Job Description P76352 Confidence 88.79% Date Thu Jan 5 12:22:17 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 421 % Identity 10% Template d1pw4a_ SCOP info MFS general substrate transporter MFS general substrate transporter Glycerol-3-phosphate transporter Resolution 3.30

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		23	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.		.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.		.	.	.	.	.	100
Predicted Secondary structure																																																.																											.
Query SS confidence																																																.																											.
Query Sequence		H	G	T	R	W	H	A	K	R	K	S	Y	K	V	L	F	W	R	E	I	T	P	L	A	V	P	I	F	M	E	N	A	C	V	L	L	M	G	V	L	S	T	F	L	V	S	.	W	L	G	K	D	A	M	A	G	V	G	L	A	D	S	F	N	M	V	I	M	A	F	F	A	A	.	I	D	L	G	T	T
Query Conservation																																																.																											.
Alig confidence																																																.																											.			.	.	.	.
Template Conservation																																																																														.	.	.	.
Template Sequence		A	R	L	P	A	A	E	I	D	P	T	Y	R	R	L	R	W	Q	I	F	L	G	I	F	F	G	Y	A	A	Y	Y	L	V	R	K	N	F	A	L	A	M	P	Y	L	V	E	Q	G	F	S	R	G	D	L	G	F	A	L	S	G	I	S	I	A	Y	G	F	S	K	F	I	M	G	S	V	S	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							S																													T	S								T	T	S	S	T	T		S	S																									.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		101	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	V	V	A	F	S	L	G	K	R	D	R	R	R	A	R	V	A	T	R	Q	S	L	V	I	M	T	L	F	A	V	L	L	A	T	L	I	H	H	F	G	E	Q	I	I	D	F	V	A	G	D	A	T	T	E	V	K	A	L	A	L	T	Y	L	E	L	T	V	L	S	Y	P	A	A	A	I	T	L	I	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	R	S	N	P	R	V	F	L	P	A	G	L	I	L	A	A	A	V	M	L	F	M	G	F	V	P	W	A	T	S	S	I	A	V	M	F	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	F	L	C	G	W	F	Q	G	M	G	W	P	P	C	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S																												S	S	S	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
												88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.																.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.
		181	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	G	A	L	R	G	A	G	N	T	K	I	P	L	L	I	N	G	S	L	N	I	L	N	I	I	I	S	G	I	L	I	Y	G	L	F	S	W	P	G	L	G	F	V	G	A	G	L	G	L	T	I	S	R	Y	I	G	A	V	A	I	L	W	V	L	A	I	G	F	N	P	A	L	R	I	S	L	K	S	Y
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	T	M	V	H	W	W	S	Q	K	E	R	G	G	I	V	S	V	W	N	C	A	H	N	V	G	G	G	I	P	P	L	L	F	L	L	G	M	A	W	F	N	D	W	H	A	A	L	Y	M	P	A	F	C	A	I	L	V	A	L	F	A	F	A	M	M	R	D	T	P	Q	S	C	G	L	P	P	I	E	E
Template Known Secondary structure						T	T		T	T	T																		T	S												T			S	T	T		T																					S	S	T	T	T				S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		143	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
		261	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	K	P	L	N	F	S	I	I	W	E	V	M	G	I	G	I	P	A	S	V	E	S	V	L	F	T	S	G	R	L	L	T	Q	M	F	V	A	G	M	G	T	S	V	I	A	G	N	F	I	A	F	S	I	A	A	L	I	N	L	P	G	S	A	L	G	S	A	S	T	I	I	T	G	R	R	L	G	V	G
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Y	K	N	D	T	A	K	Q	I	F	M	Q	Y	V	L	P	N	K	L	L	W	Y	I	A	I	A	N	V	F	V	Y	L	L	R	Y	G	I	L	D	W	S	P	T	Y	L	K	E	V	K	H	F	A	L	D	K	S	S	W	A	Y	F	L	Y	E	Y	A	G	I	P	G	T	L	L	C	G	W	M	S	D	K
Template Known Secondary structure		T						T							T	S	S																													B	T	T	B	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
		341	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	I	A	Q	A	E	I	Q	L	R	H	V	F	W	L	S	T	L	G	L	T	A	I	A	W	L	T	A	P	F	A	G	V	M	A	S	F	Y	T	Q	D	P	Q	V	K	H	V	V	V	I	L	I	W	L	N	A	L	F	M	P	I	W	S	A	S	W	V	L	P	A	G	F	K	G	A	R	D	A	R	Y
Query Conservation
Alig confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	F	R	G	N	R	G	A	T	G	V	F	F	M	T	L	V	T	I	A	T	I	V	Y	W	M	N	P	A	G	N	P	T	V	D	M	I	C	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	V	I	G	F	L	I	Y	G	P	V	M	L	I	G	L	H	A	L	E	L	A	P	K	K	A	A	G	T	A
Template Known Secondary structure		T	S	T	T																				T	T	S			T	T										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T													T	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.												.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
		421	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.		.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.
Query SS confidence																							.
Query Sequence		A	M	W	V	S	M	L	S	M	W	G	C	R	V	V	V	G	Y	V	L	G	.	I	M	L	G	W	G	V	V	G	V	W	M	G	M	F	A	D	W	A	V	R	A	V	L	F	Y	W	R	M	V	T	G	R	W	L	W	K	Y	P	R	P	E
Query Conservation																							.
Alig confidence																							.
Template Conservation
Template Sequence		A	G	F	T	G	L	F	G	Y	L	G	G	S	V	A	A	S	A	I	V	G	Y	T	V	D	F	F	G	W	D	G	G	F	M	V	M	I	G	G	S	I	L	A	V	I	L	L	I	V	V	M	I	G	E	K	R	R	H	E	Q	L	L	Q	E
Template Known Secondary structure																											S	S		S																															G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.