Job Description P77425 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:29:04 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 341 % Identity 16% Template c3pfoB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:putative acetylornithine deacetylase; PDBTitle: crystal structure of a putative acetylornithine deacetylase (rpa2325)2 from rhodopseudomonas palustris cga009 at 1.90 a resolution Resolution 1.90 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	T	H	F	R	Q	A	I	E	E	T	L	P	W	L	S	S	F	G	A	D	P	A	G	G	M	T	R	L	L	Y	S	P	E	W	L	E	T	Q	Q	Q	F	K	K	R	M	A	A	S	G	L	E	T	R	F	D	E	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	D	R	N	F	N	D	Q	V	A	F	L	Q	R	X	V	Q	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	S	V	R	G	E	E	A	P	Q	Q	E	W	L	A	Q	Q	F	A	D	R	G	Y	K	V	D	T	F	S	L	A	D	V	D	I	A	S	H	P	K	A	A	P	X	D	T	I	D	P	A	G	S
Template Known Secondary structure																		T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T																T	T								T	T	T	T	T	G	G	G	S	T	T					T	T			G	G	G
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.											.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
			61	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	N	L	Y	G	R	L	N	G	T	E	Y	P	Q	E	V	V	L	S	G	S	H	I	D	T	V	V	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	N	L	D	G	Q	F	G	A	L	A	A	W	L	A	I	D	W	L	K	T	Q	Y	G	A	P	L	R	T
Query Conservation		.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.													.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.
Template Sequence		X	Q	V	V	A	T	A	D	S	D	G	K	G	.	R	S	L	I	L	Q	G	H	I	D	V	V	P	E	G	P	V	D	L	W	S	D	P	P	Y	E	A	K	V	R	D	G	W	X	I	G	R	G	A	Q	D	X	K	G	G	V	S	A	X	I	F	A	L	D	A	I	R	T	A	G	Y	A	P	D	A	R
Template Known Secondary structure													S	S	.																	G	G	G		S	S		T	T	T					T	T					T	T	T	T	T	T																	T	T				S	S
Template Predicted Secondary structure															.
Template SS confidence
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.		.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
		118	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	E	V	V	A	M	A	E	E	E	G	S	R	F	P	Y	V	F	W	G	S	K	N	I	F	G	L	A	N	P	D	D	V	R	N	I	C	D	A	K	G	N	S	F	V	D	A	M	K	A	C	G	F	T	L	P	N	A	P	L	T	P	R	Q	D	I	K	A	F	V	E	L	H	I	E	Q	G	C	V	L
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	H	V	Q	T	V	T	E	E	E	S	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	A	L	S	T	L	X	R	G	Y	R	A	D	A	C	L
Template Known Secondary structure								S		T	T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T				S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.
		198	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.														.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	S	N	G	Q	S	I	G	V	V	N	A	I	V	G	Q	R	R	Y	T	V	T	L	N	G	E	S	N	H	A	G	T	T	P	M	G	Y	R	R	D	T	V	Y	A	F	S	R	I	C	H	Q	S	V	E	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	K	R	M	G	D	P	L	V	L	T	F
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																															.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.	.
Template Sequence		I	P	E	P	T	G	H	T	L	T	R	A	Q	V	G	A	V	W	F	R	L	R	V	R	G	T	P	V	H	.	.	V	A	Y	S	E	T	G	T	S	A	I	L	S	A	X	H	L	I	R	A	F	E	E	Y	T	K	E	L	N	A	Q	A	V	R	D	P	W	F	G	Q	V	K	N	P	I	K	F	N	V
Template Known Secondary structure							S	S																						B	.	.	G	G	G	G	G	G	S																									G	G	G	S	T	T	T	T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																															.	.
Template SS confidence
		199	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.			.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.
		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310							.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.		.	330	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.																			.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.																			.
Query Sequence		G	K	V	E	P	R	P	N	T	V	N	V	V	P	G	K	T	T	F	T	I	D	C	R	H	T	D	A	A	V	L	R	D	F	T	Q	Q	L	E	N	D	M	R	A	I	C	.	.	.	.	.	.	D	E	M	D	I	G	I	D	I	D	L	W	M	D	E	E	P	V	.	P	M	N	K	E	L	V	A	T
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.																			.
Alig confidence						.																																										.	.	.	.	.	.																			.
Template Conservation						.
Template Sequence		G	I	I	K	.	G	G	D	W	A	S	S	T	A	A	W	C	E	L	D	C	R	L	G	L	L	T	G	D	T	P	Q	E	A	X	R	G	I	E	K	C	L	A	D	A	Q	A	T	D	S	F	L	S	E	N	P	A	E	L	V	W	S	G	F	Q	A	D	P	A	V	C	E	P	G	G	V	A	E	D	V
Template Known Secondary structure						.			S		T	T	B															T	T																			T	T							S																		T	T
Template Predicted Secondary structure						.
Template SS confidence
		277	.	.	280		.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.
		338	.	340	.	.	.	.	.		.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.		.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.																						.
Query SS confidence										.																						.
Query Sequence		L	T	E	L	C	E	R	E	.	K	L	N	Y	R	V	M	H	S	G	A	G	H	D	A	Q	I	F	A	P	R	.	V	P	T	C	M	I	F	I	P	S	I	N	G	I	S	H	N	P	A	E	R	T	N	I	T	D	L	A	E	G	V	K	T	L	A	L	M	L	Y	Q	L
Query Conservation										.																						.
Alig confidence										.																						.														.
Template Conservation																																														.
Template Sequence		L	T	A	A	H	K	A	A	F	N	A	P	L	D	A	R	L	S	T	A	V	N	D	T	R	Y	Y	S	V	D	Y	G	I	P	A	L	C	Y	G	P	Y	G	Q	G	.	P	H	A	F	D	E	R	I	D	L	E	S	L	R	K	T	T	L	S	I	A	L	F	V	A	E	W
Template Known Secondary structure											S	S								S	S			T																						.	T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																														.
Template SS confidence
		356	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.