Job Description P77425 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:29:04 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 365 % Identity 13% Template c2zogA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:cytosolic non-specific dipeptidase; PDBTitle: crystal structure of mouse carnosinase cn2 complexed with zn and2 bestatin Resolution 1.70 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60															.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	T	H	F	R	Q	A	I	E	E	T	L	P	W	L	S	S	F	G	A	D	P	A	G	G	M	T	R	L	L	Y	S	P	E	W	L	E	T	Q	Q	Q	F	K	K	R	M	A	A	S	G	L	E	T	R	F	D	E	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	Y	G	R	L	N
Query Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.
Template Sequence		I	D	E	N	Q	D	R	Y	V	K	K	L	A	E	W	V	A	I	Q	S	V	S	A	W	.	.	.	.	P	E	K	R	G	E	I	R	R	M	M	E	V	A	A	A	D	V	Q	R	L	G	G	S	V	E	L	V	D	I	G	K	Q	K	L	P	D	G	S	E	I	P	L	P	P	I	L	L	G	K	L	G
Template Known Secondary structure					T														S			B	T	T		.	.	.	.	G	G	G																		T	T														T	T	S
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.
Template SS confidence
		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.					.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
		68	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	T	E	Y	P	Q	E	V	V	L	S	G	S	H	I	D	T	V	V	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	N	L	D	G	Q	F	G	A	L	A	A	W	L	A	I	D	W	L	K	T	Q	Y	G	A	P	L	R	T	V	E	V	V	A	M	A	E
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.
Template Sequence		S	.	D	P	Q	K	K	T	V	C	I	Y	G	H	L	D	V	Q	P	A	A	L	E	D	G	W	D	S	E	P	F	T	L	V	E	R	E	G	K	L	Y	G	R	G	S	T	D	D	K	G	P	V	A	G	W	M	N	A	L	E	A	Y	Q	K	T	G	Q	E	I	P	V	N	L	R	F	C	L	E	G	M
Template Known Secondary structure			.		T	T	S											B					G	G	G	T		S	S		T	T	S					T	T				S	T	T	T	T	T	T																	T	T				S	S								S
Template Predicted Secondary structure			.
Template SS confidence
		87		.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
		126	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	E	G	S	R	F	P	Y	V	F	W	G	S	K	N	I	F	G	L	A	N	P	D	D	V	R	N	I	C	D	A	K	G	N	S	F	V	D	A	M	K	A	C	G	F	T	L	P	N	A	P	L	T	P	R	Q	D	I	K	A	F	V	E	L	H	I	E	Q	G	C	V	L	E	S	N	G	Q	S	I	G
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	E	S	G	S	E	G	L	D	E	L	I	F	A	Q	K	D	K	F	F	K	D	V	D	Y	V	C	I	S	D	N	Y	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	K	N	K	P	C
Template Known Secondary structure		G	G	G	T		T	T								T	T	T	T	T	T	T	T										B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	200	.	.	.	.	.
		206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.		.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	V	N	A	I	V	G	Q	R	R	Y	T	V	T	L	N	G	E	S	N	H	.	A	G	T	T	P	M	G	Y	R	R	D	T	V	Y	A	F	S	R	I	C	H	Q	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																							.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	T	Y	G	L	R	G	I	C	Y	F	F	I	E	V	E	C	S	D	K	D	L	H	S	G	V	Y	G	G	S	V	H	E	A	M	T	D	L	I	S	L	M	G	C	L	V	D	K	K	G	K	I	L	I	P	G	I	N	D	A	V	A	P	V	T	D	E	E	H	A	L	Y	D	H	I	D	F	D	M	E
Template Known Secondary structure																				S	S								T	T	T	S												T	T	S	B		T	T	S		B		S	T	T	T	T	T	T	S											T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
																		250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.				.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	E	K	A	K	R	M	G	D	P	L	V	L	T	F	G	K	V	E	P	R	P	.	.	.	N	T	V	N	V	V	P	G	K	T	T	F	T	I	D	C	R	H	T	D	A	A	V	L	R	D	F	T	Q	Q	L	E	N	D	M	R	A	I	C
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	F	A	K	D	V	G	A	E	T	L	L	H	S	C	K	K	D	I	L	M	H	R	W	R	Y	P	S	L	S	L	H	G	I	E	G	A	F	S	G	S	G	A	K	T	V	I	P	R	K	V	V	G	K	F	S	I	R	L	V	P	D	M	I	P	E	V	V	S	E	Q	V	S	S	Y	L	S	K	K	F
Template Known Secondary structure								T		S	S		S		S	S										T	S										S	S			S	S	S							S												T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
		311	.			.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.			.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.		.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.			.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.		.	380	.	.
Predicted Secondary structure				.	.																	.	.																		.													.	.																						.
Query SS confidence				.	.																	.	.																		.													.	.																						.
Query Sequence		D	E	.	.	M	D	I	G	I	D	I	D	L	W	M	D	E	E	P	V	.	.	P	M	N	K	E	L	V	A	T	L	T	E	L	C	E	R	E	.	K	L	N	Y	R	V	M	H	S	G	A	G	.	.	H	D	A	Q	I	F	A	P	R	V	P	T	C	M	I	F	I	P	S	I	N	.	G	I	S	H
Query Conservation				.	.																	.	.																		.													.	.																						.
Alig confidence				.	.																	.	.																		.													.	.																						.
Template Conservation
Template Sequence		A	E	L	Q	S	P	N	K	F	K	V	Y	M	G	H	G	G	K	P	W	V	S	D	F	N	H	P	H	Y	Q	A	G	R	R	A	L	K	T	V	F	G	V	E	P	D	L	T	R	E	G	G	S	I	P	V	T	L	T	F	Q	E	A	T	G	K	N	V	M	L	L	P	V	G	S	A	D	D	G	A	H
Template Known Secondary structure			T	T				S																	T	T	S															S	S								S	S			T											S								B		T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		366	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.
		383	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	P	A	E	R	T	N	I	T	D	L	A	E	G	V	K	T	L	A	L	M	L	Y	Q	L	A	W	Q	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	Q	N	E	K	L	N	R	L	N	Y	I	E	G	T	K	M	L	A	A	Y	L	Y	E	V	S	Q	L	K
Template Known Secondary structure		S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		446	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.