Job Description P76116 Confidence 99.46% Date Wed Jan 25 15:21:05 GMT 2012 Rank 96 Aligned Residues 288 % Identity 19% Template d1kb0a2 SCOP info 8-bladed beta-propeller Quinoprotein alcohol dehydrogenase-like Quinoprotein alcohol dehydrogenase-like Resolution 1.44

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		52	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.											.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.
Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	N	A	L	W	L	A	T	S	Q	S	R	K	L	D	K	G	G	V	V	Y	R	L	D	P	V	T	L	E	V	T	Q	A	I	H	N	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	K	P	F	G	A	T	I	N	N	T	T	Q	T	L	W	F	G	N	T	V	N	S	A	V	T	A	I	D	A	K	T	G
Query Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.																																																		.
Template Sequence		D	G	I	M	Y	V	S	A	S	.	.	.	.	.	.	.	W	S	V	V	H	A	I	D	T	R	T	G	N	R	I	W	T	Y	D	P	Q	I	D	R	S	T	G	F	K	G	C	C	D	V	V	N	R	G	V	A	L	W	K	G	K	V	Y	V	G	.	A	W	D	G	R	L	I	A	L	D	A	A	T	G
Template Known Secondary structure		T	T							G	.	.	.	.	.	.	.	G	G							T	T	T	T												G	G	G	G	G	G	S	S	S		S									T	T						.		T	T	S							T	T	T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.																																																		.
Template SS confidence
		77	.	.	80	.	.	.	.	.								.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.		.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.
		122	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.					.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	V	K	G	R	L	V	L	D	D	R	K	R	T	E	E	V	R	P	L	Q	P	R	E	L	V	A	D	D	A	T	N	T	V	Y	I	S	G	I	G	K	.	.	.	.	E	S	V	I	W	V	V	D	G	G	N	I	K	L	K	T	A	I	Q	N	T	G	K	M	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																											.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.													.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.
Template Sequence		K	E	V	W	H	Q	N	T	F	E	G	Q	K	G	S	L	T	I	T	G	A	P	R	V	.	.	.	.	.	F	K	G	K	V	I	I	G	N	G	G	A	E	Y	G	V	R	G	Y	I	T	A	Y	D	A	E	T	G	E	R	K	W	R	W	F	S	V	P	G	D	P	S	K	P	F	E	D	E	S	M	K
Template Known Secondary structure									T	T	T	T			S	S		B			S					.	.	.	.	.		T	T							B		T	T	T			B								T	T	T									S	S				T	T	S			S	S
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.
Template SS confidence
		149	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.						.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
																								188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	L	A	L	D	S	E	G	K	R	L	Y	T	T	N	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	L	I	T	I	D	T	A	D	N	K	I	L	S	R	K	K	L	L	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	A	A	R	T	W	D	P	S	G	K	W	W	E	A	G	G	G	G	T	M	W	D	S	M	T	F	D	A	E	L	N	T	M	Y	V	G	T	G	N	G	S	P	W	S	H	K	V	R	S	P	K	G	G	D	N	L	Y	L	A	S	I	V	A	L	D	P	D	T	G	K	Y	K	W	H	Y	Q	E	T	P
Template Known Secondary structure					T	T	S		G	G	G													S						T	T	T	T											S	S						S	T	T					T	T	T	T							T	T	T									S	S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
		227								.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	.	.	.	.	.	.	.	G	K	E	H	F	F	I	N	I	S	L	D	T	A	R	Q	R	A	F	I	T	D	S	K	A	A	E	V	L	V	V	D	T	R	N	G	N	I	L	A	K	V	A	A	P	E	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	D	N	W	D	Y	T	S	T	Q	P	M	I	L	A	D	I	K	I	A	G	K	P	R	K	V	I	L	H	A	P	K	N	G	F	F	F	V	L	D	R	T	N	G	K	F	I	S	A	K	N	F	V	P	V	N	W	A	S	G	Y	D	K	H	G	K	P	I	G	I	A	A	A	R	D	G	S	K	P	Q
Template Known Secondary structure		T			S						S										T	T											T	T	S							T	T	T									S	S			S	S						T	T	S						G	G	G	G		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
														275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	300
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	V	L	F	N	P	A	R	N	E	A	Y	V	T	H	R	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	V	S	V	I	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	A	V	P	G	P	Y	G	A	H	N	W	H	P	M	S	F	N	P	Q	T	G	L	V	Y	L	P	A	Q	N	V	P	V	N	L	M	D	D	K	K	W	E	F	N	Q	A	G	P	G	K	P	Q	S	G	T	G	W	N	T	A	K	F	F	N	A	E	P	P	K	S	K	P	F	G	R	L	L	A	W	D
Template Known Secondary structure				S	S		T	T		S	S		S	S						T	T	T	T																	T	T			T	T				T	T	S	T	T	G	G	G	T									S	S				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.
		301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	K	S	Y	K	V	V	K	T	F	D	T	P	T	H	P	N	S	L	A	L	S	A	D	G	K	T	L	Y	V	S	V	K	Q	K	S	T	K	Q	Q	E	A	T	Q	P	D	D	V	I	R	I	A	L
Query Conservation
Alig confidence																															.
Template Conservation																															.
Template Sequence		P	V	A	Q	K	A	A	W	S	V	E	H	V	S	P	W	N	G	G	T	L	T	T	A	G	N	V	V	F	.	Q	G	T	A	D	G	R	L	V	A	Y	H	A	A	T	G	E	K	L	E	A	P	T
Template Known Secondary structure		T	T	T	T									S	S	S									T	T	T				.				T	T	S							T	T	T			B
Template Predicted Secondary structure																															.
Template SS confidence
		464	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.		.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low