			S	S	S								T	T											.	.				T	S	S	S						T	T	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.
Template SS confidence
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.			.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.
		373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.						.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.				.	.	410	.	.	.	.	.	.	.			.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.																					.	.	.											.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.																					.	.	.											.	.
Query Sequence		A	H	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	.	.	.	.	.	D	M	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	H	.	.	.	G	V	Q	T	L	F	F	D	H	P	.	.	N	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	N	G	D	D
Query Conservation																	.	.	.	.	.																					.	.	.											.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.																					.	.	.											.	.													.	.	.
Template Conservation																																																																					.	.	.
Template Sequence		M	T	G	G	N	D	P	E	C	R	K	C	M	V	W	D	P	E	K	Q	N	K	E	L	Y	E	H	V	K	Q	L	I	A	L	R	K	Q	Y	R	A	L	R	R	G	D	V	A	F	L	T	A	D	D	E	V	N	H	L	V	Y	A	K	T	D	G	N	E	.	.	.	T	V	M	I	I	I	N	R	S	N
Template Known Secondary structure						S	T	T	G	G	G							T	T	T	S																	T							S	B			B				S	S		T	T									T	T		.	.	.									S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.
Template SS confidence
		463	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.				530	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		443	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	E	K	T	I	H	L	G	E	N	Y	G	N	K	T	W	R	D	F	L	G	N	R	Q	E	R	V	V	T	D	E	N	G	E	A	T	F	F	C	N	G	G	S	V	S	V	W	V	I	E	E
Query Conservation
Alig confidence																													.	.	.
Template Conservation																													.	.	.
Template Sequence		E	A	A	E	I	P	M	P	I	D	A	R	G	K	W	L	V	N	L	L	T	G	E	R	F	A	A	.	.	.	E	A	E	T	L	C	V	S	L	P	P	Y	G	F	V	L	Y	A	V	E	S
Template Known Secondary structure		S										T	T							T	T	T							.	.	.		S	S								T	T
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.
Template SS confidence
		540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.				.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.