Job Description P26218 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:49 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 384 % Identity 22% Template d1a0tp_ SCOP info Transmembrane beta-barrels Porins Maltoporin-like Resolution 2.40

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		123	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.										.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	G	F	S	Y	N	G	Y	Y	R	S	G	W	G	T	A	S	H	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	S	W	A	I	G	S	L	G	R	F	G	N	E	Y	S	G	W	F	D	L	Q	L	K	Q	R	V	Y	N	E	N	G	K	R	V	D	A	V	V	M	M	D	G	N	V	G	Q	Q	Y	S
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	G	F	E	F	H	G	Y	A	R	S	G	V	I	M	N	D	S	G	A	S	T	K	S	G	A	Y	I	T	P	A	G	E	T	G	G	A	I	G	R	L	G	N	Q	A	D	T	Y	V	E	M	N	L	E	H	K	Q	T	L	D	N	G	A	T	T	R	F	K	V	M	V	A	D	G	Q	T	S	Y	N	D
Template Known Secondary structure																		T	T	S	S						T	T		S	G	G	G	G	G	T						T	T				S														T	T	S																	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.				.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.		.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.		.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.																.																													.
Query SS confidence																																.	.	.																.																													.
Query Sequence		T	G	W	F	G	D	N	A	G	G	E	N	Y	M	Q	F	S	D	M	Y	V	T	T	K	G	F	L	P	F	A	.	.	.	P	E	A	D	F	W	V	G	K	H	G	A	P	K	I	.	E	I	Q	M	L	D	W	K	T	Q	R	T	D	A	A	A	G	V	G	L	E	N	W	K	V	G	P	G	.	K	I
Query Conservation																																.	.	.																.																													.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.																		.	.	.																.													.																.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.																																																	.
Template Sequence		W	T	A	S	T	S	D	.	.	.	.	.	.	L	N	V	R	Q	A	F	V	E	L	G	N	L	P	T	F	A	G	P	F	K	G	S	T	L	W	A	G	K	R	F	D	R	D	N	F	D	I	H	W	I	D	S	D	V	V	F	L	.	A	G	T	G	G	G	I	Y	D	V	K	W	N	D	G	L	R	S
Template Known Secondary structure				G	G	G			.	.	.	.	.	.												S		T	T			G	G	G	T	T											T	T					G	G	G	T					B		.													T	T	T
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.																																																	.
Template SS confidence
		151	.	.	.	.	.	.							.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.		.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
		269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.		.	.	340	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.
Query SS confidence																																																																							.
Query Sequence		D	I	A	L	V	R	E	D	V	D	D	Y	D	R	S	L	Q	N	K	Q	Q	I	N	T	N	T	I	D	L	R	Y	K	D	I	P	L	W	D	K	A	T	L	M	V	S	G	R	Y	V	T	A	N	E	S	A	S	E	K	D	N	Q	D	N	N	G	Y	Y	D	W	.	K	D	T	W	M	F	G	T	S	L
Query Conservation																																																																							.
Alig confidence															.	.	.																				.	.	.	.	.	.																													.
Template Conservation															.	.	.																				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	F	S	L	Y	G	R	N	F	G	D	I	D	.	.	.	D	S	S	N	S	V	Q	N	Y	I	L	T	M	N	H	F	A	G	P	.	.	.	.	.	.	L	Q	M	M	V	S	G	L	R	A	K	D	N	D	E	R	K	D	S	N	G	N	L	A	K	G	D	A	A	N	T	G	V	H	A	L	L	G	L
Template Known Secondary structure													T	T	.	.	.		G	G	G														T	T	.	.	.	.	.	.											T	T	G	G	G		B		S	S	S	S	B	S		S	S			S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.																				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.				.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.							.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
		348	.	350	.	.	.	.				.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.
Query SS confidence									.	.	.
Query Sequence		T	Q	K	F	D	K	G	.	.	.	G	F	N	E	F	S	F	L	V	A	N	N	S	I	A	S	N	F	G	R	Y	A	G	A	S	P	F	T	T	F	N	G	R	Y	Y	G	D	H	T	G	G	T	A	V	R	L	T	S	Q	G	E	A	Y	I	G	D	H	F	I	V	A	N	A	I	V	Y	S	F	G	N
Query Conservation									.	.	.
Alig confidence									.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	N	D	S	F	Y	G	L	R	D	G	S	S	K	T	A	L	L	Y	G	H	G	L	G	A	E	V	K	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	D	G	A	L	R	P	G	A	D	T	W	R	I	A	S	Y	G	T	T	P	L	S	E	N	W	S	V	A	P	A	M	L	A	Q	R	S	K
Template Known Secondary structure						S	T	T	S	S														T	T		S		S	B	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T			T	T			T	T														S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.												.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
		425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.				.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.			.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.																					.	.
Query SS confidence																																																		.	.	.																					.	.
Query Sequence		D	I	Y	S	Y	E	T	G	A	H	S	D	F	E	S	I	R	A	V	V	R	P	A	Y	I	W	D	Q	Y	N	Q	T	G	V	E	L	G	Y	F	T	Q	Q	N	K	D	A	N	S	.	.	.	N	K	F	N	E	S	G	Y	K	T	T	L	F	H	T	F	K	V	N	T	.	.	S	M	L	T	S	R	P
Query Conservation																																																		.	.	.																					.	.
Alig confidence				.	.	.	.																																											.	.	.																					.	.		.
Template Conservation				.	.	.	.																																																																					.
Template Sequence		D	R	.	.	.	.	Y	A	D	G	D	S	Y	Q	W	A	T	F	N	L	R	L	I	Q	A	I	N	Q	N	F	A	L	A	Y	E	G	S	Y	Q	Y	M	D	L	K	P	E	G	Y	N	D	R	Q	A	V	N	G	S	F	Y	K	L	T	F	A	P	T	F	K	V	G	S	I	G	D	.	F	F	S	R	P
Template Known Secondary structure		S	S	.	.	.	.	S	S	T	T																S	S	S	S																	T	T	G	G	G																			S	S		T	T		.	T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.																																																																					.
Template SS confidence
		364	.					.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.		.	.	.	.	.
		500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.							.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	I	R	F	Y	A	T	Y	I	K	A	L	E	N	E	.	.	.	.	.	.	L	D	G	F	T	F	E	D	N	K	D	D	Q	F	A	V	G	A	Q	A	E	I	W	W
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	I	R	F	Y	T	S	W	M	D	W	S	K	K	L	N	N	Y	A	S	D	D	A	L	G	S	D	G	F	N	S	G	G	E	W	S	F	G	V	Q	M	E	T	W	F
Template Known Secondary structure														G	G	G	G	G	S		S	S	S	S	T	T	B	T	T	B		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		439	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.