Job Description P76578 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:21:09 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 877 % Identity 18% Template c3pvmB_ PDB info PDB header:immune system Chain: B: PDB Molecule:cobra venom factor; PDBTitle: structure of complement c5 in complex with cvf Resolution 4.30 Å

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		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	F	M	F	G	P	R	D	L	Y	R	P	G	E	T	V	I	L	N	G	L	L	R	D	A	D	G	K	A	L	P	N	Q	P	I	K	L	D	V	I	K	P	D	G	Q	V	L	R	S	V	V	S	Q	P	E	N	G	L	Y	H	F	T	W	P	L	D	S	N	A	A	T	G	M	W	H	I	R	A	N	T
Query Conservation
Alig confidence																																		.																					.	.	.
Template Conservation																																		.																					.	.	.
Template Sequence		L	F	I	Q	T	D	K	G	I	Y	T	P	G	S	P	V	L	Y	R	V	F	S	M	D	H	N	T	S	K	M	N	K	.	T	V	I	V	E	F	Q	T	P	E	G	I	L	V	S	S	N	S	V	D	.	.	.	L	N	F	F	W	P	Y	N	L	P	D	L	V	S	L	G	T	W	R	I	V	A	K	Y
Template Known Secondary structure							S		S				T	T															S					.									T	T	S										.	.	.	S	S									S	S
Template Predicted Secondary structure																																		.																					.	.	.
Template SS confidence
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.				180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.
		468	.	470		.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500			.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520		.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.
Predicted Secondary structure					.																															.	.																					.
Query SS confidence					.																															.	.																					.
Query Sequence		G	D	N	.	Q	Y	R	M	W	D	F	H	V	E	D	F	M	P	E	R	M	A	L	N	L	T	G	E	K	T	P	L	T	P	.	.	K	D	E	V	K	F	S	V	V	G	Y	Y	L	Y	G	A	P	A	N	G	.	N	T	L	Q	G	Q	L	F	L	R	P	L	R	E	A	V	S	A	L	P	G	F	E
Query Conservation					.																															.	.																					.
Alig confidence					.																															.	.																					.																					.	.	.
Template Conservation																																																																															.	.	.
Template Sequence		E	H	S	P	E	N	Y	T	A	Y	F	D	V	R	K	Y	V	L	P	S	F	E	V	R	L	Q	P	S	E	K	F	F	Y	I	D	G	N	E	N	F	H	V	S	I	T	A	R	Y	L	Y	G	E	E	V	E	G	V	A	F	V	L	F	G	V	K	I	D	D	A	K	K	S	I	P	D	S	L	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T																		S								S	S	S				T	T														T	T	T																T	T						G	G	G		.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Template SS confidence
		204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
		544	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.						.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.			.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.																								.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.																								.	.
Query Sequence		F	G	D	I	A	A	E	N	L	S	R	T	L	D	E	V	Q	L	T	L	D	D	K	G	R	G	E	V	S	T	E	.	.	.	.	.	S	Q	W	K	E	T	H	S	P	L	Q	V	I	F	Q	G	S	L	L	E	S	G	G	.	.	R	P	V	T	R	R	A	E	Q	A	I	W	P	A	D	A	L	P	G
Query Conservation																																	.	.	.	.	.																								.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.																								.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	R	I	P	I	I	D	G	D	G	K	A	T	L	K	R	D	T	F	R	S	R	F	P	N	L	N	E	L	V	G	H	T	L	Y	A	S	V	T	V	M	T	E	S	G	S	D	M	V	V	T	E	Q	S	G	I	H	I	V	A	S	P	Y	Q	I	H
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						B	T	T																						T	T												T	T	S	S														S		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.
		617	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	R	P	Q	F	A	S	K	S	V	Y	D	Y	R	T	D	S	T	V	K	Q	P	I	V	D	E	G	S	N	A	A	F	D	I	V	Y	S	D	A	Q	G	V	K	K	A	V	S	G	L	Q	V	R	L	I	R	E	R	R	D	Y	Y	W	N	W	S	E	D	E	G	W	Q	S	Q	F	D	Q	K	D	L	I
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	T	K	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	Y	F	K	P	G	M	P	Y	E	L	T	V	Y	V	T	N	P	D	G	S	P	A	A	H	V	P	V	V	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	F
Template Known Secondary structure			S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S				T	T	S											T	T	S		B			S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		347	.	.	350																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.																											.	.	.
		697	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	N	E	Q	T	L	D	L	K	A	D	E	T	G	K	V	S	F	P	V	E	W	G	A	Y	R	L	E	V	K	A	P	N	E	A	V	S	S	V	R	F	W	A	G	Y	S	W	Q	D	N	S	D	G	S	G	A	V	R	P	D	R	V	T	L	K	L	D	K	A	S	Y	R	P	G	D	T	I	K	L	H
Query Conservation
Alig confidence																																										.
Template Conservation																																										.
Template Sequence		H	S	M	G	T	T	L	S	D	G	T	A	K	L	I	L	N	I	P	L	N	A	Q	S	L	P	I	T	V	R	T	N	H	G	D	L	P	R	E	R	.	Q	A	T	K	S	M	T	A	I	A	Y	Q	T	Q	G	G	S	G	N	Y	L	H	V	A	I	T	S	T	E	I	K	P	G	D	N	L	P	V	N
Template Known Secondary structure		T							T	T	S										T	T													T	T	S		T	T	T	.	S													G	G	G													S	B		T	T
Template Predicted Secondary structure																																										.
Template SS confidence
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.		.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.
		777	.	.	780	.	.	.	.								.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.			.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Query Sequence		I	A	A	P	T	A	G	K	.	.	.	.	.	.	.	G	Y	A	M	V	E	S	S	E	G	P	L	W	W	Q	E	I	D	V	R	A	Q	G	L	.	.	D	L	T	I	P	V	D	K	T	W	N	R	H	D	L	Y	L	S	T	L	V	V	R	P	G	D	K	S	R	S	A	T	P	K	R	A	V	G	V
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.																									.	.											.																	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.																	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	N	V	K	G	N	A	N	S	L	K	Q	I	K	Y	F	T	Y	L	I	L	N	K	G	K	I	F	K	V	G	R	Q	P	R	R	D	G	Q	N	L	V	T	M	N	L	H	I	T	P	D	L	.	I	P	S	F	R	F	V	A	Y	Y	Q	V	G	N	N	E	.	.	.	.	.	.	.	I	V	A	D	S
Template Known Secondary structure						S						T	T											T	T												T	T		S										G	G	G	.	T	T											T	T	T		.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																					.																	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		464	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.		.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530								.	.	.	.	.
		848	.	850	.	.	.	.	.		.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.																																																																							.
Query SS confidence										.																																																																							.
Query Sequence		L	H	L	P	L	G	D	E	.	N	R	R	L	D	L	A	L	E	T	P	A	K	M	R	P	N	Q	P	L	T	V	K	I	K	A	S	T	K	N	G	E	K	P	K	Q	V	N	V	L	V	S	A	V	D	S	G	V	L	N	I	T	D	Y	V	T	P	D	P	W	Q	A	F	F	G	Q	K	R	Y	G	.
Query Conservation										.																																																																							.
Alig confidence										.										.																			.	.	.	.	.	.	.																																				.
Template Conservation																				.																			.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	W	V	D	V	K	D	T	C	M	G	T	L	V	V	K	G	D	.	N	L	I	Q	M	P	G	A	A	M	K	I	K	L	E	G	D	P	.	.	.	.	.	.	.	G	A	R	V	G	L	V	A	V	D	K	A	V	Y	V	L	N	D	K	Y	K	I	S	Q	A	K	I	W	D	T	I	E	K	S	D	F
Template Known Secondary structure						B					S	S								.				B		T	T											T	.	.	.	.	.	.	.	T																T	T	T	T	S												T	T
Template Predicted Secondary structure																				.																			.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		536	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.		.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.								.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.
																				926	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.						980	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	I	Y	D	I	Y	G	Q	V	I	E	G	Q	G	R	L	A	A	L	R	F	G	G	D	G	D	E	L	K	R	G	G	K	P	P	V	N	H	V	N	I	V	V	Q	Q	A	L	P	V	T	L	N	E	.	.	.	.	.	Q	G	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	C	T	A	G	S	G	Q	N	N	L	G	V	F	E	D	A	G	L	A	L	T	T	S	T	N	L	N	T	K	Q	R	S	A	A	K	C	P	Q	P	A	N	E	D	G	F	I	A	D	S	D	I	I	S	R	S	D	F	P	K	S	W	L	W	L	T	K	D	L	T	E	E	P	N	S	Q	G	I	S	S
Template Known Secondary structure				S	S	B			S	S															T	T	S		B							S	S			S				T	T	S	S			G	G	G				B					S											S				T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		608	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.
		983	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.		.	.	.	1010	.	.	.		.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060
Predicted Secondary structure																										.								.
Query SS confidence																										.								.
Query Sequence		G	S	V	T	L	P	I	G	D	F	N	G	E	L	R	V	M	A	Q	A	W	T	A	D	.	D	F	G	S	N	E	S	.	K	V	I	V	A	A	P	V	I	A	E	L	N	M	P	R	F	M	A	S	G	D	T	S	R	L	T	L	D	I	T	N	L	T	D	K	P	Q	K	L	N	V	A	L	T	A	S
Query Conservation																										.								.
Alig confidence																										.								.
Template Conservation
Template Sequence		K	T	M	S	F	Y	L	R	D	S	I	T	T	W	V	V	L	A	V	S	F	T	P	T	K	G	I	C	V	A	E	P	Y	E	I	R	V	M	K	V	F	F	I	D	L	Q	M	P	Y	S	V	V	K	N	E	Q	V	E	I	R	A	I	L	H	N	Y	V	N	E	D	I	Y	V	R	V	E	L	L	Y	N
Template Known Secondary structure										S		S	S										B	T	T	T	B			B								B			S									S				T	T													S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		774	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.
		1061	.	.	.	.	.	.	.	.	1070					.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.
Query Sequence		G	L	L	E	L	V	S	D	S	P	.	.	.	.	A	A	V	E	L	A	P	G	V	R	T	T	L	F	I	P	V	R	A	L	P	G	Y	G	D	G	E	I	Q	A	T	I	S	G	L	A	L	P	G	E	T	V	A	D	Q	H	K	Q	W	K	I	G	V	R	P	A	F	P	A	Q	T	V	N	Y	G	T
Query Conservation												.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.																						.													.	.	.	.
Template Conservation																																					.													.	.	.	.
Template Sequence		P	A	F	C	S	A	S	T	K	G	Q	R	Y	R	Q	Q	F	P	I	K	A	L	S	S	R	A	V	P	F	V	I	V	P	L	E	.	Q	G	L	H	D	V	E	I	K	A	S	V	.	.	.	.	Q	E	A	L	W	S	D	G	V	R	K	K	L	K	V	V	P	E	G	V	Q	K	S	I	V	T	I	V
Template Known Secondary structure		T	T				S			S	S	S										S	S													S	.													.	.	.	.	S	S	S	S														S	S
Template Predicted Secondary structure																																					.													.	.	.	.
Template SS confidence
		854	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.		.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900					.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.
		1137	.	.	1140								.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.		.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.																			.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.																			.
Query Sequence		A	L	Q	P	.	.	.	.	.	.	.	G	E	T	W	A	I	P	A	D	G	L	Q	N	F	S	P	V	T	.	L	E	G	Q	L	L	L	S	G	K	P	P	L	N	I	A	R	Y	I	K	E	L	K	A	Y	P	Y	G	C	L	E	Q	T	A	S	G	L	F	P	S	L	Y	T	N	A	A	Q	L	Q	A
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.																			.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.																			.															.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	L	D	P	R	A	K	G	V	G	G	T	Q	L	E	V	I	K	A	R	K	L	D	D	R	V	P	D	T	E	I	E	T	K	I	I	I	Q	G	D	P	H	K	D	.	.	.	.	.	L	N	L	D	I	T	I	E	L	P	D	R	E	V	P	I	R	Y	R	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T	T	T	T		S	S	S													S	S		T	T																	.	.	.	.	.										T	T		S	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		929	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.						.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.
		1209	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.			.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.
Query SS confidence																									.	.
Query Sequence		L	G	I	K	G	D	S	D	E	K	R	R	A	S	V	D	I	G	I	S	R	L	L	.	.	Q	M	Q	R	D	N	G	G	F	A	L	W	D	K	N	G	D	E	E	Y	W	L	T	A	Y	V	M	D	F	L	V	R	A	G	E	Q	G	Y	S	V	P	T	D	A	I	N	R	G	N	E	R	L	L	R	Y
Query Conservation																									.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.													.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	Y	E	N	A	L	L	A	R	T	V	E	T	K	L	N	Q	D	I	T	V	T	A	S	G	.	D	G	K	A	T	M	T	I	L	T	F	Y	N	A	Q	L	V	C	N	K	F	H	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	T	S	S								S	S											.	S	S																		S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														1293	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.		.	.	1320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340
		1287	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	Q	D	P	G	M	M	S	I	P	Y	A	D	N	L	K	A	S	K	F	A	V	Q	S	Y	A	A	L	V	L	A	R	Q	Q	K	A	P	L	G	A	L	R	E	I	W	E	H	R	A	D	A	A	S	G	L	P	L	L	Q	L	G	V	A	L	K	T	M	G	D	A	T	R	G	E	E	A	I	A	L	A
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1367	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	K	T	P	R	N	S	D	E	R	I	W	L	G	D	Y	G	S	S	L	R	D	N	A	L	M	L	S	L	L	E	E	N	K	L	L	P	D	E	Q	Y	T	L	L	N	T	L	S	Q	Q	A	F	G	E	R	W	L	S	T	Q	E	S	N	A	L	F	L	A	A	R	T	I	Q	D	L	P	G	K	W	Q
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1447	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1520	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	Q	T	S	F	S	A	E	Q	L	T	G	E	K	A	Q	N	S	N	L	N	S	D	Q	L	V	T	L	Q	V	S	N	S	G	D	Q	P	L	W	L	R	M	D	A	S	G	Y	P	Q	S	A	P	L	P	A	N	N	V	L	Q	I	E	R	H	I	L	G	T	D	G	K	S	K	S	L	D	S	L	R	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	V	S	V	E	N	I	H	L	N	K	G	A	L	M	L	K	I	C	T	R	Y	L	G	E	V	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								S	S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																										1346	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.
		1527	.	.	1530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1550		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1590	.	.	.	.	.	.	.						.	.	1600
Predicted Secondary structure																										.																																																.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.																																																.	.	.	.	.
Query Sequence		G	D	L	V	L	V	W	L	Q	V	K	A	S	N	S	V	P	D	A	L	V	V	D	L	.	L	P	A	G	L	E	L	E	N	Q	N	L	A	N	G	S	A	S	L	E	Q	S	G	G	E	V	Q	N	L	L	N	Q	M	Q	Q	A	S	I	K	H	I	E	F	R	D	D	R	.	.	.	.	.	F	V	A
Query Conservation																										.																																																.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	M	T	I	I	D	I	S	M	L	T	G	F	L	P	D	A	E	D	L	T	R	L	S	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	D	R	Y	I	S	R	Y	E	V	D	N	N	M	A	Q	K	V	A	V	I	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											T	T				B										S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S										T	T			S		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																			1378	.	1380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.																.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1420	.	.	.	.	.
		1601	.	.	.	.	.	.	.	.		1610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1620	.	.	.	.	.	.	.	.		.	1630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1640	.
Predicted Secondary structure											.																				.
Query SS confidence											.																				.
Query Sequence		A	V	A	V	D	E	Y	Q	P	.	V	T	L	V	Y	L	A	R	A	V	T	P	G	T	Y	Q	V	P	Q	.	P	M	V	E	S	M	Y	V	P	Q	W	R	A
Query Conservation											.																				.
Alig confidence											.																				.
Template Conservation
Template Sequence		Y	L	N	K	V	S	H	S	E	D	E	C	L	H	F	K	I	L	K	H	F	E	V	G	F	I	Q	P	G	S	V	K	V	Y	S	Y	Y	N	L	D	E	K	C
Template Known Secondary structure								S	S	S											S				S												T	T	B	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1426	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.