Job Description P77304 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:27:31 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 423 % Identity 11% Template d1pw4a_ SCOP info MFS general substrate transporter MFS general substrate transporter Glycerol-3-phosphate transporter Resolution 3.30

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	S	T	A	N	Q	K	P	T	E	S	V	S	L	N	A	F	K	Q	P	K	A	F	Y	L	I	F	S	I	E	L	W	E	R	F	G	Y	Y	G	L	Q	G	I	M	A	V	Y	L	V	K	Q	L	G	M	S	E	A	D	S	I	T	L	F	S	S	F	S	A	L	V	Y	G	L	V	A	I	G	G	W	L
Query Conservation
Alig confidence																																																			.
Template Conservation																																																			.
Template Sequence		A	P	H	K	A	R	L	P	A	A	E	I	D	P	T	Y	R	R	L	R	W	Q	I	F	L	G	I	F	F	G	Y	A	A	Y	Y	L	V	R	K	N	F	A	L	A	M	P	Y	L	V	.	E	Q	G	F	S	R	G	D	L	G	F	A	L	S	G	I	S	I	A	Y	G	F	S	K	F	I	M	G	S	V
Template Known Secondary structure											S																													T	S								T	T	.	S	S	T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure																																																			.
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.		.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.				110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.
Query Sequence		G	D	K	V	L	G	T	K	R	V	I	M	L	G	A	I	V	L	A	I	G	Y	A	L	V	A	W	S	G	.	.	.	H	D	A	G	I	V	Y	M	G	M	A	A	I	A	V	G	N	G	L	F	K	A	N	P	S	S	L	L	S	T	C	Y	E	K	N	D	P	R	L	D	G	A	F	T	M	Y	Y	M
Query Conservation																															.	.	.
Alig confidence						.																									.	.	.																																						.	.
Template Conservation						.																																																																	.	.
Template Sequence		S	D	R	S	.	N	P	R	V	F	L	P	A	G	L	I	L	A	A	A	V	M	L	F	M	G	F	V	P	W	A	T	S	S	I	A	V	M	F	V	L	L	F	L	C	G	W	F	Q	G	M	G	W	P	P	C	G	R	T	M	V	H	W	W	S	Q	K	E	R	.	.	G	G	I	V	S	V	W	N	C
Template Known Secondary structure					S	.																												S	S	S	S																T										T	T		T	T	T			.	.
Template Predicted Secondary structure						.																																																																	.	.
Template SS confidence
		87	.	.	90		.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.			.	.	.	.	.	160	.	.	.
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.		.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.
Query SS confidence																				.
Query Sequence		S	V	N	I	G	S	F	F	S	M	I	A	T	P	W	L	A	A	.	K	Y	G	W	S	V	A	F	A	L	S	V	V	G	L	L	I	T	I	V	N	F	A	F	C	Q	R	W	V	K	Q	Y	G	S	K	P	D	F	E	P	I	N	Y	R	N	L	L	L	T	I	I	G	V	V	A	L	I	A	I	A	T
Query Conservation																				.
Alig confidence																				.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	H	N	V	G	G	G	I	P	P	L	L	F	L	L	G	M	A	W	F	N	D	W	H	A	A	L	Y	M	P	A	F	C	A	I	L	V	A	L	F	A	F	A	M	M	R	D	T	P	Q	S	C	G	L	P	P	I	E	E	Y	K	N	D	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								T	S												T			S	T	T		T																					S	S	T	T	T				S		T	T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	L	L	H	N	Q	E	V	A	R	M	A	L	G	V	V	A	F	G	I	V	V	I	F	G	K	E	A	F	A	M	K	G	A	A	R	R	K	M	I	V	A	F	I	L	M	L	E	A	I	I	F	F	V	L	Y	S	Q	M	P	T	S	L	N	F	F	A	I	R	N	V	E	H	S	I	L	G	L	A	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	K	Q	I	F	M	Q	Y	V	L	P	N	K	L	L	W	Y	I	A	I	A	N	V	F	V	Y	L	L	R	Y	G	I	L	D	W	S	P	T	Y	L	K	E	V	K	H	F	A	L	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T							T	S	S																													B	T	T	B	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																	241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	P	E	Q	Y	Q	A	L	N	P	F	W	I	I	I	G	S	P	I	L	A	A	I	Y	N	K	M	G	D	T	L	P	M	P	T	K	F	A	I	G	M	V	M	C	S	G	A	F	L	I	L	P	L	G	A	K	F	A	S	D	A	G	I	V	S	V	S	W	L	V	A	S	Y	G	L	Q	S	I	G	E
Query Conservation
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	S	S	W	A	Y	F	L	Y	E	Y	A	G	I	P	G	T	L	L	C	G	W	M	S	D	K	V	F	R	G	N	R	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	T	G	V	F	F	M	T	L	V	T	I	A	T	I	V	Y	W	M	N	P	A	G	N	P	T	V	D	M	I	C	M	I	V	I	G	F	L	I
Template Known Secondary structure																												T	S	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.																		T	T	S			T	T
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.									.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.
Query SS confidence																																			.
Query Sequence		L	M	I	S	G	L	G	L	A	M	V	A	Q	L	V	P	Q	R	L	M	G	F	I	M	G	S	W	F	L	T	T	A	G	.	A	N	L	I	G	G	Y	V	A	G	M	M	A	V	P	D	N	V	T	D	P	L	M	S	L	E	V	Y	G	R	V	F	L	Q	I	G	V	A	T	A	V	I	A	V	L	M
Query Conservation																																			.
Alig confidence																																			.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	G	P	V	M	L	I	G	L	H	A	L	E	L	A	P	K	K	A	A	G	T	A	A	G	F	T	G	L	F	G	Y	L	G	G	S	V	A	A	S	A	I	V	G	Y	T	V	D	F	F	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	D	G	G	F	M	V	M	I	G	G	S	I	L	A	V	I	L	L
Template Known Secondary structure		T													T	S		T	T																															S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.											.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
		476	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	T	A	P	K	L	H	R	M	T	Q	D	D	A	A	D
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		I	V	V	M	I	G	E	K	R	R	H	E	Q	L	L	Q	E
Template Known Secondary structure														G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		432	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.