Job Description P77425 Confidence 99.96% Date Thu Jan 5 12:29:04 GMT 2012 Rank 41 Aligned Residues 240 % Identity 23% Template d1lfwa1 SCOP info Phosphorylase/hydrolase-like Zn-dependent exopeptidases Bacterial dinuclear zinc exopeptidases Resolution 1.80

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.			30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.
Query SS confidence																														.	.
Query Sequence		I	T	H	F	R	Q	A	I	E	E	T	L	P	W	L	S	S	F	G	A	D	P	A	G	G	M	T	R	.	.	L	L	Y	S	P	E	W	L	E	T	Q	Q	Q	F	K	K	R	M	A	A	S	G	L	E	T	R	F	D	E	V	G	N	L	Y	G	R	L	N	G	T	E	Y	P	Q	E	V	V	L	S	G
Query Conservation																														.	.
Alig confidence																														.	.																										.	.													.
Template Conservation																																																									.	.													.
Template Sequence		A	E	A	K	K	D	A	I	L	K	D	L	E	E	L	I	A	I	D	S	S	E	D	L	E	N	A	T	E	E	Y	P	V	G	K	G	P	V	D	A	M	T	K	F	L	S	F	A	K	R	D	G	F	D	T	.	.	E	N	F	A	N	Y	A	G	R	V	N	F	.	G	A	G	D	K	R	L	G	I	I
Template Known Secondary structure				T	T													T	S			B			G	G	G			S	S	S	T	T																		T	T				.	.				T	T	T							.				S	S
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.													.
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.			.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.		.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
		80	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	H	I	D	T	V	V	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	N	L	D	G	Q	F	G	A	L	A	A	W	L	A	I	D	W	L	K	T	Q	Y	G	A	P	L	R	T	V	E	V	V	A	M	A	E	E	E	G	S	R	F	P	Y	V	F	W	G	S
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																										.	.	.	.	.
Template Sequence		G	H	M	D	V	V	P	A	G	E	G	W	T	R	D	P	F	K	M	E	I	D	E	E	G	R	I	Y	G	R	G	S	A	D	D	K	G	P	S	L	T	A	Y	Y	G	M	L	L	L	K	E	A	G	F	K	P	K	K	K	I	D	F	V	L	G	T	N	E	E	T	N	W	.	.	.	.	.	V	G	I
Template Known Secondary structure						B					S			S	S		T	T	S					T	T					S	T	T	S	S	S	S																		T				S	S								S		T	T	T	T		.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.						.	.	160
		139	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	N	I	F	G	L	A	N	P	D	D	V	R	N	I	C	D	A	K	G	N	S	F	V	D	A	M	K	A	C	G	F	T	L	P	N	A	P	L	T	P	R	Q	D	I	K	A	F	V	E	L	H	I	E	Q	G	C	V	L	E	S	N	G	Q	S	I	G	V	V	N	A	I	V	G	Q	R	R	Y	T	V
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	Y	Y	L	K	H	E	P	T	P	D	I	V	F	S	P	D	A	E	Y	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								S				S					S	S			S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.
		219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	L	N	G	E	S	N	H	A	G	T	T	P	M	G	Y	R	R	D	T	V	Y	A	F	S	R	I	C	H	Q	S	V	E	K	A	K	R	M	G	D	P	L	V	L	T	F	G	K	V	E	P	R	P	N	T	V	N	V	V	P	G	K	T	T	F	T	I	D	C	R	H	T	D	A	A	V	L	R	D	F
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		299	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.		.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.
Query SS confidence																																																	.
Query Sequence		T	Q	Q	L	E	N	D	M	R	A	I	C	D	E	M	D	I	G	I	D	I	D	L	W	M	D	E	E	P	V	P	M	N	K	E	L	V	A	T	L	T	E	L	C	E	R	E	.	K	L	N	Y	R	V	M	H	S	G	A	G	H	D	A	Q	I	F	A	P	R	V	P	T	C	M	I	F	I	P	S	I
Query Conservation																																																	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.																													.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	I	N	G	E	H	Y	V	P	G	S	D	P	M	V	Q	T	L	L	K	V	Y	E	K	Q	T	G	K	P	G	H	E	V	V	I	G	G	G	T	Y	G	R	L	F	E	R	G	V	A	F	G	A	Q	P	.	E	N	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							B			T	T																									S	S			G	G	G	G	S	T	T									.	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.
Template SS confidence
																								182	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.		.	.	.
		378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	G	I	S	H	N	P	A	E	R	T	N	I	T	D	L	A	E	G	V	K	T	L	A	L	M	L	Y	Q	L	A	W	Q	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		P	M	V	M	H	A	A	N	E	F	M	M	L	D	D	L	I	L	S	I	A	I	Y	A	E	A	I	Y	E	L	T	K	D	E
Template Known Secondary structure					T	T	S	T	T																								S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		435	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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