Job Description P26218 Confidence 94.48% Date Thu Jan 5 11:42:49 GMT 2012 Rank 4 Aligned Residues 315 % Identity 13% Template d2zfga1 SCOP info Transmembrane beta-barrels Porins Porin Resolution 1.59

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		118	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	V	K	D	E	I	G	F	S	Y	N	G	Y	Y	R	S	G	W	G	T	A	S	H	G	S	P	K	S	W	A	I	G	S	L	G	R	F	G	N	E	Y	S	G	W	F	D	L	Q	L	K	Q	R	V	Y	N	E	N	G	K	R	V	D	A	V	V	M	M	D	G	N	V	G	Q	Q	Y	S	T	G	W	F
Query Conservation
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	N	K	D	G	N	K	V	D	L	Y	G	K	A	V	G	L	H	Y	F	S	K	G	G	E	N	S	Y	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	D	M	T	Y	A	R	L	G	F	K	G	E	T	Q	I	N	S	D	L	T	G	Y	G	Q	W	E	Y	N	F	Q	G	N	N	S	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T	T																				T	T	B	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	S																	S	S	S													S	S	S		.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.									.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		198	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.													.	.	260	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	D	N	A	G	G	E	N	Y	M	Q	F	S	D	M	Y	V	T	T	K	G	F	L	P	F	A	P	E	A	D	F	W	V	G	K	H	G	A	P	K	I	E	.	I	Q	M	L	D	W	K	T	Q	R	T	D	A	A	A	G	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	N	W	K	V	G
Query Conservation																																												.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																		.	.	.	.																					.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																		.	.	.	.
Template Sequence		.	E	G	A	D	A	Q	T	G	N	K	T	R	L	A	F	A	G	.	.	.	.	L	K	Y	A	D	V	G	S	F	D	Y	G	R	N	Y	G	V	V	Y	D	A	L	G	Y	T	D	M	L	P	E	F	G	G	D	T	A	Y	S	D	D	F	F	V	G	R	V	G	G	V	A	T	Y	R	N	S	N	F	F
Template Known Secondary structure		.	S	S	T	T	T	T	T	T										.	.	.	.				T	T	T											T	T					T	T	T				S	S	S			T	T			T	T	S	T	T	S	S											S
Template Predicted Secondary structure		.																		.	.	.	.
Template SS confidence
			71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.					.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	G	K	I	D	I	A	L	V	R	E	D	V	D	D	Y	D	R	S	L	Q	N	K	Q	Q	I	N	T	N	T	I	D	L	R	Y	K	D	I	P	L	W	D	K	A	T	L	M	V	S	G	R	Y	V	T	A	N	E	S	A	S	E	K	D	N	Q	D	N	N	G	Y	Y	D	W	K	D	T	W	M	F	G
Query Conservation
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.																																.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.																																.	.
Template Sequence		G	L	V	D	G	L	N	F	A	V	Q	Y	L	G	K	N	E	R	D	T	A	R	R	S	N	G	D	G	V	G	G	S	I	S	Y	E	.	.	.	.	.	.	Y	E	G	F	G	I	V	G	A	Y	G	A	A	D	R	T	N	L	Q	E	A	Q	P	L	G	N	G	K	K	A	E	.	.	Q	W	A	T	G
Template Known Secondary structure			T	S	T	T											B			S	S	S	T	T		B												.	.	.	.	.	.		T	T																		T	S	S	B				S				.	.
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.																																.	.
Template SS confidence
		146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.							.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.			.	.	.	.	.
		345	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	S	L	T	Q	K	F	D	K	G	G	F	N	E	F	S	F	L	V	A	N	N	S	I	A	S	N	F	G	R	Y	A	G	A	S	P	F	T	T	F	N	G	R	Y	Y	G	D	H	T	G	G	T	A	V	R	L	T	S	Q	G	E	A	Y	I	G	D	H	F	I	V	A	N	A	I	V	Y	S	F	G	N
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	K	Y	D	A	N	N	I	Y	.	.	.	.	.	L	A	A	N	Y	G	E	T	R	N	A	T	P	I	T	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	F	T	N	T	S	G	F	A	N	K	T	Q	D	V	L	L	V	A	Q	Y	Q	F	D	F	G	L	R	P	S	I	A	Y	T	K	S	K	A	K
Template Known Secondary structure							T	T			.	.	.	.	.										S		S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T						S														T	T	S
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		218	.	220	.	.	.	.	.	.						.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.												.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.
		425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	I	Y	S	Y	E	T	G	A	H	S	D	F	E	S	I	R	A	V	V	R	P	A	Y	I	W	D	Q	Y	N	Q	T	G	V	E	L	G	Y	F	T	Q	Q	N	K	D	A	N	S	N	K	F	N	E	S	G
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.
Template Sequence		D	.	.	.	.	V	E	G	I	G	D	V	D	L	V	N	Y	F	E	V	G	A	T	Y	Y	F	N	K	N	M	S	T	Y	V	D	Y	I	I	N	Q	I	D	S	D	N	K	L	G	V	G	S	D	D	T	V
Template Known Secondary structure			.	.	.	.		T	T	T																			T	T														T	T		T	T					B
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.
Template SS confidence
		282					.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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