Job Description P26612 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 23 Aligned Residues 413 % Identity 21% Template c1ea9D_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: D: PDB Molecule:cyclomaltodextrinase; PDBTitle: cyclomaltodextrinase Resolution 3.2 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	R	N	P	T	L	L	Q	C	F	H	W	Y	Y	P	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.
Template Conservation																																																																										.	.	.
Template Sequence		V	K	D	A	I	F	Y	Q	I	F	P	E	R	F	A	N	G	D	T	R	N	D	P	E	G	T	L	P	W	G	S	A	D	P	T	P	S	C	F	F	G	G	D	L	Q	G	V	I	D	H	L	D	H	L	S	K	L	G	V	N	A	V	Y	F	T	P	L	F	K	A	T	T	.	.	.	N	H	K	Y	D
Template Known Secondary structure		T	T	S								G	G	G	T					S		S		S	S						S	S	S				S	S							S						T		T	T	T	T	T	T	T														S	.	.	.	S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.
Template SS confidence
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.				200	.	.	.	.
		58	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																																	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																																	.	.
Template Sequence		T	E	D	Y	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	I	D	P	Q	F	G	D	K	D	T	L	K	K	L	V	D	L	C	H	E	R	G	I	R	V	L	L	D	A	V	F	N	H	S	G	R	T	F	P	P	F	V	D	V	L	K	N	G	E	K	S	K	Y	K	D	W	F	H	I	R	S	L	P	.	.
Template Known Secondary structure			S				.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	T															T	T	T										S	B			T	T	S										T	T	T		G	G	G	G	G	B		B	S	S	S	S	.	.
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																																	.	.
Template SS confidence
		205	.	.	.	.										210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	V	V	D	G	I	P	T	Y	D	T	F	A	F	E	P	L	M	P	K	L	N	T	E	H	P	D	V	K	E	Y	L	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S	S	S		S	B		B	S	S	S		T	T		B	B	B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
		218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	P	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H
Query Conservation
Alig confidence																																										.																			.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.																			.	.	.	.	.
Template Sequence		K	A	A	E	Y	W	I	R	E	T	G	I	D	G	W	R	L	D	V	A	N	E	V	S	H	Q	F	W	R	E	F	R	R	V	V	K	Q	A	N	P	.	D	A	Y	I	L	G	E	V	W	H	E	S	S	I	W	L	E	G	.	.	.	.	.	D	Q	F	D	A	V	M	N	Y	P	F	T	N	A	V	L
Template Known Secondary structure												T							T	T	G	G	G	S																	T	.	T									S			S	G	G	G	S	S	.	.	.	.	.	S	S		S	S					T	T
Template Predicted Secondary structure																																										.																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.		.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.						.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.						.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.
Query Sequence		E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	.	.	.	.	.	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G
Query Conservation												.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.																																				.	.
Template Conservation																																																				.	.
Template Sequence		D	F	F	I	H	Q	I	A	D	A	E	K	F	S	F	M	L	G	K	Q	L	A	G	Y	P	R	Q	A	S	E	V	M	F	N	L	L	D	S	H	D	T	A	R	L	L	T	Q	A	D	G	.	.	D	K	R	K	M	K	L	A	V	L	F	Q	F	T	Y	F	G	T	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G
Template Known Secondary structure					S	S			S		T	T													S												S	S		T	T	S							T	T	S	.	.															S	S	S						T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.
Template SS confidence
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.			.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.						.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.				.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.			.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.																					.	.	.												.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.																					.	.	.												.	.
Query Sequence		A	H	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	.	.	.	.	.	D	M	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	H	.	.	.	G	V	Q	T	L	F	F	D	H	P	N	.	.	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	N	G	D	D
Query Conservation																	.	.	.	.	.																					.	.	.												.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.																					.	.	.												.	.												.	.	.
Template Conservation																																																																					.	.	.
Template Sequence		L	D	G	G	H	D	P	G	C	R	K	C	M	E	W	D	E	T	K	H	D	K	D	L	F	A	F	Y	Q	T	V	I	R	L	R	Q	A	H	A	A	L	R	T	G	T	F	K	F	L	T	A	E	K	N	S	R	Q	I	A	Y	L	R	E	D	D	Q	D	.	.	.	T	I	L	V	V	M	N	N	D	K
Template Known Secondary structure			S			S	T	T	S	S								T	T	T																				T					S									T	T											T	T		.	.	.										T
Template Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.
Template SS confidence
		460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.				.	.	.	530	.	.	.	.	.	.
		443	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	E	K	T	I	H	L	G	E	N	Y	G	N	K	T	W	R	D	F	L	G	N	R	Q	E	R	V	V	T	D	E	N	G	E	A	T	F	F	C	N	G	G	S	V	S	V	W
Query Conservation
Alig confidence												.	.																.	.	.
Template Conservation												.	.																.	.	.
Template Sequence		A	G	H	T	L	T	L	P	V	R	.	.	H	A	Q	W	T	H	L	W	Q	D	D	V	L	T	A	.	.	.	A	H	G	Q	L	T	V	K	L	P	A	Y	G	F	A	V	L
Template Known Secondary structure		T										.	.	S	S	S						S	S	S					.	.	.				S	S	S							T	T
Template Predicted Secondary structure												.	.																.	.	.
Template SS confidence
		537	.	.	540	.	.	.	.	.	.			.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.				.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.