Job Description P17315 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:36:04 GMT 2012 Rank 14 Aligned Residues 607 % Identity 16% Template c3cslB_ PDB info PDB header:membrane protein/heme binding protein Chain: B: PDB Molecule:hasr protein; PDBTitle: structure of the serratia marcescens hemophore receptor hasr in2 complex with its hemophore hasa and heme Resolution 2.70 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		42	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.		.	.	90	.	.	.	.		.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.								.
Query SS confidence																																																.								.
Query Sequence		Q	N	L	K	D	A	P	A	S	I	S	V	I	T	Q	E	D	L	Q	R	K	P	V	Q	N	L	K	D	V	L	K	E	V	P	G	V	Q	L	T	N	E	G	D	N	R	K	.	G	V	S	I	R	G	L	.	D	S	S	Y	T	L	I	L	V	D	G	K	R	V	N	S	R	N	A	V	F	R	H	N	D
Query Conservation																																																.								.
Alig confidence																																																.								.																								.
Template Conservation																																																																																.
Template Sequence		D	W	V	Y	D	E	P	R	S	V	S	V	I	S	R	E	Q	M	D	N	R	P	A	R	H	A	A	D	I	L	E	Q	T	T	G	A	Y	S	S	V	S	Q	Q	D	P	A	L	S	V	N	I	R	G	I	Q	D	Y	G	R	V	N	M	N	I	D	G	M	R	Q	N	F	Q	K	S	G	H	G	Q	.	R
Template Known Secondary structure			G	G	G	G	S	S	S													S			S	S	G	G	G	T	T	T	T	S	T	T							T	T				B					T	T	B		S	G	G	G						T	T									S	S	S	S	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.
Template SS confidence
		114	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.		.
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.							.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	D	L	N	W	I	P	V	D	S	I	E	R	I	E	V	V	R	G	P	M	S	S	L	Y	G	S	D	A	L	G	G	V	V	N	I	I	T	K	K	I	G	Q	K	W	S	.	.	.	.	.	.	G	T	V	T	V	D	T	T	I	Q	E	H	R	D	R	G	D	T	Y	N	G	Q	F	F	T	S	G	P
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	G	T	M	Y	I	D	S	E	L	L	S	G	V	T	I	D	K	G	T	T	G	G	M	G	S	A	G	T	L	G	G	I	A	T	F	N	T	V	S	A	S	D	F	L	A	P	G	K	E	L	G	G	K	L	H	A	S	T	G	D	N	G	T	H	F	I	G	S	G	I	L	A	L	G	N	E	T	G	D
Template Known Secondary structure		S	S		B				S	T	T									S	S			S	T	T		T	T		S	S										G	G	G	T			S	S													S	T	T														S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		193	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.																																															.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	I	D	G	V	L	G	M	K	A	Y	G	S	L	A	K	R	E	K	D	D	P	Q	N	S	T	T	T	D	T	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	P
Query Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	L	L	A	A	S	E	R	H	L	G	D	Y	W	P	G	N	K	G	D	I	G	N	I	R	I	N	N	D	T	G	N	Y	D	R	Y	A	E	S	I	K	N	N	K	I	P	D	T	H	Y	R	M	H	S	R	L	A	K	V	G	W	N	L	P	A	N	Q	R	L	Q	L	S	Y	L	Q	T	Q	T	A	S
Template Known Secondary structure																			B	S				S	S	S	S		S		T	T											T	S			G	G	G																T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	I	E	G	F	S	S	R	D	G	N	V	E	F	A	W	T	P	N	Q	N	H	D	F	T	A	G	Y	G	F	D	R	Q	D	R	D	S	D	S	L	D	K	N	R	L	E	R	Q	N	Y	S	V	S	H	N	G	R	W	D	Y	G	T	S	E	L	K	Y	Y	G	E	K	V	E	N	K	N	P	G	N	S
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		P	I	A	G	T	L	T	N	L	G	T	R	P	P	Y	E	L	G	W	K	R	T	G	Y	T	D	V	M	A	R	N	A	A	F	D	Y	S	L	A	P	E	D	V	D	W	L	D	F	Q	A	K	L	Y	Y	V	D	T	Q	D	D	S	D	T	Y	S	T	S	S	L	L	D	N	G	Y	A	T	R	T	R	L
Template Known Secondary structure							S				S	S	S	S	S																											T	T		T	T																					S		S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		353	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		S	P	I	T	S	E	S	N	T	V	D	G	K	Y	T	L	P	L	T	A	I	N	Q	F	L	T	V	G	G	E	W	R	H	D	K	L	S	D	A	V	N	L	T	G	G	T	S	S	K	T	S	A	S	Q	Y	A	L	F	V	E	D	E	W	R	I	F	E	P	L	A	L	T	T	G	V	R	M	D	D	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence																																																																																	.
Template Conservation
Template Sequence		R	T	Y	G	A	Q	A	Q	N	T	S	R	F	S	L	A	P	G	H	D	F	R	A	N	Y	G	L	E	F	Y	Y	D	K	A	T	S	D	S	S	R	Q	G	M	E	G	V	T	P	A	G	N	R	S	V	A	S	L	F	A	N	L	T	Y	D	Y	D	G	W	L	T	L	E	G	G	L	R	Y	D	R	Y
Template Known Secondary structure																		T	T																					S	S	T	T		T	T	S	S																			T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		433	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.
																																													387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	E	T	Y	G	E	H	W	S	P	R	A	Y	L	V	Y	N	A	T	D	T	V	T	V	K	G	G	W	A	T	A	F	K	A	P	S	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	L	R	G	Q	T	G	L	S	Y	P	D	L	A	K	D	G	Q	R	Y	T	I	D	N	P	C	K	A	L	R	L	T	G	C	S	T	T	T	R	E	D	W	D	V	D	R	D	Q	G	K	L	S	P	T	L	A	V	A	V	R	P	G	V	E	W	L	E	L	Y	T	T	Y	G	K	S	W	R	P	P	A
Template Known Secondary structure															B	S	S	S		B			T	T	S					S	S	G	G	G	T																												S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		513	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.
		424	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	Q	L	S	P	D	W	T	S	N	S	C	R	G	A	C	K	I	V	G	S	P	D	L	K	P	E	T	S	E	S	W	E	L	G	L	Y	Y	M	G	E	E	G	W	L	E	G	V	E	S	S	V	T	V	F	R	N	D	V	K	D	R	I	S	I	S	R	T	S	D	V	N	A	A	P	G	Y	Q	N	F
Query Conservation
Alig confidence																																																																												.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	T	E	T	L	T	N	G	S	A	H	S	S	S	T	Q	Y	P	N	P	F	L	Q	P	E	R	S	R	A	W	E	V	G	F	N	V	Q	Q	P	D	L	W	F	E	G	D	R	L	V	A	K	V	A	Y	F	D	T	K	V	D	N	Y	I	N	L	A	I	D	R	N	K	P	G	L	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									B		S	S	T	T							T	T																			S	S	S	S	T	T																S							S				S	B	S	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		593	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.
		504	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	G	F	E	T	G	A	N	G	R	R	I	P	V	F	S	Y	Y	N	V	N	K	A	R	I	Q	G	V	E	T	E	L	K	I	P	F	N	D	E	W	K	L	S	I	N	Y	T	Y	N	D	G	R	D	V	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																														.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																														.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	V	Q	P	S	I	G	N	A	A	Y	V	N	N	L	S	K	T	R	F	R	G	L	E	Y	Q	L	N	Y	D	.	A	G	V	F	Y	A	D	L	T	Y	T	H	M	I	G	K	N	E	F	C	S	N	K	A	W	L	G	G	R	L	R	Y	G	D	G	S	R	R	G	N	F	Y	V	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.					T	T								S	S															.		S	S																				S	S	T	T			B					S			S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																														.
Template SS confidence
								667	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.		.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.
															559	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.						.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	E	N	K	P	L	S	D	L	P	F	H	T	A	N	G	T	L	D	W	K	P	L	A	L	E	D	W	S	F	Y	V	S	G	H	Y	T	G	Q	K	R	A	D	S	A	T	A	.	.	.	.	.	K	T	P	G	G	Y	T	I	W	N	T	G	A	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.																							.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.
Template Sequence		P	D	A	A	S	N	D	F	V	T	C	D	G	G	T	Q	F	G	S	A	A	Y	L	P	G	D	R	G	S	V	T	L	G	G	R	A	F	D	.	R	K	L	D	A	G	V	T	V	R	F	A	P	G	Y	Q	D	S	S	V	P	S	N	Y	P	Y	L	A	D	W	P	K	Y	T	L	F	D	L	Y	A	S
Template Known Secondary structure								S						T	T				S	G	G	G	S															T	T	.	T																		S	S		T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																								.
Template SS confidence
		740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.		.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.
		621	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.					.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.
Query Sequence		W	Q	V	T	K	D	V	K	L	R	A	G	V	L	N	L	G	D	K	D	L	S	R	D	D	Y	S	.	.	.	.	Y	N	E	D	G	R	R	Y	F	M	A	V	D	Y	R	F
Query Conservation																													.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	K	L	T	D	S	L	T	L	R	G	S	V	E	N	L	T	N	R	A	Y	V	V	S	Y	G	E	T	L	A	N	T	L	G	R	G	R	T	V	Q	G	G	V	E	Y	R	F
Template Known Secondary structure				S	S	S	S								S		T	T		B					T	T			T	T	T							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		819	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.