Job Description P76578 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:21:09 GMT 2012 Rank 1 Aligned Residues 1207 % Identity 14% Template c2pn5A_ PDB info PDB header:immune system Chain: A: PDB Molecule:thioester-containing protein i; PDBTitle: crystal structure of tep1r Resolution 2.70 Å

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		292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	G	V	S	A	H	R	Y	H	N	R	L	D	I	F	T	Q	S	L	E	N	G	A	A	Q	Q	G	I	E	V	S	L	L	N	E	K	G	Q	T	L	T	Q	A	T	S	D	A	Q	G	H	V	Q	L	E	N	D	K	N	A	A	L	L	L	A	R	K	D	G	Q	T	T	L	L	D	L	K	L	P	A	L
Query Conservation
Alig confidence																																																														.	.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.	.
Template Sequence		V	G	P	K	F	I	R	A	N	Q	E	Y	T	L	V	I	S	N	F	N	S	Q	L	S	K	V	D	L	L	L	K	L	E	L	S	V	L	N	V	T	K	M	V	D	V	R	R	N	M	N	R	M	I	N	F	N	M	P	E	D	.	.	.	.	L	T	A	G	N	Y	K	I	T	I	D	G	Q	R	G	F
Template Known Secondary structure					S				S	S	S											S	S	S	S											T	T											T	T											S		.	.	.	.			S											S	S
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.					.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		372	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.		.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.		.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.																				.
Query SS confidence																																																	.																				.
Query Sequence		D	L	A	E	F	N	I	A	G	A	P	G	Y	S	K	Q	F	F	M	F	G	P	R	D	L	Y	R	P	G	E	T	V	I	L	N	G	L	L	R	D	A	D	G	K	A	L	P	.	N	Q	P	I	K	L	D	V	I	K	P	D	G	Q	V	L	R	S	V	.	V	S	Q	P	E	N	G	L	Y	H	F	T
Query Conservation																																																	.																				.
Alig confidence																																																	.																				.
Template Conservation
Template Sequence		S	F	H	K	E	A	E	L	V	Y	L	S	K	S	I	S	G	L	I	Q	V	D	K	P	V	F	K	P	G	D	T	V	N	F	R	V	I	V	L	D	T	E	L	K	P	P	A	R	V	K	S	V	Y	V	T	I	R	D	P	Q	R	N	V	I	R	K	W	S	T	A	K	L	Y	A	G	V	F	E	S	D
Template Known Secondary structure													S		S								S		S				T	T												T	T	S	S			S	S											T	T													B	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
		450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	P	L	D	S	N	A	A	T	G	M	W	H	I	R	A	N	T	G	D	N	Q	Y	R	M	W	D	F	H	V	E	D	F	M	P	E	R	M	A	L	N	L	T	G	E	K	T	P	L	T	P	K	D	E	V	K	F	S	V	V	G	Y	Y	L	Y	G	A	P	A	N	G	N	T	L	Q	G	Q	L	F	L
Query Conservation
Alig confidence																																																																									.
Template Conservation																																																																									.
Template Sequence		L	Q	I	A	P	T	P	M	L	G	V	W	N	I	S	V	E	V	E	G	E	E	L	V	S	K	T	F	E	V	K	E	Y	V	L	S	T	F	D	V	Q	V	M	P	S	V	I	P	L	E	E	H	Q	A	V	N	L	T	I	E	A	N	Y	H	F	G	K	P	V	Q	G	.	V	A	K	V	E	L	Y	L
Template Known Secondary structure						S	S													T	T													S												S	S			B	G	G	G												S	S	S		B				.
Template Predicted Secondary structure																																																																									.
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.		.	.	.	240	.	.	.	.
		530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.		.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																					.
Query SS confidence																																																																					.
Query Sequence		R	P	L	R	E	A	V	S	A	L	P	G	F	E	F	G	D	I	A	A	E	N	L	S	R	T	L	D	E	V	Q	L	T	L	D	D	K	G	R	G	E	V	S	T	E	S	Q	W	K	E	T	H	S	P	L	Q	V	I	F	Q	G	S	L	L	E	S	G	.	G	R	P	V	T	R	R	A	E	Q	A	I
Query Conservation																																																																					.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.																						.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Template Sequence		D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	K	L	K	L	K	K	E	L	T	V	Y	G	K	G	Q	V	E	L	R	F	D	.	N	F	A	M	D	A	D	Q	Q	D	V	P	V	K	V	S	F	V	E	Q	Y	T	N	R	T	V	V	K	Q	S	Q	I	T	V
Template Known Secondary structure		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T											S									S	.	S				S	S	S													T	T	T
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Template SS confidence
		245																						.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.		.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
		609	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	P	A	D	A	L	P	G	I	R	P	Q	F	A	S	K	S	V	Y	D	Y	R	T	D	S	T	V	K	Q	P	I	V	D	E	G	S	N	A	A	F	D	I	V	Y	S	D	A	Q	G	V	K	K	A	V	S	G	L	Q	V	R	L	I	R	E	R	R	D	Y	Y	W	N	W	S	E	D	E	G	W	Q	S
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	R	Y	A	Y	R	V	E	L	I	K	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	P	Q	F	R	P	G	L	P	F	K	C	A	L	Q	F	T	H	H	D	G	T	P	A	K	G	I	S	G	K	V	E	V	S	D	V	R	F	E	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S	S	S								S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S	B		T	T	S											T	T	S		B		T	T								G	G	G	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.
		689	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	F	D	Q	K	D	L	I	E	N	E	Q	T	L	D	L	K	A	D	E	T	G	K	V	S	F	P	V	E	W	G	A	Y	R	L	E	V	K	A	P	N	E	A	V	S	S	V	R	F	W	A	G	Y	S	W	Q	D	N	S	D	G	S	G	A	V	R	P	D	R	V	T	L	K	L	D	K	A	S	Y	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S	D	N	D	G	L	I	K	L	E	L	Q	P	S	E	G	T	E	Q	L	S	I	H	F	N	A	V	D	G	F	F	F	Y	E	D	V	N	.	.	.	.	.	.	.	.	K	V	E	T	V	T	D	A	Y	I	K	L	E	L	K	S	P	.	I	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	S										T	T											T	T	S									.	.	.	.	.	.	.	.	B			T	T	T	T									S		.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template SS confidence
															356	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.									.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.		.	.
		769	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.		.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.		.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.																									.
Query SS confidence																.																									.
Query Sequence		P	G	D	T	I	K	L	H	I	A	A	P	T	A	.	G	K	G	Y	A	M	V	E	S	S	E	G	P	L	W	W	Q	E	I	D	V	R	A	Q	.	G	L	D	L	T	I	P	V	D	K	T	W	N	R	H	D	L	Y	L	S	T	L	V	V	R	P	G	D	K	S	R	S	A	T	P	K	R	A	V	G
Query Conservation																.																									.
Alig confidence																.																									.													.															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	N	K	L	M	R	F	M	V	T	C	T	E	R	M	T	F	F	V	Y	Y	V	M	S	K	G	N	I	I	D	A	G	F	M	R	P	N	K	Q	P	K	Y	L	L	Q	L	N	A	T	E	K	M	.	I	P	R	A	K	I	L	I	A	T	V	A	G	R	.	.	.	.	.	.	.	.	T	V	V	Y	D
Template Known Secondary structure		T	T	S													S								S	S	S	S										S	S												G	G	G	.		S											T	T	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																						.															.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		414	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.		.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.									480	.	.	.	.
		847	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	L	H	L	P	L	G	D	E	N	R	R	L	D	L	A	L	E	T	P	A	K	M	R	P	N	Q	P	L	T	V	K	I	K	A	S	T	K	N	G	E	K	P	K	Q	V	N	V	L	V	S	A	V	D	S	G	V	L	N	I	T	D	Y	V	T	P	D	P	W	Q	A	F	F	G	Q	K	R	Y	G	A
Query Conservation
Alig confidence																				.																			.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.																			.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	A	D	L	A	F	Q	E	L	R	N	N	F	D	L	S	I	D	.	E	Q	E	I	K	P	G	R	Q	I	E	L	S	M	S	G	R	P	.	.	.	.	.	.	.	G	A	Y	V	G	L	A	A	Y	D	K	A	L	L	L	F	N	K	N	H	D	L	F	W	E	D	I	G	Q	V	F	D	G	F	H	E
Template Known Secondary structure								G	G	G	S									.	S	S				T	T	S								S		T	.	.	.	.	.	.	.	T																T		S	S												S
Template Predicted Secondary structure																				.																			.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		485	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.		.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520								.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.
		927	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	I	Y	D	I	Y	G	Q	V	I	E	G	Q	G	R	L	A	A	L	R	F	G	G	D	G	D	E	L	K	R	G	G	K	P	P	V	N	H	V	N	I	V	V	Q	Q	A	L	P	V	T	L	N	E	Q	G	E	G	S	V	T	L	P	I	G	D	F	N	G	E	L	R	V	M	A	Q	A	W	T	A	D
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	E	F	D	I	F	H	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	F	A	R	T	L	D	D	I	L	F	D	S	Q	E	S	W	L	W	K	N	V	S	I	G	R	S	G	S	R	K	L	I	E	V	V	P	D	T	T	T	S	W	Y	L	T	G	F	S	I	D	P	V
Template Known Secondary structure			S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T							T	T									B								T	T	T	T										S	S													T	T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		560	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.
			1007	.	.			1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.								1070	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.				.	.																																																													.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.				.	.																																																													.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	D	F	G	.	.	S	N	E	S	K	V	I	V	A	A	P	V	I	A	E	L	N	M	P	R	F	M	A	S	G	D	T	S	R	L	T	L	D	I	T	N	L	T	D	K	P	Q	K	L	N	V	A	L	T	A	S	G	L	L	E	L	V	S	D	S	.	.	.	.	.	.	.	P	A	A	V	E	L	A
Query Conservation		.				.	.																																																													.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.				.	.																																																													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	G	L	G	I	I	K	K	P	I	Q	F	T	T	V	Q	P	F	Y	I	V	E	N	L	P	Y	S	I	K	R	G	E	A	V	V	L	Q	F	T	L	F	N	N	L	G	A	E	Y	I	A	D	V	T	L	Y	N	V	A	N	Q	T	E	F	V	G	R	P	N	T	D	L	S	Y	T	K	S	V	S	V	P
Template Known Secondary structure		T						S	S									S									S				T	T													S	S	S											G	G	G					T	T	S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		649	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.
		1077	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.					.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.
Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.
Query SS confidence																																																																			.	.	.	.
Query Sequence		P	G	V	R	T	T	L	F	I	P	V	R	A	L	P	G	Y	G	D	G	E	I	Q	A	T	I	S	G	L	A	L	P	G	E	T	V	A	D	Q	H	K	Q	W	K	I	G	V	R	P	A	F	P	A	Q	T	V	N	Y	G	T	A	L	Q	P	G	.	.	.	.	E	T	W	A	I	P	A	D	G	L	Q
Query Conservation																																																																			.	.	.	.
Alig confidence																	.													.	.	.	.																																		.	.	.	.
Template Conservation																	.													.	.	.	.
Template Sequence		P	K	V	G	V	P	I	S	F	L	I	K	A	R	K	.	L	G	E	M	A	V	R	V	K	A	S	I	.	.	.	.	M	L	G	H	E	T	D	A	L	E	K	V	I	R	V	M	P	E	S	L	V	Q	P	R	M	D	T	R	F	F	C	F	D	D	H	K	N	Q	T	F	P	I	N	L	D	I	N	K
Template Known Secondary structure		T	T													S	.	S											S	.	.	.	.	S	T	T	S	S													S	S
Template Predicted Secondary structure																	.													.	.	.	.
Template SS confidence
		729	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.		.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.					.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.
		1153	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	F	S	P	V	T	L	E	G	Q	L	L	L	S	G	K	P	P	L	N	I	A	R	Y	I	K	E	L	K	A	Y	P	Y	G	C	L	E	Q	T	A	S	G	L	F	P	S	L	Y	T	N	A	A	Q	L	Q	A	L	G	I	K	G	D	S	D	E	K	R	R	A	S	V	D	I	G	I	S	R	L	L	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	A	D	S	G	S	T	K	I	E	F	R	L	N	P	N	L	L	T	T	V	I	K	N	L	D	H	L	L	G	V	P	T	G	C	G	E	Q	N	M	V	K	F	V	P	N	I	L	V	L	D	Y	L	H	A	I	G	S	K	E	Q	H	L	I	D	K	A	T	N	L	L	R	Q	G	Y	Q	N	Q	M	R
Template Known Secondary structure		S	S			S										S	S	T	T						T	T	T				S	S				S	T	T	G	G	G	G	G	T													T	T																						G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		804	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.
		1233	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.							.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																								.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	Q	R	D	N	G	G	F	A	L	W	D	K	N	G	D	E	E	Y	W	L	T	A	Y	V	M	D	F	L	V	R	A	G	E	Q	G	Y	S	V	P	T	D	A	I	N	R	G	N	E	R	L	L	R	Y	L	Q	D	P	G	M	M	S	I	P	Y	A	D	N	L	K	.	.	.	.	.	.	A	S	K	F
Query Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.																																																											.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.
Template Sequence		Y	R	Q	T	D	G	S	F	G	L	W	.	E	T	T	N	G	S	V	F	L	T	A	F	V	G	T	S	M	Q	T	A	V	K	Y	I	S	D	I	D	A	A	M	V	E	K	A	L	D	W	L	A	S	K	Q	H	F	S	G	R	F	D	K	A	G	A	E	Y	H	K	E	M	Q	G	G	L	R	N	G	V
Template Known Secondary structure		G	B		T	T	S		B		S	S	.	S	S	S																		T	T	T		S		S															T			T	T	S						S			S								S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure													.
Template SS confidence
		884	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.		.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.
		1307	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320	.	.								.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	V	Q	S	Y	A	A	L	V	L	A	R	Q	Q	K	A	.	.	.	.	.	.	.	P	L	G	A	L	R	E	I	W	E	H	R	A	D	A	A	S	G	L	P	L	L	Q	L	G	V	A	L	K	T	M	G	D	A	T	R	G	E	E	A	I	A	L	A	L	K	T	P	R	N	S	D	E	R	I	W	L
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	L	T	S	Y	V	L	M	A	L	L	E	N	D	I	A	K	A	K	H	A	E	V	I	Q	K	G	M	T	Y	L	S	N	Q	F	G	S	I	N	N	A	Y	D	L	S	I	A	T	Y	A	M	M	L	N	G	H	T	M	K	E	E	A	L	N	K	L	I	D	M	S	F	I	D	A	D	K	N	E	R	F
Template Known Secondary structure													T								T															G	G	G																		T		T	T											T					T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		963	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.
		1380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.		.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.
Query SS confidence																																									.
Query Sequence		G	D	Y	G	S	S	L	R	D	N	A	L	M	L	S	L	L	E	E	N	K	L	L	P	D	E	Q	Y	T	L	L	N	T	L	S	Q	Q	A	F	.	G	E	R	W	L	S	T	Q	E	S	N	A	L	F	L	A	A	R	T	I	Q	D	L	P	G	K	W	Q	A	Q	T	S	F	S	A	E	Q	L	T	G
Query Conservation																																									.
Alig confidence																								.																	.
Template Conservation																								.
Template Sequence		W	N	T	T	N	P	I	E	T	T	A	Y	A	L	L	S	F	V	M	A	E	K	.	Y	T	D	G	I	P	V	M	N	W	L	V	N	Q	R	Y	V	T	G	S	F	P	S	T	Q	D	T	F	V	G	L	K	A	L	T	K	M	A	E	K	I	S	P	S	R	N	D	Y	T	V	Q	L	K	Y	K	K	S
Template Known Secondary structure				S	S	S															T	T		.													T	T			T	T	S	S		S	S																			S		S											T	T
Template Predicted Secondary structure																								.
Template SS confidence
		1043	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.		.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.
		1459	1460	.	.	.	.	.	.	.											.	.	1470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1520	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	K	A	Q	N	S	N	L	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	D	Q	L	V	T	L	Q	V	S	N	S	G	D	Q	P	L	W	L	R	M	D	A	S	G	Y	P	Q	S	A	P	L	P	A	N	N	V	L	Q	I	E	R	H	I	L	G	T	D	G	K	S	K	S	L	D	S	L	R	S	G	D
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	K	Y	F	K	I	N	S	E	Q	I	D	V	E	N	F	V	D	I	P	E	D	T	K	K	L	E	I	N	V	G	G	I	G	F	G	L	L	E	V	V	Y	Q	F	N	L	N	L	V	N	F	E	N	R	F	Q	L	D	L	E	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	N	T	G	S	D	Y
Template Known Secondary structure										S	S			S									S		S																														S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1122	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.													.	.	.	.	.	.	.
		1529	1530	.	.	.	.	.	.	.	.					.	1540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1550		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1600	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.													.
Query SS confidence												.	.	.	.													.
Query Sequence		L	V	L	V	W	L	Q	V	K	A	.	.	.	.	S	N	S	V	P	D	A	L	V	V	D	L	.	L	P	A	G	L	E	L	E	N	Q	N	L	A	N	G	S	A	S	L	E	Q	S	G	G	E	V	Q	N	L	L	N	Q	M	Q	Q	A	S	I	K	H	I	E	F	R	D	D	R	F	V	A	A	V	A
Query Conservation												.	.	.	.													.
Alig confidence												.	.	.	.													.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	L	R	L	K	V	C	A	S	Y	I	P	Q	L	T	D	R	R	S	N	M	A	L	I	E	V	T	L	P	S	G	Y	V	V	D	R	N	P	I	S	E	Q	T	K	V	N	P	I	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	T	E	I	R	Y	G	G	T	S	V	V	L	Y	Y	D
Template Known Secondary structure														B	T	T	B		S		S	S									T	T										S			S	S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T	T	T							S
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.																.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.
		1604	.	.	.	.	.	1610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1620	.	.	.	.	.	.	.	.		.	1630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1640	.	.
Predicted Secondary structure																											.
Query SS confidence																											.
Query Sequence		V	D	E	Y	Q	P	V	T	L	V	Y	L	A	R	A	V	T	P	G	T	Y	Q	V	P	Q	.	P	M	V	E	S	M	Y	V	P	Q	W	R	A	T
Query Conservation																											.
Alig confidence																											.
Template Conservation
Template Sequence		N	M	G	S	E	R	N	C	F	T	L	T	A	Y	R	R	F	K	V	A	L	K	R	P	A	Y	V	V	V	Y	D	Y	Y	N	T	N	L	N	A	I
Template Known Secondary structure					S	S												S				S											T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1255	.	.	.	.	1260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.