Job Description P76578 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:21:09 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 1242 % Identity 14% Template c3cu7A_ PDB info PDB header:immune system Chain: A: PDB Molecule:complement c5; PDBTitle: human complement component 5 Resolution 3.10 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.										.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	N	R	L	D	I	F	T	Q	S	L	E	N	G	A	A	Q	Q	G	I	E	V	S	L	L	N	E	K	G	Q	T	L	T	Q	A	T	S	D	A	Q	G	H	V	Q	L	E	N	D	K	N	A	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	A	R	K	D	G	Q	T	T	L	L	D	L	K	L	P	A
Query Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.											.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.											.	.	.	.
Template Sequence		G	A	S	E	N	I	V	I	Q	V	Y	G	Y	T	E	A	F	.	D	A	T	I	S	I	K	S	Y	P	.	.	.	.	D	K	K	F	S	Y	S	S	G	H	V	H	L	S	S	E	N	K	F	Q	N	S	A	I	L	T	I	Q	P	K	Q	L	P	G	G	Q	N	P	V	S	Y	V	Y	L	E	V	V	S
Template Known Secondary structure		T													S			B	.									T	T	.	.	.	.						S				B			B		T	T	T	T	T															S	S
Template Predicted Secondary structure																			.											.	.	.	.
Template SS confidence
		34	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50		.	.	.	.	.	.	.	.	.	60					.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.
		371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.		.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																					.
Query SS confidence																																																																					.
Query Sequence		L	D	L	A	E	F	N	I	A	G	A	P	G	Y	S	K	Q	F	F	M	F	G	P	R	D	L	Y	R	P	G	E	T	V	I	L	N	G	L	L	R	D	A	D	G	K	A	L	P	N	Q	P	I	K	L	D	V	I	K	P	D	G	Q	V	L	R	S	V	.	V	S	Q	P	E	N	G	L	Y	H	F	T
Query Conservation																																																																					.
Alig confidence																																																			.																		.
Template Conservation																																																			.
Template Sequence		K	H	F	S	K	S	K	R	M	P	I	T	Y	D	N	G	F	L	F	I	H	T	D	K	P	V	Y	T	P	D	Q	S	V	K	V	R	V	Y	S	L	N	D	D	L	K	P	A	K	R	.	E	T	V	L	T	F	I	D	P	E	G	S	E	V	D	M	V	E	E	I	D	H	I	G	I	I	S	F	P	D
Template Known Secondary structure		S	S														S							S		S				T	T												T	T		S					.									T	T	T											S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																			.
Template SS confidence
		109	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.		.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.
		450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470			.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.			.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.																																	.	.
Query SS confidence																							.	.																																	.	.
Query Sequence		W	P	L	D	S	N	A	A	T	G	M	W	H	I	R	A	N	T	G	D	N	.	.	Q	Y	R	M	W	D	F	H	V	E	D	F	M	P	E	R	M	A	L	N	L	T	G	E	K	T	P	L	T	P	K	D	.	.	E	V	K	F	S	V	V	G	Y	Y	L	Y	G	A	P	A	N	G	N	T	L	Q	G
Query Conservation																							.	.																																	.	.
Alig confidence																							.	.																																	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	K	I	P	S	N	P	R	Y	G	M	W	T	I	K	A	K	Y	K	E	D	F	S	T	T	G	T	A	Y	F	E	V	K	E	Y	V	L	P	H	F	S	V	S	I	E	P	E	Y	N	F	I	G	Y	K	N	F	K	N	F	E	I	T	I	K	A	R	Y	F	Y	N	K	V	V	T	E	A	D	V	Y	I
Template Known Secondary structure						S	S												B	S	S	S																		S	S							S		S				S	T	T	S	S											T	T	T				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.
		526	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.								.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	L	F	L	R	P	L	R	E	A	V	S	A	L	P	G	F	E	F	G	D	I	A	A	E	N	L	S	R	T	L	D	E	V	Q	L	T	L	D	D	K	G	R	G	E	V	S	T	E	S	Q	W	K	.	.	.	.	.	.	.	E	T	H	S	P	L	Q	V	I	F	Q	G	S	L	L	E	S	G	G	R
Query Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	F	G	I	R	E	D	L	K	D	D	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	E	M	M	Q	T	A	M	Q	N	T	M	L	I	N	G	I	A	Q	V	T	F	D	S	E	T	A	V	K	E	L	S	Y	Y	S	L	E	D	L	N	N	K	Y	L	Y	I	A	V	T	V	I	E	S	T	G	G
Template Known Secondary structure							S		S	S		S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S	S			B						T	T	B							T	T	T	T	T	T	T	T	S	S				S	T	T			S											S	S	S
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		268	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.													280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.
		599	600			.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.
Query SS confidence				.	.
Query Sequence		P	V	.	.	T	R	R	A	E	Q	A	I	W	P	A	D	A	L	P	G	I	R	P	Q	F	A	S	K	S	V	Y	D	Y	R	T	D	S	T	V	K	Q	P	I	V	D	E	G	S	N	A	A	F	D	I	V	Y	S	D	A	Q	G	V	K	K	A	V	S	G	L	Q	V	R	L	I	R	E	R	R	D	Y
Query Conservation				.	.
Alig confidence				.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	S	E	E	A	E	I	P	G	I	K	Y	V	L	S	P	Y	K	L	N	L	V	A	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	F	L	K	P	G	I	P	Y	P	I	K	V	Q	V	K	D	S	L	D	Q	L	V	G	G	V	P	V	T	L	N	A	Q	T	I	D	V	N	Q
Template Known Secondary structure															S		S						B	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S				S	S	S											T	T			B			S												T	T	S
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		336	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		677	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.		.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.
Query SS confidence																																																						.
Query Sequence		Y	W	N	W	S	E	D	E	G	W	Q	S	Q	F	D	Q	K	D	L	I	E	N	E	Q	T	L	D	L	K	A	D	E	T	G	K	V	S	F	P	V	E	W	G	A	Y	R	L	E	V	K	A	P	.	N	E	A	V	S	S	V	R	F	W	A	G	Y	S	W	Q	D	N	S	D	G	S	G	A	V	R	P
Query Conservation																																																						.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	D	L	D	P	S	K	S	V	T	R	V	D	D	G	V	A	S	F	V	L	N	L	P	S	G	V	T	V	L	E	F	N	V	K	T	D	A	P	D	L	P	E	E	N	Q	A	R	E	G	Y	R	A	I	A	Y	S	S	L	S	Q	S	Y
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													S	S	S											T	T													T	T	S		G	G	G	S													T	T	S
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		400																.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.
		756	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.						.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.			.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.																						.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.																						.	.
Query Sequence		D	R	V	T	L	K	L	D	K	A	S	Y	R	P	G	D	T	I	K	L	H	I	A	A	P	T	A	.	.	.	.	.	G	K	G	Y	A	M	V	E	S	S	E	G	P	L	W	W	Q	E	I	D	V	.	.	R	A	Q	G	L	D	L	T	I	P	V	D	K	T	W	N	R	H	D	L	Y	L	S	T	L
Query Conservation																													.	.	.	.	.																						.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.																						.	.																.
Template Conservation																																																																								.
Template Sequence		L	Y	I	D	W	T	D	N	H	K	A	L	L	V	G	E	H	L	N	I	I	V	T	P	K	S	P	Y	I	D	K	I	T	H	Y	N	Y	L	I	L	S	K	G	K	I	I	H	F	G	T	R	E	K	F	S	D	A	S	Y	Q	S	I	N	I	P	V	T	Q	N	M	.	V	P	S	S	R	L	L	V	Y
Template Known Secondary structure									S	S	S	S	B		T	T													S														T	T												S	S	S	S										G	G	G	.	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																								.
Template SS confidence
		465	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.		.	.	.	.	.	540	.	.	.
		829	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.		.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.		.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.												.
Query SS confidence																													.												.
Query Sequence		V	V	R	P	G	D	K	S	R	S	A	T	P	K	R	A	V	G	V	L	H	L	P	L	G	D	E	.	N	R	R	L	D	L	A	L	E	T	P	.	A	K	M	R	P	N	Q	P	L	T	V	K	I	K	A	S	T	K	N	G	E	K	P	K	Q	V	N	V	L	V	S	A	V	D	S	G	V	L	N	I
Query Conservation																													.												.
Alig confidence												.	.	.	.														.												.																		.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	I	V	T	G	E	Q	T	A	E	.	.	.	.	L	V	S	D	S	V	W	L	N	I	E	E	K	C	G	N	Q	L	Q	V	H	L	S	P	D	A	D	A	Y	S	P	G	Q	T	V	S	L	N	M	A	T	G	M	.	.	.	.	.	.	.	D	S	W	V	A	L	A	A	V	D	S	A	V	Y	G	V
Template Known Secondary structure							S	S	S			.	.	.	.										B					S	S							S	S			S	S	B		T	T										S	S	.	.	.	.	.	.	.								B			T	T	T	T		S
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		544	.	.	.	.	.	550	.	.	.					.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.								.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.
		907	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	D	Y	V	T	P	D	P	W	Q	A	F	F	G	Q	K	R	Y	G	A	D	I	Y	D	I	Y	G	Q	V	I	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	R	G	A	K	K	P	L	E	R	V	F	Q	F	L	E	K	S	D	L	G	C	G	A	G	G	G	L	N	N	A	N	V	F	H	L	A	G	L	T	F	L	T	N	A	N	A	D	D	S	Q	E	N	D	E	P	C	K	E	I	L	L	Q	K	K	I	E	E	I	A	A	K	Y	K	H	S	V	V	K	K
Template Known Secondary structure		S			T	T		S								T	T	T	T					S	S	S			S	S	S							T	T						S	S	S					S	S	S						S									T	G	G	G			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		613	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.
																																										939	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	G	R	L	A	A	L	R	F	G	G	D	G	D	E	L	K	R	G	G	K	P	P	V	N	H	V	N	I	V	V	Q	Q	A	L	P	V	T	L	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.
Template Conservation																																																																													.	.	.
Template Sequence		C	C	Y	D	G	A	C	V	N	N	D	E	T	C	E	Q	R	A	A	R	I	S	L	G	P	R	C	I	K	A	F	T	E	C	C	V	V	A	S	Q	L	R	A	N	I	S	L	G	R	L	H	M	K	T	L	L	P	V	S	K	P	E	I	R	S	Y	F	P	E	S	W	L	W	E	V	.	.	.	H	L
Template Known Secondary structure					G	G	G	S				S	S								T			S		T	T	T																T	T														T	T					S							B					.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.
Template SS confidence
		698	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.				.	.
		979	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.		.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.
Query SS confidence																																				.
Query Sequence		E	Q	G	E	G	S	V	T	L	P	I	G	D	F	N	G	E	L	R	V	M	A	Q	A	W	T	A	D	D	F	G	S	N	E	.	S	K	V	I	V	A	A	P	V	I	A	E	L	N	M	P	R	F	M	A	S	G	D	T	S	R	L	T	L	D	I	T	N	L	T	D	K	P	Q	K	L	N	V	A	L
Query Conservation																																				.
Alig confidence																																				.
Template Conservation
Template Sequence		V	P	R	R	K	Q	L	Q	F	A	L	P	D	S	L	T	T	W	E	I	Q	G	I	G	I	S	N	T	G	I	C	V	A	D	T	V	K	A	K	V	F	K	D	V	F	L	E	M	N	I	P	Y	S	V	V	R	G	E	Q	I	Q	L	K	G	T	V	Y	N	Y	R	T	S	G	M	Q	F	C	V	K	M
Template Known Secondary structure			S	S										S	S	S												T	T															S									S				T	T													S	S	S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		1058	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.		1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.
Query SS confidence														.
Query Sequence		T	A	S	G	L	L	E	L	V	S	D	S	.	P	A	A	V	E	L	A	P	G	V	R	T	T	L	F	I	P	V	R	A	L	P	G	Y	G	D	G	E	I	Q	A	T	I	S	G	L	A	L	P	G	E	T	V	A	D	Q	H	K	Q	W	K	I	G	V	R	P	A	F	P	A	Q	T	V	N	Y	G	T
Query Conservation														.
Alig confidence														.																							.															.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.															.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	A	V	E	G	I	C	T	S	E	S	P	K	C	V	R	Q	K	V	E	G	S	S	S	H	L	V	T	F	T	V	L	P	L	E	.	I	G	L	H	N	I	N	F	S	L	E	T	W	F	.	.	.	.	.	.	G	K	E	I	L	V	K	T	L	R	V	V	P	E	G	V	K	R	E	S	Y	S	G	V
Template Known Secondary structure					T	T				S	S									B		T	T													S	.	S	S											T	T	.	.	.	.	.	.														S
Template Predicted Secondary structure																																					.															.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.		.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.							.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.
		1137	.	.	1140								.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.		.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.							.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.																			.																	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.																			.																	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	L	Q	P	.	.	.	.	.	.	.	G	E	T	W	A	I	P	A	D	G	L	Q	N	F	S	P	V	T	.	L	E	G	Q	L	L	L	S	G	K	P	P	L	N	I	A	.	.	.	.	.	.	R	Y	I	K	E	L	K	A	Y	P	Y	G	C	L	E	Q	T	A	S	G	L	F	P	S	L	Y	T	N
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.																			.																	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.																			.																	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	L	D	P	R	G	I	Y	G	T	I	S	R	R	K	E	F	P	Y	R	I	P	L	D	L	V	P	K	T	E	I	K	R	I	L	S	V	K	G	L	L	V	G	E	I	L	S	A	V	L	S	Q	E	G	I	N	I	L	T	H	L	P	K	G	S	A	E	A	E	L	M	S	V	V	P	V	F	Y	V	F
Template Known Secondary structure				B	T	T		T	T	T	S		B											T	T	B		T	T											S	S	T	T									S	S	S	S				S	S	S			S		S	S					T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		943	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.
		1203	.	.	.	.	.	.	1210	.	.							.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	A	Q	L	Q	A	L	G	I	K	.	.	.	.	.	.	G	D	S	D	E	K	R	R	A	S	V	D	I	G	I	S	R	L	L	Q	M	Q	R	D	N	G	G	F	A	L	W	D	K	N	G	D	E	E	Y	W	L	T	A	Y	V	M	D	F	L	V	R	A	G	E	Q	G	Y	S	V	P	T	D	A	I
Query Conservation												.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.																																.																										.
Template Conservation																																																	.																										.
Template Sequence		H	Y	L	E	T	G	N	H	W	N	I	F	H	S	D	P	L	I	E	K	Q	K	L	K	K	K	L	K	E	G	M	L	S	I	M	S	Y	R	N	A	D	Y	S	Y	S	V	W	.	K	G	G	S	A	S	T	W	L	T	A	F	A	L	R	V	L	G	Q	V	N	K	Y	V	E	.	Q	N	Q	N	S	I
Template Known Secondary structure							T	T		G	G	G		S	S																				G	G	G	G	B		T	T	S		B		S	S	.	S	S	S																			T	T	S		.
Template Predicted Secondary structure																																																	.																										.
Template SS confidence
		1023	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.		1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.		.	.	.	.	.	1100
		1277	.	.	1280	.	.	.	.	.	.		.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.												.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320	.	.										.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	R	G	N	E	R	L	L	R	Y	.	L	Q	D	P	G	M	M	S	I	P	Y	A	D	N	L	K	A	S	K	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	V	Q	S	Y	A	A	L	V	L	A	R	Q	Q	K	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	G	A	L	R	E	I	W	E	H	R	A
Query Conservation												.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		C	N	S	L	L	W	L	V	E	N	Y	Q	L	D	N	G	S	F	K	E	N	S	Q	Y	Q	P	I	K	L	Q	G	T	L	P	V	E	A	R	E	N	S	L	Y	L	T	A	F	T	V	I	G	I	R	K	A	F	D	I	C	P	L	V	K	I	D	T	A	L	I	K	A	D	N	F	L	L	E	N	T	L
Template Known Secondary structure												S	B		T	T	S		B				S	S								S																								T	G	G	G	S																					S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1101	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180
		1336	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.		.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	A	A	S	G	L	P	L	L	Q	L	G	V	A	L	K	T	M	G	.	D	A	T	R	G	E	E	A	I	A	L	A	L	K	T	P	R	N	S	D	E	R	I	W	L	G	D	Y	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	R	D	N	A	L	M	L	S	L	L	E	E
Query Conservation																					.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	A	Q	S	T	F	T	L	A	I	S	A	Y	A	L	S	L	G	D	K	T	H	P	Q	F	R	S	I	V	S	A	L	K	R	E	A	L	V	K	G	N	P	P	I	Y	R	F	W	K	D	N	L	Q	H	K	D	S	S	V	P	N	T	G	T	A	R	M	V	E	T	T	A	Y	A	L	L	T	S	L	N
Template Known Secondary structure		S		S													T	T	S		T	T																			T	T	T	T	S						S		S	S			S	S				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1181	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260
		1399	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.		.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1470	.	.
Predicted Secondary structure																						.																																																							.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.																																																							.	.	.	.	.
Query Sequence		N	K	L	L	P	D	E	Q	Y	T	L	L	N	T	L	S	Q	Q	A	F	.	G	E	R	W	L	S	T	Q	E	S	N	A	L	F	L	A	A	R	T	I	Q	D	L	P	G	K	W	Q	A	Q	T	S	F	S	A	E	Q	L	T	G	E	K	A	Q	N	S	N	L	N	S	D	Q	L	V	.	.	.	.	.
Query Conservation																						.																																																							.	.	.	.	.
Alig confidence				.																		.																																																							.	.	.	.	.
Template Conservation				.
Template Sequence		L	K	.	D	I	N	Y	V	N	P	V	I	K	W	L	S	E	E	Q	R	Y	G	G	G	F	Y	S	T	Q	D	T	I	N	A	I	E	G	L	T	E	Y	S	L	L	V	K	Q	L	R	L	S	M	D	I	D	V	S	Y	K	H	K	G	A	L	H	N	Y	K	M	T	D	K	N	F	L	G	R	P	V	E
Template Known Secondary structure		T	T	.																S		S	S	S			S	T	T	T	T															S														S	S	S										S	S	S		S
Template Predicted Secondary structure				.
Template SS confidence
		1261	.		.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.
								1473	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1530	.	.	.	.	.	.	.					.	.	1540	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																																																		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																																																																		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	T	L	Q	V	S	N	S	G	D	Q	P	L	W	L	R	M	D	A	S	G	Y	P	Q	S	A	P	L	P	A	N	N	V	L	Q	I	E	R	H	I	L	G	T	D	G	K	S	K	S	L	D	S	L	R	S	G	D	L	V	L	V	W	L	Q	V	K	.	.	.	.	A	S	N	S	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																																																																		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																								.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.
Template Conservation																															.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	L	L	N	D	D	L	I	V	S	T	G	F	G	S	G	L	A	T	V	H	V	T	T	V	V	H	K	T	.	S	T	S	E	E	V	C	S	F	Y	L	K	I	D	T	Q	D	I	Y	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	I	V	A	C	A	S	Y	K	P	S	R	E	E	S	S	S	G
Template Known Secondary structure				S	S	S								S			S												B	S	.			S	S	S			S													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure																															.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.		.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380	.	.	.	.	.	.	.	.													.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.
		1543	.	.	.	.	.	.	1550		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1600	.	.	.	.	.	.	.	.	.		1610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1620
Predicted Secondary structure										.																																																												.
Query SS confidence										.																																																												.
Query Sequence		P	D	A	L	V	V	D	L	.	L	P	A	G	L	E	L	E	N	Q	N	L	A	N	G	S	A	S	L	E	Q	S	G	G	E	V	Q	N	L	L	N	Q	M	Q	Q	A	S	I	K	H	I	E	F	R	D	D	R	F	V	A	A	V	A	V	D	E	Y	Q	P	.	V	T	L	V	Y	L	A	R	A	V	T
Query Conservation										.																																																												.
Alig confidence										.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	S	H	A	V	M	D	I	S	L	P	T	G	I	S	A	N	E	E	D	L	K	A	L	V	E	G	V	D	Q	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	T	D	Y	Q	I	K	D	G	H	V	I	L	Q	L	N	S	I	P	S	S	D	F	L	C	V	R	F	R	I	F	E	L	F
Template Known Secondary structure				S									T	T													S	S	T	T		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	B					T	T							S				S	S	S											S	S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1419	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440	.	.	.	.	.	.	.	.	.																1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.
		1621	.	.	.	.	.	.	.		.	1630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1640	.	.	.
Predicted Secondary structure										.
Query SS confidence										.
Query Sequence		P	G	T	Y	Q	V	P	Q	.	P	M	V	E	S	M	Y	V	P	Q	W	R	A	T	G
Query Conservation										.
Alig confidence										.
Template Conservation
Template Sequence		E	V	G	F	L	S	P	A	T	F	T	V	Y	E	Y	H	R	P	D	K	Q	C	T	M
Template Known Secondary structure				S	S											T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1484	.	.	.	.	.	1490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1500	.	.	.	.	.	.	.