![]() |
|
![]() |
  | Insertion relative to template |
  | Deletion relative to template |
  | Catalytic residue from the CSA |
  | |
Detailed help on interpreting your alignment |
  |   | 1020 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 1030 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 1040 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 1050 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 1060 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 1070 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 1080 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 1090 | . | . | . | ||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | P | V | I | A | E | L | N | M | P | R | F | M | A | S | G | D | T | S | R | L | T | L | D | I | T | N | L | T | D | K | P | Q | K | . | . | . | L | N | V | A | L | T | A | S | G | L | L | E | L | V | S | D | S | P | A | A | V | E | L | A | P | G | V | R | T | T | L | F | I | P | V | R | A | L | P | G | Y | . | . | . |
Template Sequence |   | D | L | P | I | T | L | S | . | K | E | T | P | F | E | G | E | E | I | T | V | S | A | R | V | T | N | R | G | A | A | E | A | H | N | V | P | V | A | V | Y | L | G | N | P | A | Q | G | G | V | E | I | G | R | D | T | I | S | R | I | P | V | G | G | T | G | L | A | R | V | Q | W | K | A | T | R | K | L | A | G | R |
Template Known Secondary structure |   | S | ![]() | ![]() | . | T | T | S | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | S | B | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | T | T | T | B | S | B | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 2 | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | |
  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 1094 | . | . | . | . | . | 1100 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Secondary structure |   | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | . | . | . | G | D | G | E | I | Q | A | T | I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Sequence |   | A | A | N | P | G | V | P | V | Y | A | V | V | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Known Secondary structure |   | S | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 81 | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |
Download: | Text version |
No model constructed - rank, confidence too low
Phyre is for academic use only
Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
  | ||||||||
|
|