Job Description P76116 Confidence 99.33% Date Wed Jan 25 15:21:05 GMT 2012 Rank 115 Aligned Residues 280 % Identity 20% Template d1w6sa_ SCOP info 8-bladed beta-propeller Quinoprotein alcohol dehydrogenase-like Quinoprotein alcohol dehydrogenase-like Resolution 1.2

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		49	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.					.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.													.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																				.	.	.	.													.	.	.	.	.
Query Sequence		S	Q	Q	E	N	A	L	W	L	A	T	S	Q	S	R	K	L	D	K	G	G	V	V	Y	R	L	D	P	V	T	L	E	V	T	Q	A	I	H	N	D	L	K	P	F	G	A	T	I	N	N	.	.	.	.	T	T	Q	T	L	W	F	G	N	T	V	N	.	.	.	.	.	S	A	V	T	A	I	D	A	K
Query Conservation																																																				.	.	.	.													.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.													.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	K	T	P	A	L	I	L	K	T	Q	L	.	.	.	.	.	.	.	D	G	N	V	A	A	L	N	A	E	T	G	E	T	V	W	K	V	E	N	S	D	I	K	V	G	S	T	L	T	I	A	P	Y	V	V	K	D	K	V	I	I	G	S	S	G	A	E	L	G	V	R	G	Y	L	T	A	Y	D	V	K
Template Known Secondary structure		S	S	S									T	.	.	.	.	.	.	.	T	S							T	T	T												G	G	G	T		B			S						T	T							B		G	G	G	T										T	T
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		118	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.								130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	G	E	V	K	G	R	L	V	L	D	D	R	K	R	T	E	E	V	R	P	L	Q	P	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	V	A	D	D	A	T	N	T	V	Y	I	S	G	I	G	K	E	S	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	G	E	Q	V	W	R	A	Y	A	T	G	P	D	K	D	L	L	L	A	S	D	F	N	I	K	N	P	H	Y	G	Q	K	G	L	G	T	G	T	W	E	G	D	A	W	K	I	G	G	G	T	N	W	G	W	Y	A	Y	D	P	G	T	N	L	I	Y	F	G	T	G	N	P	A	P	W	N	E	T	M	R
Template Known Secondary structure		T									S	S	S						T	B		T	T	T	T	T	T		G	G	G			T	T					T	S	S	T	T	G	G	G	G							S						T	T	T	T										S		S		G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		191	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270
										165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.											.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.				.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	V	I	W	V	V	D	G	G	N	I	K	L	K	T	A	I	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	T	G	K	M	S	T	G	L	A	L	D	S	E	G	K	R	.	.	.	L	Y	T	T	N	A	D	G	E	L	I	T	I	D	T	A	D	N	K	I	L	S	R	K	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	G	D	N	K	W	T	M	T	I	F	G	R	D	A	D	T	G	E	A	K	F	G	Y	Q	K	T	P	H	D	E	W	D	Y	A	G	V	N	V	M	M	L	S	E	Q	K	D	K	D	G	K	A	R	K	L	L	T	H	P	D	R	N	G	I	V	Y	T	L	D	R	T	D	G	A	L	V	S	A	N	K
Template Known Secondary structure			S			T	T	S	S							T	T	T									S	S	T	T		S	S																T	T	S											T	T	S							T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		271	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	L	D	D	G	K	E	H	F	F	I	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	S	L	D	T	A	R	Q	R	A	F	I	T	D	S	K	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	D	D	T	V	N	V	F	K	S	V	D	L	K	T	G	Q	P	V	R	D	P	E	Y	G	T	R	M	D	H	L	A	K	D	I	C	P	S	A	M	G	Y	H	N	Q	G	H	D	S	Y	D	P	K	R	E	L	F	F	M	G	I	N	H	I	C	M	D	W	E	P	F	M	L	P	Y	K	A	G	Q	F
Template Known Secondary structure		S	S	T	T			S						T	T	T							G	G	G				T	T							S	S		T	T		S	S		S		B					T	T	T	T																						T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		351	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430
																								253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.		.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E	V	L	V	V	D	T	R	N	G	N	I	L	A	K	V	A	A	P	E	S	L	A	.	V	L	F	N	P	A	R	N	E	A	Y	V	T	H	R	Q	A	G	K	V	S	V	I	D	A	K	S	Y	K	V	V	K	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.														.
Template Conservation																																																														.
Template Sequence		F	V	G	A	T	L	N	M	Y	P	G	P	K	G	D	R	Q	N	Y	E	G	L	G	Q	I	K	A	Y	N	A	I	T	G	D	Y	K	W	E	K	M	E	R	F	A	V	W	G	G	T	M	A	T	A	G	D	L	V	F	Y	G	.	T	L	D	G	Y	L	K	A	R	D	S	D	T	G	D	L	L	W	K
Template Known Secondary structure													T	T	S	B	T	T	T	T	B										T	T	T										S	S				S	B					T	T	T						.		T	T	S							T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																														.
Template SS confidence
		431	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490		.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		310	.	.	.	.	.	.	.	.			.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.
Query SS confidence											.	.
Query Sequence		F	D	T	P	T	H	P	N	S	.	.	L	A	L	S	A	D	G	K	T	L	Y	V	S	V	K	Q	K	S	T
Query Conservation											.	.
Alig confidence											.	.								.
Template Conservation																				.
Template Sequence		F	K	I	P	S	G	A	I	G	Y	P	M	T	Y	T	H	K	G	.	T	Q	Y	V	A	I	Y	Y	G	V	G
Template Known Secondary structure					S	S				S								T	T	.
Template Predicted Secondary structure																				.
Template SS confidence
		510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.		.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions