Job Description P76116 Confidence 99.38% Date Wed Jan 25 15:21:05 GMT 2012 Rank 111 Aligned Residues 282 % Identity 20% Template c1yiqA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:quinohemoprotein alcohol dehydrogenase; PDBTitle: molecular cloning and structural analysis of2 quinohemoprotein alcohol dehydrogenase adhiig from3 pseudomonas putida hk5. compariison to the other4 quinohemoprotein alcohol dehydrogenase adhiib found in the5 same microorganism. Resolution 2.20 Å

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		52	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.													.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	N	A	L	W	L	A	T	S	Q	S	R	K	L	D	K	G	G	V	V	Y	R	L	D	P	V	T	L	E	V	T	Q	A	I	H	N	D	L	K	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	G	A	T	I	N	N	T	T	Q	T	L	W	F	G	N	T	V	N	S	A	V	T	A	I	D	A	K
Query Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.									.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.																																										.	.									.
Template Sequence		D	G	V	M	Y	T	T	G	P	.	.	.	.	.	.	.	F	S	V	V	Y	A	L	D	A	R	D	G	R	L	I	W	K	Y	D	P	Q	S	D	R	H	R	A	G	E	A	C	C	D	A	V	N	R	G	V	A	V	.	.	W	K	G	K	V	Y	V	G	.	V	L	D	G	R	L	E	A	I	D	A	K
Template Known Secondary structure		T	T							G	.	.	.	.	.	.	.	G	G							T	T	T													G	G	G	G	G	G		T	T		S								.	.		T	T						.		T	T	S							T	T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.																																										.	.									.
Template SS confidence
		70	.	.	.	.	.	.	.	.								.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.			120	.	.	.	.	.	.	.		.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.					.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.
Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																													.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	G	E	V	K	G	R	L	V	L	D	D	R	K	R	T	E	E	V	R	P	L	Q	P	R	E	L	V	A	D	D	A	T	N	T	V	Y	I	S	G	I	G	K	.	.	.	.	E	S	V	I	W	V	V	D	G	G	N	I	K	L	K	T	A	I	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																													.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.													.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.
Template Sequence		T	G	Q	R	A	W	S	V	D	T	R	A	D	H	K	R	S	Y	T	I	T	G	A	P	R	V	.	.	.	.	.	V	N	G	K	V	V	I	G	N	G	G	A	E	F	G	V	R	G	Y	V	T	A	Y	D	A	E	T	G	K	E	A	W	R	F	Y	T	V	P	G	D	P	K	L	P	P	E	G	K	G
Template Known Secondary structure		T											S		T	T	S			B			S					.	.	.	.	.		T	T							B		T	T	T			B								T	T	T									S	S				T	T	S				S
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.
Template SS confidence
		140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.						.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
																			182	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	T	G	K	M	S	T	G	L	A	L	D	S	E	G	K	R	L	Y	T	T	N	A	D	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	I	T	I	D	T	A	D	N	K	I	L	S	R	K	K	L	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	E	I	A	A	K	T	W	F	G	D	A	Y	V	E	Q	G	G	G	G	T	A	W	D	S	F	A	Y	D	P	E	L	N	L	L	Y	I	G	V	G	N	G	S	L	W	D	P	K	W	R	S	Q	A	K	G	D	N	L	F	L	S	S	I	V	A	V	N	A	D	T	G	E	Y	V	W	H	Y	Q	T	T
Template Known Secondary structure							T	T			S	S	T												S						T	T	T	T											S	S							T	T		S			T	T	T	T							T	T	T									S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
		226	.								.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	D	.	.	.	.	.	.	.	G	K	E	H	F	F	I	N	I	S	L	D	T	A	R	Q	R	A	F	I	T	D	S	K	A	A	E	V	L	V	V	D	T	R	N	G	N	I	L	A	K	V	A	A	P	E	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	G	D	A	W	D	Y	T	A	T	Q	H	M	I	L	A	E	L	P	I	D	G	K	P	R	K	V	L	M	Q	A	P	K	N	G	F	F	Y	V	I	D	R	A	T	G	E	L	L	S	A	K	G	I	V	P	Q	S	W	T	K	G	M	D	M	K	T	G	R	P	I	L	D	E	E	N	A	A	Y	W	K
Template Known Secondary structure		T	T			S						S										T	T											T	T	S							T	T	T									S	S			S	S						T	T	T	T											T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.
																				276	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	V	L	F	N	P	A	R	N	E	A	Y	V	T	H	R	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	G	K	R	N	L	V	T	P	A	F	W	G	A	H	D	W	Q	P	M	S	Y	N	P	D	T	G	L	V	Y	I	P	A	H	I	M	S	A	Y	Y	E	H	I	P	E	A	P	K	R	N	P	F	K	S	M	Y	Q	L	G	L	R	T	G	M	M	P	E	G	A	E	G	L	L	E	M	A	K	S	W	S
Template Known Secondary structure		S	S	S					S	S		T	T		S	S		S	S						T	T	T	T																	S	S						S		T	T	S				S	S							S	S									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		375	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
		294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	K	V	S	V	I	D	A	K	S	Y	K	V	V	K	T	F	D	T	P	T	H	P	N	S	L	A	L	S	A	D	G	K	T	L	Y	V	S	V	K	Q	K	S	T	K	Q	Q	E	A	T	Q	P	D	D	V	I
Query Conservation
Alig confidence																																								.
Template Conservation																																								.
Template Sequence		G	K	L	I	A	W	D	P	V	K	Q	Q	A	A	W	E	V	P	Y	V	T	I	F	N	G	G	T	L	S	T	A	G	N	L	V	F	E	G	.	S	A	D	G	R	V	I	A	Y	A	A	D	T	G	E	K	L
Template Known Secondary structure									T	T	T	T									S	S	S									T	T	T						.		T	T	S							T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																								.
Template SS confidence
		455	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.		.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.