Job Description P76398 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:22:39 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 677 % Identity 15% Template c3aqpB_ PDB info PDB header:membrane protein Chain: B: PDB Molecule:probable secdf protein-export membrane protein; PDBTitle: crystal structure of secdf, a translocon-associated membrane protein,2 from thermus thrmophilus Resolution 3.30 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		95	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	G	A	S	V	I	T	L	Q	F	Q	L	T	L	P	L	D	V	A	E	Q	E	V	Q	A	A	I	N	A	A	T	N	L	L	P	S	D	L	P	N	P	P	V	Y	S	K	V	N	P	A	D	P	P	I	M	T	L	A	V	T	S	T	A	M	P	M	T	Q	V	E	D	M	V	E	T	R	V	A	Q	K
Query Conservation
Alig confidence																																		.	.								.																					.	.
Template Conservation																																		.	.								.																					.	.
Template Sequence		K	G	G	L	R	I	V	L	E	A	D	V	E	N	P	T	L	D	D	L	E	K	A	R	T	V	L	E	N	R	I	N	.	.	A	L	G	V	A	E	P	.	L	I	Q	I	Q	G	Q	K	R	I	V	V	E	L	P	G	L	S	Q	A	.	.	D	Q	D	R	A	L	K	L	I	G	Q	R	A	V	L	E
Template Known Secondary structure		T											S	S	S																			.	.					S	S		.						T	T	T													.	.											S
Template Predicted Secondary structure																																		.	.								.																					.	.
Template SS confidence
		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.			.	.	.	.	.	.	.		.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.			.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.
		175	.	.	.			.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
Predicted Secondary structure						.	.
Query SS confidence						.	.
Query Sequence		I	S	Q	I	.	.	S	G	V	G	L	V	T	L	S	G	G	Q	R	P	A	V	R	V	K	L	N	A	Q	A	I	A	A	L	G	L	T	S	E	T	V	R	T	A	I	T	G	A	N	V	N	S	A	K	G	S	L	D	G	P	S	R	A	V	T	L	S	A	N	D	Q	M	Q	S	A	E	E	Y	R	Q
Query Conservation						.	.
Alig confidence						.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	R	I	V	K	E	G	A	T	G	T	T	V	A	Q	I	N	Q	A	L	R	E	N	P	R	L	N	R	E	E	L	E	K	D	L	I	K	P	E	D	L	G	P	P	L	L	T	G	A	D	L	A	D	A	R	A	V	F	D	Q	F	G	R	P	Q	V	S	L	T	F	T	P	E	G	A	K	K	F	E	E
Template Known Secondary structure									T	T		B												S	S											B				S	S					S			S												T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		115	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.
		253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	I	I	A	Y	Q	N	G	A	P	I	R	L	G	D	V	A	T	V	E	Q	G	A	E	N	S	W	L	G	A	W	A	N	K	E	Q	A	I	V	M	N	V	Q	R	Q	P	G	A	N	I	I	S	T	A	D	S	I	R	Q	M	L	P	Q	L	T	E	S	L	P	K	S	V	K	V	T	V	L	S	D	R
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Template Conservation										.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Template Sequence		V	T	R	Q	N	I	G	K	.	.	.	R	L	A	I	V	L	D	G	R	V	Y	T	A	P	V	I	R	Q	A	I	T	G	G	Q	A	V	I	.	.	.	.	.	.	.	E	G	L	S	S	V	E	E	A	S	E	I	A	L	V	L	R	S	.	.	G	S	L	P	V	P	L	K	V	A	E	I	R	A	I
Template Known Secondary structure						T	T	T	S	.	.	.							T	T									S	S				S	S					.	.	.	.	.	.	.						S	S												.	.			S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Template SS confidence
		195	.	.	.	.	200	.	.				.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.								230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.			.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.
		333	.	.	.		.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
Predicted Secondary structure						.
Query SS confidence						.
Query Sequence		T	T	N	I	.	R	A	S	V	D	D	T	Q	F	E	L	M	M	A	I	A	L	V	V	M	I	I	Y	L	F	L	R	N	I	P	A	T	I	I	P	G	V	A	V	P	L	S	L	I	G	T	F	A	V	M	V	F	L	D	F	S	I	N	N	L	T	L	M	A	L	T	I	A	T	G	F	V	V	D	D
Query Conservation						.
Alig confidence						.																												.
Template Conservation																																		.
Template Sequence		G	P	T	L	G	Q	D	A	I	Q	A	G	I	R	S	A	L	I	G	T	L	A	I	F	L	L	I	F	A	Y	Y	G	.	P	H	L	G	L	V	A	S	L	G	L	L	Y	T	S	A	L	I	L	G	L	L	S	G	L	G	A	T	L	T	L	P	G	I	A	G	L	V	L	T	L	G	A	A	V	D	G
Template Known Secondary structure																																	T	.
Template Predicted Secondary structure																																		.
Template SS confidence
		263	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.		.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	I	V	V	I	E	N	I	S	R	Y	I	E	K	G	E	K	P	L	A	A	A	L	K	G	A	G	E	I	G	F	T	I	I	S	L	T	F	S	L	I	A	V	L	I	P	L	L	F	M	G	D	I	V	G	R	L	F	R	E	F	A	I	T	L	A	V	A	I	L	I	S	A	V	V	S	L	T	L	T
Query Conservation
Alig confidence																																																								.	.	.
Template Conservation																																																								.	.	.
Template Sequence		N	V	L	S	F	E	R	I	K	E	E	L	R	A	G	K	K	L	R	Q	A	I	P	E	G	F	R	H	S	T	L	T	I	M	D	V	N	I	A	H	L	L	A	A	A	A	L	Y	Q	Y	A	T	G	P	.	.	.	V	R	G	F	A	V	I	L	A	I	G	V	V	A	S	V	F	S	N	L	V	F	S
Template Known Secondary structure															T	T																																			T			T		.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.
Template SS confidence
		342	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.				.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.
		492	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	M	M	C	A	R	M	L	S	Q	E	S	L	R	K	Q	N	R	F	S	R	A	S	E	K	M	F	D	R	I	I	A	A	Y	G	R	G	L	A	K	V	L	N	H	P	W	L	T	L	S	V	A	L	S	T	L	L	L	S	V	L	L	W	V	F	I	P	K	G	F	F	P	V	Q	D	N	G	I	I	Q
Query Conservation
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.
Template Sequence		R	H	L	L	E	R	L	A	D	R	G	E	I	R	P	P	M	W	L	V	D	P	R	F	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	M	G	P	A	R	Y	V	T	A	A	T	L	L	L	A	A	L	A	A	G	V	V	F	A	K	G	F	N	Y	S	I	D	F	T	G	G	.	T	A
Template Known Secondary structure												T														S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T																							T											.
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.
Template SS confidence
		419	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.																.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480		.	.
		572	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	T	L	Q	A	P	Q	S	S	S	F	A	N	M	A	Q	R	Q	R	Q	V	A	D	V	I	L	Q	D	P	A	V	Q	S	L	T	S	F	V	G	V	D	G	T	N	P	S	L	N	S	A	R	L	Q	I	N	L	K	P	L	D	E	R	D	D	R	V	Q	K	V	I	A	R	L	Q	T	A	V	D	K	V
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	T	L	R	A	E	P	N	V	E	V	E	T	L	R	R	F	L	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								T	T												T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		483	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.
		652	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	G	V	D	L	F	L	Q	P	T	Q	D	L	T	I	D	T	Q	V	S	R	T	Q	Y	Q	F	T	L	Q	A	T	S	L	D	A	L	S	T	W	V	P	Q	L	M	E	K	L	Q	Q	L	P	Q	L	S	D	V	S	S	D	W	Q	D	K	G	L	V	A	Y	V	N	V	D	R	D	S	A	S	R	L	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	K	G	F	P	G	K	E	A	V	I	T	Q	V	Y	R	E	F	L	V	K	L	P	P	L	S	D	E	R	R	L	E	L	E	R	L	F	A	S	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	T	T	S		S	S	S															S																		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									503	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.
		732	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	S	M	A	D	V	D	N	A	L	Y	N	A	F	G	Q	R	L	I	S	T	I	Y	T	Q	A	N	Q	Y	R	V	V	L	E	H	N	T	E	N	T	P	G	L	A	A	L	D	T	I	R	L	T	S	S	D	G	G	V	V	P	L	S	S	I	A	K	I	E	Q	R	F	A	P	L	S	I	N	H	L	D
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		812	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	F	P	V	T	T	I	S	F	N	V	P	D	N	Y	S	L	G	D	A	V	Q	A	I	M	D	T	E	K	T	L	N	L	P	V	D	I	T	T	Q	F	Q	G	S	T	L	A	F	Q	S	A	L	G	S	T	V	W	L	I	V	A	A	V	V	A	M	Y	I	V	L	G	I	L	Y	E	S	F	I	H	P
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	T	V	L	A	S	E	T	V	G	P	A	I	G	E	E	L	R	R	N	A	V	M	A	V	L	V	G	L	G	L	I	L	L	Y	V	A	F	R	F	.	D	W	T	F	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S																																							S	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.
Template SS confidence
																																			549	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.		590	.	.	.	.
		892	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.		.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970
Predicted Secondary structure																																																											.
Query SS confidence																																																											.
Query Sequence		I	T	I	L	S	T	L	P	T	A	G	V	G	A	L	L	A	L	L	I	A	G	S	E	L	D	V	I	A	I	I	G	I	I	L	L	I	G	I	V	K	K	N	A	I	M	M	I	D	F	A	L	A	A	E	R	E	.	Q	G	M	S	P	R	E	A	I	Y	Q	A	C	L	L	R	F	R	P	I	L	M
Query Conservation																																																											.
Alig confidence																																																											.
Template Conservation
Template Sequence		V	A	S	I	L	A	V	A	H	D	V	A	I	V	A	G	M	Y	S	L	L	G	L	E	F	S	I	P	T	I	A	A	L	L	T	I	V	G	Y	S	I	N	D	S	I	V	V	S	D	R	I	R	E	N	Q	K	L	L	R	H	L	P	Y	A	E	L	V	N	R	S	I	N	Q	T	L	S	R	T	V	M
Template Known Secondary structure																							T																																					S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		595	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.
		971	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	T	L	A	A	L	L	G	A	L	P	L	M	L	S	T	G	V	G	A	E	L	R	R	P	L	G	I	G	M	V	G	G	L	I	V	S	Q	V	L	T	L	F	T	T	P	V	I	Y	L	L	F	D	R	L
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.
Template Conservation																					.	.	.
Template Sequence		T	S	L	T	T	L	L	P	I	L	A	L	L	F	L	G	G	S	V	.	.	.	L	R	D	F	A	L	A	I	F	V	G	I	F	V	G	T	Y	S	S	I	Y	V	V	S	A	L	V	V	A	W	K	N	R
Template Known Secondary structure																					.	.	.
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.
Template SS confidence
		675	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.				.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.