Job Description P0AD65 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:20:07 GMT 2012 Rank 28 Aligned Residues 242 % Identity 21% Template d1nrfa_ SCOP info beta-lactamase/transpeptidase-like beta-lactamase/transpeptidase-like beta-Lactamase/D-ala carboxypeptidase Resolution 2.50

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		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	G	H	D	I	Y	L	T	L	D	L	K	L	Q	Q	Y	I	E	T	L	L	A	G	S	R	A	A	V	V	V	T	D	P	R	T	G	G	V	L	A	L	V	S	T	P	S	Y	D	P	N	L	F	V	D	G	I	S	S	K	D	Y	S	A	L	L	N	D	P	N	T	P	L	V	N	R	A	T	Q	G	V
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.												.	.																			.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.
Template Conservation								.	.	.												.	.																			.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.
Template Sequence		P	G	T	N	V	E	.	.	.	Y	E	D	Y	S	T	F	F	D	K	F	.	.	S	A	S	G	G	F	V	L	F	N	S	N	R	K	K	Y	T	I	.	.	.	.	.	.	Y	N	R	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	S	T	S	.	R
Template Known Secondary structure		S	S					.	.	.										T	T	.	.	T										T	T	T	T					.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	.
Template Predicted Secondary structure								.	.	.												.	.																			.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.
Template SS confidence
		354	.	.	.	.	.				360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370			.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.							.	390	.	.																									.	.	.	.		.
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	P	P	A	S	T	V	K	P	Y	V	A	V	S	A	L	S	A	G	V	I	T	R	N	T	T	L	F	D	P	G	W	W	Q	L	P	G	S	E	K	R	Y	R	D	W	K	K	W	G	H	G	R	L	N	V	T	R	S	L	E	E	S	A	D	T	F	F	Y	Q	V	A	Y	D	M	G	I	D	R	L	S
Query Conservation
Alig confidence																																		.	.	.	.	.									.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.									.	.	.	.
Template Sequence		F	A	P	A	S	T	Y	K	V	F	S	A	L	L	A	L	E	S	G	I	I	T	K	N	D	S	H	M	T	W	D	G	.	.	.	.	.	T	Q	Y	P	Y	K	E	W	.	.	.	.	N	Q	D	Q	D	L	F	S	A	M	S	S	S	T	T	W	Y	F	Q	K	L	D	R	Q	I	G	E	D	H	L	R
Template Known Secondary structure		B			G	G	G	G												T	S	S		S	S				B					.	.	.	.	.				S	S	T	T	T	.	.	.	.	S	S		B									T
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.									.	.	.	.
Template SS confidence
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.						430	.	.	.	.	.	.	.					.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
		406	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	W	M	G	K	F	G	Y	G	H	Y	T	G	I	D	L	A	E	E	R	S	G	N	M	P	T	R	E	W	K	Q	K	R	F	K	K	P	W	Y	Q	G	D	T	I	P	V	G	I	G	Q	G	Y	W	T	A	T	P	I	Q	M	S	K	A	L	M	I	L	I	N	D	G	I	V	K	V	P	H	L	L	M
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	Y	L	K	S	I	H	Y	G	N	E	D	F	S	V	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	Y	W	L	D	G	S	L	Q	I	S	P	L	E	Q	V	N	I	L	K	K	F	Y	D	N	E	F	D	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							T	T		T	T				S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T	T	S	S	S	S		B															T	T	T		.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		469	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.
		486	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	T	A	E	D	G	K	Q	V	P	W	V	Q	P	H	E	P	P	V	G	D	I	H	S	G	Y	W	E	L	A	K	D	G	M	Y	G	V	A	N	R	P	N	G	T	A	H	K	Y	F	A	S	A	P	Y	K	I	A	A	K	S	G	T	A	Q	V	F	G	L	K	A	N	E	T	Y	N	A	H	K	I	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	K	Q	S	N	I	E	T	V	K	D	S	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	L	E	E	S	N	G	R	V	L	S	G	K	T	G	T	S	V	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																							514	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.													.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.
		566	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.			.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.
Query SS confidence																													.	.
Query Sequence		E	R	L	R	D	H	K	L	M	T	A	F	A	P	Y	N	N	P	Q	V	A	V	A	M	I	L	E	.	.	N	G	G	A	G	P	A	V	G	T	L	M	R	Q	I	L	D	H	I	M	L	G	D
Query Conservation																													.	.
Alig confidence																													.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	G	E	L	H	A	G	W	F	I	G	Y	V	E	T	A	D	N	T	F	F	F	A	V	H	I	Q	G	E	K	R	A	A	G	S	S	A	A	E	I	A	L	S	I	L	D	K	K	G	I	Y	P
Template Known Secondary structure		S	S	S													S	S												S		S																	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		546	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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