Job Description P0AEK0 Confidence 98.47% Date Thu Jan 5 11:23:32 GMT 2012 Rank 29 Aligned Residues 151 % Identity 23% Template c2a1sC_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: C: PDB Molecule:poly(a)-specific ribonuclease parn; PDBTitle: crystal structure of native parn nuclease domain Resolution 2.60 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	20	.	.	.	.	.						.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40											.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	R	I	I	D	T	E	T	C	G	L	Q	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	V	E	I	A	S	V	D	V	I	.	.	.	.	.	D	G	K	I	V	N	P	M	S	H	L	V	R	P	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	P	I	S	P	Q	A	M
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	F	A	I	D	G	E	F	S	G	I	S	D	F	D	T	P	E	E	R	Y	Q	K	L	K	K	H	S	M	D	F	L	L	F	Q	F	G	L	C	T	F	K	Y	D	Y	T	D	S	K	Y	I	T	K	S	F	N	F	Y	V	F	P	K	P	F	N	R	S	S	P	D	V	K	F	V	C	Q	S	S	S	I
Template Known Secondary structure										S		S																	T	T	T	B														T	T	T	T											B						S	S	S	S						B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		24	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.
		49				50	.	.	.	.	.	.	.		.	.	60	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.									.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.									.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	.	.	.	I	H	R	I	T	E	A	M	.	V	A	D	K	P	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation			.	.	.									.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.									.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	F	L	A	S	Q	G	F	D	F	N	K	V	F	R	N	G	I	P	Y	L	N	Q	E	E	E	R	Q	L	R	E	Q	Y	D	P	V	T	I	P	E	D	Q	K	K	F	I	D	Q	V	V	E	K	I	E	D	L	L	Q	S	E	E	N	K	N	L	D	L	E	P	C	T	G	F	Q	R	K	L	I	Y	Q
Template Known Secondary structure						T	T	T								T	T		B		B											T									T	T	T																S		S	S											S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		114	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
																																																								64	.	.	.	.	.	70	.	.		.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	E	D	V	I	P	H	Y	Y	.	G	S	E	W	Y	V	A	H	N	A	S	F	D	R	R	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.
Template Conservation
Template Sequence		T	L	S	W	K	Y	P	K	G	I	H	V	E	T	L	E	T	E	K	K	E	R	Y	I	V	I	S	K	V	D	E	E	E	R	K	R	R	E	Q	Q	K	H	A	K	E	Q	E	E	L	N	D	A	V	G	F	S	R	V	I	H	A	I	A	N	S	G	K	L	V	I	G	H	N	M	L	L	D	V	M	H
Template Known Secondary structure								S	S	S									T	T																																			B	T																	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		216	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
		89	90	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.			.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.											.	130	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	P	G	E	W	I	C	T	M	K	L	A	R	R	.	.	L	W	P	G	I	K	Y	S	N	M	A	L	Y	K	T	R	K	L	N	V	Q	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	G	L	H	H	H	R	A	L
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	V	H	Q	F	Y	C	P	L	P	A	D	L	S	E	F	K	E	M	T	T	C	V	F	P	R	L	L	D	T	K	L	M	A	S	T	Q	P	F	K	D	I	I	N	N	T	S	L	A	E	L	E	K	R	L	K	E	T	P	F	N	P	P	K	V	E	S	A	E	G	F	P	S	Y	Q	L	H	E	A	G
Template Known Secondary structure							T					S	S									T	T	T		S	S										S	T	T	T	T	T	T					S								T	T	S	T	T										T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	D	C	Y	I	T	A	A	L	L	I	D	I	M	N
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Y	D	A	Y	I	T	G	L	C	F	I	S	M	A	N
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		381	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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