Job Description P76352 Confidence 1.17% Date Thu Jan 5 12:22:17 GMT 2012 Rank 90 Aligned Residues 352 % Identity 13% Template c2xq2A_ PDB info PDB header:transport protein Chain: A: PDB Molecule:sodium/glucose cotransporter; PDBTitle: structure of the k294a mutant of vsglt Resolution 2.73 Å

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		103	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	A	F	S	L	G	K	R	D	R	R	R	A	R	V	A	T	R	Q	S	L	V	I	M	T	L	F	A	V	L	L	A	T	L	I	H	H	F	G	E	Q	I	I	D	F	V	A	G	D	A	T	T	E	V	K	A	L	A	L	T	Y	L	E	L	T	V	L	S	Y	P	A	A	A	I	T	L	I	G	S	G
Query Conservation
Alig confidence																														.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	P	E	F	V	E	K	R	F	N	K	K	L	K	T	I	L	A	V	F	W	I	S	L	Y	I	F	V	.	N	L	T	S	V	L	Y	L	G	G	L	A	L	E	T	I	L	G	I	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	M	Y	S	I	L	G	L	A	L	F	A	L
Template Known Secondary structure										T																			T	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																														.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		114	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.		.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
		183	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.																									.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	L	R	G	A	G	N	T	K	I	P	L	L	I	N	G	S	L	N	I	L	N	I	I	I	S	G	I	L	I	Y	G	L	F	S	W	P	G	L	G	F	V	G	A	G	L	G	L	T	I	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Y	I	G	A
Query Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	Y	S	I	Y	G	G	V	V	W	T	D	V	I	Q	V	F	F	L	V	L	G	G	F	M	T	T	Y	M	A	V	S	F	I	G	G	T	D	G	W	F	A	G	V	S	K	M	V	D	A	A	P	G	H	F	E	M	I	L	D	Q	S	N	P	Q	Y	M	N	L	P	G	I	A	V	L	I	G	G	L	W
Template Known Secondary structure						T	T																														G	G	G														G	G	G	S		S	S			S	S	S	G	G	G	G	T	S		T	T					S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.																						.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	A	I	L	W	V	L	A	I	G	F	N	P	A	L	R	I	S	L	K	S	Y	F	K	P	L	N	F	S	I	I	W	E	V	M	G	I	G	I	P	A	S	V	E	S	V	L	F	T	S	G	R	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	Q	M	F	V
Query Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	A	N	L	Y	Y	W	G	F	N	Q	Y	I	I	Q	R	T	L	A	A	K	S	V	S	E	A	Q	K	G	I	V	F	A	A	F	L	A	L	I	V	P	F	L	V	V	L	P	G	I	A	A	Y	V	I	T	S	D	P	Q	L	M	A	S	L	G	N	L	P	S	A	A	N	A	D	K	A	Y	P	W	L
Template Known Secondary structure									T	T	T		S							T	T	S																T	T	T						T											T														S	T	B	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		258	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.		340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.
Query SS confidence																																												.
Query Sequence		A	G	M	G	T	S	V	I	A	G	N	F	I	A	F	S	I	A	A	L	I	N	L	P	G	S	A	L	G	S	A	S	T	I	I	T	G	R	R	L	G	V	.	G	Q	I	A	Q	A	E	I	Q	L	R	H	V	F	W	L	S	T	L	G	L	T	A	I	A	W	L	T	A	P	F	A	G	V	M	A	S
Query Conservation																																												.
Alig confidence																																												.
Template Conservation
Template Sequence		T	Q	F	L	P	V	G	V	K	G	V	V	F	A	A	L	A	A	A	I	V	S	S	L	A	S	M	L	N	S	T	A	T	I	F	T	M	D	I	Y	K	E	Y	I	S	P	D	S	G	D	H	K	L	V	N	V	G	R	T	A	A	V	V	A	L	I	I	A	A	L	I	A	P	M	L	G	G	I	G	Q
Template Known Secondary structure				T	S																																			T					T		S																										G	G	G	G	G	G		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		343	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.
		377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	Y	T	Q	D	P	Q	V	K	H	V	V	V	I	L	I	W	L	N	A	L	F	M	P	I	W	S	A	S	W	V	L	P	A	G	F	K	G	A	R	D	A	R	Y	A	M	W	V	S	M	L	S	M	W	G	C	R	V	V	V	G	Y	V	L	G	I	M	L	G	W	G	V	V	G	V	W	M	G	M	F
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.
Template Sequence		C	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	Y	I	Q	E	Y	T	G	L	V	S	P	G	I	L	A	V	F	L	L	G	L	F	W	K	K	T	T	S	K	G	A	I	I	G	V	V	A	S	I	P	F	A	L	F	L	K	F	M	P	.	.	L	S	M	P	F	M	D	Q	M	L	Y	T	L	L
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T	T	T															T	T																							S	S	.	.
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.
Template SS confidence
		423	.													.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.			.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.
		457	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	D	W	A	V	R	A	V	L	F	Y	W	R	M	V	T	G	R	W	L	W	K	Y	P	R	P	E	P	Q	K	C	E	K	K	P	V	V	S	E
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	T	M	V	V	I	A	F	T	S	L	S	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	I	N	D	D	D	P	K	G	I	S	V	T	S	S	M	F	V
Template Known Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.			S	S	S	S		T	T						S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		489	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500									.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.