Job Description P26218 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:49 GMT 2012 Rank 1 Aligned Residues 389 % Identity 28% Template d1af6a_ SCOP info Transmembrane beta-barrels Porins Maltoporin-like Resolution 2.40

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		125	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.					.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.
Query Sequence		F	S	Y	N	G	Y	Y	R	S	G	W	G	T	A	S	H	G	S	P	K	S	W	.	.	.	.	A	I	G	S	L	G	R	F	G	N	E	Y	S	G	W	F	D	L	Q	L	K	Q	R	V	Y	N	E	N	G	K	R	V	D	A	V	V	M	M	D	G	N	V	G	Q	Q	Y	S	T	G	W	F	G	D	N
Query Conservation																								.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.																																											.	.
Template Conservation																																																																						.	.
Template Sequence		V	D	F	H	G	Y	A	R	S	G	I	G	W	T	G	S	G	G	E	Q	Q	C	F	Q	T	T	G	A	Q	S	K	Y	R	L	G	N	E	C	E	T	Y	A	E	L	K	L	G	Q	E	V	W	K	E	G	D	K	S	F	Y	F	D	T	N	V	A	Y	S	V	.	.	A	Q	Q	N	D	W	E	A	T	D
Template Known Secondary structure																T	T	S	S	B							T	T		S					T	T				S															T	T														.	.		S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																						.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.			.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	G	G	E	N	Y	M	Q	F	S	D	M	Y	V	T	T	K	G	F	L	P	F	A	P	E	A	D	F	W	V	G	K	H	G	A	P	K	I	E	I	Q	M	L	D	W	K	T	Q	R	T	D	A	A	A	G	V	G	L	E	N	W	K	V	G	P	G	K	I	D	I	A	L	V	R	E	D	V	D	D	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																													.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																																													.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	P	A	F	R	E	A	N	V	Q	G	K	N	L	I	E	W	L	P	G	S	T	I	W	A	G	K	R	F	Y	Q	R	H	D	V	H	M	I	D	F	Y	Y	W	D	I	.	S	G	P	G	A	G	L	E	N	I	D	V	G	F	G	K	L	S	L	A	A	T	R	S	S	E	A	G	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.												S			T	T	S	T	T											S					G	G	G	T							.													S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																													.
Template SS confidence
								79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.		.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
		281	.	.	.	.	.	.							.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	R	S	L	Q	N	K	.	.	.	.	.	.	Q	Q	I	N	T	N	T	I	D	L	R	Y	K	D	I	P	L	W	D	K	A	T	L	M	V	S	G	R	Y	V	T	A	N	E	S	A	S	E	K	D	N	Q	D	N	N	G	Y	Y	D	W	K	D	T	W	M	F	G	T	S	L	T	Q	K	F	D	K	G
Query Conservation									.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.													.
Template Conservation																																																												.	.	.	.	.													.
Template Sequence		S	S	S	F	A	S	N	N	I	Y	D	Y	T	N	E	T	A	N	D	V	F	D	V	R	L	A	Q	M	E	I	N	P	G	G	T	L	E	L	G	V	D	Y	G	R	A	N	L	R	D	N	Y	R	L	V	D	G	A	S	.	.	.	.	.	K	D	G	W	L	F	T	A	E	H	T	Q	.	S	V	L	K
Template Known Secondary structure			B	S	S			S		G	G	G																					T	T																T	T		B			T	T			.	.	.	.	.													.			T	T
Template Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.													.
Template SS confidence
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.						210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.		.	.	.	.
		355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.		.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.
Query SS confidence																			.
Query Sequence		G	F	N	E	F	S	F	L	V	A	N	N	S	I	A	S	N	.	F	G	R	Y	A	G	A	S	P	F	T	T	F	N	G	R	Y	Y	G	D	H	T	G	G	T	A	V	R	L	T	S	Q	G	E	A	Y	I	G	D	H	F	I	V	A	N	A	I	V	Y	S	F	G	N	D	I	Y	S	Y	E	T	G	A
Query Conservation																			.
Alig confidence																			.																																																					.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	F	N	K	F	V	V	Q	Y	A	T	D	S	M	T	S	Q	G	K	G	L	S	Q	G	S	G	V	A	F	D	N	E	K	F	A	Y	N	I	N	N	N	G	H	M	L	R	I	L	D	H	G	A	I	S	M	G	D	N	W	D	M	M	Y	V	G	M	Y	Q	D	I	.	.	.	.	.	.	N	W	D	N
Template Known Secondary structure													G	G	G	T	T	T		S	S					S						T	T																								T	T	T													.	.	.	.	.	.			T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.							.	.	.	.
		434	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	S	D	F	E	S	I	R	A	V	V	R	P	A	Y	I	W	D	Q	Y	N	Q	T	G	V	E	L	G	Y	F	T	Q	Q	N	K	D	A	N	S	N	K	F	N	E	S	G	Y	K	T	T	L	F	H	T	F	K	V	N	T	S	M	L	T	S	R	P	E	I	R	F	Y	A	T	Y	I	K	A	L	E	N
Query Conservation
Alig confidence																																									.	.	.																			.
Template Conservation																																									.	.	.																			.
Template Sequence		D	N	G	T	K	W	W	T	V	G	I	R	P	M	Y	K	W	T	P	I	M	S	T	V	M	E	I	G	Y	D	N	V	E	S	Q	R	T	G	D	.	.	.	K	N	N	Q	Y	K	I	T	L	A	Q	Q	W	Q	A	G	D	S	.	I	W	S	R	P	A	I	R	V	F	A	T	Y	A	K	W	D	E	K
Template Known Secondary structure		S																S	S	S	S															T	T	T			.	.	.															S	S	S	S	.	T	T		S															S
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.																			.
Template SS confidence
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.				.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.		.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
		514	.	.																						.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	F	T	F	E	D	N	K	D	D	Q	F	A	V	G	A	Q	A	E	I	W	W
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	G	Y	D	Y	T	G	N	A	D	N	N	A	N	F	G	K	A	V	P	A	D	F	N	G	G	S	F	G	R	G	D	S	D	E	W	T	F	G	A	Q	M	E	I	W	W
Template Known Secondary structure								S		T	T	T		T	T	T	T					T	T	G	G	G				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.