![]() |
|
![]() |
  | Insertion relative to template |
  | Deletion relative to template |
  | Catalytic residue from the CSA |
  | |
Detailed help on interpreting your alignment |
  |   | 18 | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | L | A | G | C | T | A | Y | D | R | T | . | . | . | . | K | D | Q | F | V | Q | P | V | V | K | D | V | K | K | G | M | S | R | A | Q | V | A | Q | I | A | G | K | P | S | S | E | V | S | M | I | H | A | R | G | T | C | Q | T | Y | I | L | G | Q | R | D | G | K | . | . | . | . | . | A | E | T | Y | F | V | A | L | D |
Template Sequence |   | M | A | G | S | G | I | I | Y | K | Q | P | I | Y | Q | G | N | L | I | K | Q | N | A | V | E | Q | L | Q | V | G | Q | S | K | Q | Q | V | S | A | L | L | G | T | P | S | I | P | D | P | F | H | A | Q | R | . | . | . | W | D | Y | T | S | T | Q | R | V | D | R | L | A | R | T | E | I | K | N | F | T | V | F | F | E |
Template Known Secondary structure |   | T | T | S | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | S | T | T | T | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | S | S | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | |||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | |||
  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 89 | 90 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | D | T | G | H | V | I | N | S | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Sequence |   | N | E | Q | V | V | R | W | E | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Known Secondary structure |   | S | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 78 | . | 80 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |
Download: | Text version | FASTA pairwise alignment | 3D Model in PDB format |
Phyre is for academic use only
Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
  | ||||||||
|
|