Job Description P77425 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:29:04 GMT 2012 Rank 22 Aligned Residues 364 % Identity 15% Template c3pfeA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:succinyl-diaminopimelate desuccinylase; PDBTitle: crystal structure of a m20a metallo peptidase (dape, lpg0809) from2 legionella pneumophila subsp. pneumophila str. philadelphia 1 at 1.503 a resolution Resolution 1.50 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.								.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	T	H	F	R	Q	A	I	E	E	T	L	P	W	L	S	S	F	G	A	D	P	A	G	G	M	T	R	L	L	Y	S	P	E	W	L	E	T	Q	Q	Q	F	K	K	R	M	A	A	S	G	L	E	T	R	F	D	E	.	.	.	.	.	.	.	V	G	N	L	Y	G	R	L	N	G	T	E	Y	P	Q	E
Query Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.														.	.
Template Conservation																																																																															.	.
Template Sequence		C	Q	Q	W	Q	E	E	I	L	P	S	L	C	D	Y	I	K	I	P	N	K	S	P	H	F	D	A	K	W	E	E	H	G	Y	X	E	Q	A	V	N	H	I	A	N	W	C	K	S	H	A	P	K	G	X	T	L	E	I	V	R	L	K	N	R	T	P	L	L	F	X	E	I	P	G	Q	I	D	.	.	D
Template Known Secondary structure								T										T				B		G	G	G		T	T																					T			T	T									T	T	S											S			.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.
Template SS confidence
		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.			.
		75	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	V	L	S	G	S	H	I	D	T	V	V	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	N	L	D	G	Q	F	G	A	L	A	A	W	L	A	I	D	W	L	K	T	Q	Y	G	A	P	L	R	T	V	E	V	V	A	M	A	E	E	E	G	S	R	F	P
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Template Conservation																																																																.
Template Sequence		T	V	L	L	Y	G	H	L	D	K	Q	P	E	X	S	G	W	S	D	D	L	H	P	W	K	P	V	L	K	N	G	L	L	Y	G	R	G	G	A	D	D	G	Y	S	A	Y	A	S	L	T	A	I	R	A	L	E	Q	Q	G	L	P	Y	.	P	R	C	I	L	I	I	E	A	C	E	E	S	G	S	Y	D
Template Known Secondary structure											B					S				T	T		B	T	T	B					T	T				S	T	T																					T	T				.									S		G	G	G	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																.
Template SS confidence
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.		.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
		133	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	V	F	W	G	S	K	N	I	F	G	L	A	N	P	D	D	V	R	N	I	C	D	A	K	G	N	S	F	V	D	A	M	K	A	C	G	F	T	L	P	N	A	P	L	T	P	R	Q	D	I	K	A	F	V	E	L	H	I	E	Q	G	C	V	L	E	S	N	G	Q	S	I	G	V	V	N	A	I	V	G
Query Conservation
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	P	F	Y	I	E	L	L	K	E	R	I	G	K	P	S	L	V	I	C	L	D	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	G	N	Y	E	Q	L	W	X	T	T	S	L	R	G
Template Known Secondary structure																	S								B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S		S	S	S
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
		213	.	.	.	.	.	.	220	.	.			.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	R	R	Y	T	V	T	L	N	G	.	.	E	S	N	H	A	G	T	T	P	M	G	Y	R	R	D	T	V	Y	A	F	S	R	I	C	H	Q	S	V	E	K	A	K	R	M	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation												.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.					.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.
Template Sequence		N	L	V	G	K	L	T	V	E	L	I	N	E	G	V	H	.	S	G	S	A	S	G	I	V	A	D	S	F	R	V	A	R	Q	L	I	S	R	I	E	D	E	N	T	G	E	I	K	L	P	Q	L	Y	C	D	I	P	D	E	R	I	K	Q	A	K	Q	C	A	E	I	L	G	E	Q	V	Y	S	E	F	P
Template Known Secondary structure											S		S	S		B		.					T	T	T	S															B		T	T	T			B			G	G	G																				G	G	G	G	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																		.
Template SS confidence
		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.		.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
																							259	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.				270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.																																													.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.																																													.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	V	L	T	F	G	K	V	E	P	.	.	.	R	P	N	T	V	N	V	V	P	G	K	T	T	F	T	I	D	C	R	H	T	D	A	A	V	L	R	D	F	T	Q	Q	L	E	N	D	M	R	A	I	C	D	E	M	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.																																													.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.																																													.
Template Conservation
Template Sequence		W	I	D	S	A	K	P	V	I	Q	D	K	Q	Q	L	I	L	N	R	T	W	R	P	A	L	T	V	T	G	A	D	G	F	P	A	I	A	D	A	G	N	V	X	R	P	V	T	S	L	K	L	S	X	R	L	P	P	L	V	D	P	E	A	A	S	V	A	X	E	K	A	L	T	Q	N	P	P	Y	N	A
Template Known Secondary structure				T	T				S		S											T	S										S				T	T	T			S		B		S												T	T																S	S		G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
		314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.			.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.		.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360		.	.	.	.	.				.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.																		.																.						.	.	.
Query SS confidence																	.	.																		.																.						.	.	.
Query Sequence		D	I	G	I	D	I	D	L	W	M	D	E	E	P	V	.	.	P	M	N	K	E	L	V	A	T	L	T	E	L	C	E	R	E	.	K	L	N	Y	R	V	M	H	S	G	A	G	H	D	A	.	Q	I	F	A	P	.	.	.	R	V	P	T	C	M	I	F	I	P	S	I	N	G	I	S	H	N	P	A	E
Query Conservation																	.	.																		.																.						.	.	.
Alig confidence																	.	.																		.																.						.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	V	D	F	K	I	Q	N	G	G	S	K	G	W	N	A	P	L	L	S	D	W	L	A	K	A	A	S	E	A	S	X	T	Y	Y	D	K	P	A	A	Y	X	G	E	G	G	T	I	P	F	X	S	X	L	G	E	Q	F	P	K	A	Q	F	X	I	T	G	V	L	G	P	H	S	N	A	H	G	P	N	E
Template Known Secondary structure									S			B																									S	S								S	S													T	T									B		T	T			T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		367	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.
		387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	T	N	I	T	D	L	A	E	G	V	K	T	L	A	L	M	L	Y	Q	L	A	W	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		F	L	H	L	D	X	V	K	K	L	T	S	C	V	S	Y	V	L	Y	S	F	S	Q	K
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		447	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470