Job Description P71244 Confidence 98.11% Date Thu Jan 5 12:12:40 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 307 % Identity 21% Template c2uveA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:exopolygalacturonase; PDBTitle: structure of yersinia enterocolitica family 282 exopolygalacturonase Resolution 2.19 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.						.	.	.	.	.	.	50	.	.	.				.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.											.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.											.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	A	R	Q	S	V	N	I	N	D	Y	N	P	H	.	.	.	.	.	D	W	I	A	S	F	K	Q	A	F	.	.	.	S	E	G	Q	T	V	V	V	P	A	G	L	V	C	D	N	I	N	T	G	I	F	I	P	P	G	K	T	L	H	I	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																.	.	.	.	.											.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.											.	.	.														.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.
Template Sequence		A	K	P	Q	I	V	N	V	R	D	F	G	A	I	D	D	G	K	T	L	N	T	K	A	I	Q	Q	A	I	D	S	C	K	P	G	C	R	V	E	I	P	A	G	T	Y	.	.	.	K	S	G	A	L	W	L	K	S	D	M	T	L	N	L	Q	A	G	A	I	L	L	G	S	E	N	P	D	D	Y	P	A
Template Known Secondary structure									G	G	G	G	T				S	S	S		B											T			T	T							S				.	.	.									S	S							T	T							S		G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.
Template SS confidence
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.				.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
																																								86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	L	R	G	N	G	R	G	R	F	V	L	Q	D	G	S	Q	V	T	G	E	D	G	G	S	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	Y	R	L	Y	P	Y	S	T	I	E	R	P	A	S	L	I	N	A	I	D	P	N	N	S	K	P	G	T	F	R	N	I	R	I	T	G	S	G	V	I	D	G	N	G	W	L	R	A	K	T	A	E	I	T	D	E	L	G	R	S	L	P	Q	Y	V	A	S	K	N	S	K	V	H	E	D	G	I	L	A
Template Known Secondary structure					S	S	T	T			S						S						S	S			S	T	T	S								S	S								B											T	T	S											T	T	T					B	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
																									113	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	N	I	T	L	D	V	R	G	S	D	C	T	I	K	G	L	T	M	S	G	F	G	P	V	T	Q	I	Y	I	G	G	K	N	K	R	V	M	R	N	L	I	I	D	N	L	T	V	S	H	A	N	Y	A	I	L	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.																.																														.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.																.																														.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	N	Q	V	E	K	A	V	S	D	G	M	D	L	K	N	A	Y	G	Q	R	R	S	S	L	M	T	L	.	R	G	V	E	N	V	Y	L	A	G	F	T	V	R	N	.	P	A	F	H	G	I	M	N	L	E	N	H	N	V	V	A	N	G	L	I	H	Q	T	Y	D	A	N	N	G	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											T	T										S	S			S				.		S								S						.		S	S		S					S								S						T	T		T	T		.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																														.																.																														.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.		.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.		.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
		170	.	.	.	.	.		.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.																.	.	.	200	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.
Predicted Secondary structure								.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	G	F	H	N	Q	.	I	I	G	A	N	I	T	N	C	K	F	S	D	L	Q	G	D	A	I	E	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	V	A	I	N	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	D	I	L	I	S	D	H	V	I	E
Query Conservation								.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.												.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.
Template Sequence		D	G	I	E	F	G	N	S	Q	N	V	M	V	F	N	N	F	F	.	D	T	G	D	D	C	I	N	F	A	A	G	T	G	E	K	A	Q	E	Q	E	P	M	K	G	A	W	L	F	N	N	Y	F	R	M	G	H	G	A	I	V	T	G	S	H	T	G	A	W	I	E	D	I	L	A	E	N	N	V	M	Y
Template Known Secondary structure			S					S								S				.			S	S		S								S	T	T	G	G	G	S										S					S	S	S		S					S			T	T									S
Template Predicted Secondary structure																				.
Template SS confidence
		381	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.		.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		214	.		.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.
Predicted Secondary structure				.
Query SS confidence				.
Query Sequence		R	I	.	N	C	T	N	G	K	I	N	W	G	I	G	I	G	L	A	G	S	T	Y	D	N	N	Y	P	E	D	Q	A	V	K	N	F	V	V	A	N	I	T	G	S	D	C	R	Q	L	I	H	V	E	N	G	K	H	F	V	I	R	N	I	K	A	R	N	I	T	P	D	F	S	K	K	A	G	I	D	N
Query Conservation				.
Alig confidence				.																																																																				.	.	.
Template Conservation																																																																								.	.	.
Template Sequence		L	T	D	I	G	L	R	A	K	S	T	S	T	I	G	G	G	A	R	N	V	T	F	R	N	N	A	M	R	D	L	A	K	Q	V	M	V	M	T	L	D	Y	A	D	S	N	A	N	I	D	Y	P	P	A	K	I	P	A	Q	F	Y	D	F	T	L	K	N	V	T	V	.	.	.	D	N	S	T	G	K	N
Template Known Secondary structure		S		S									G	G	G																		S	S											S	S	S				S	S				S	S															.	.	.						S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.
Template SS confidence
		460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.				530	.	.	.	.	.	.
		293	.	.	.	.	.	.								300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	T	V	A	I	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	C	D	N	F	V	I	D	N	I	E	M	I	N	S	A	G	M	L	I	G	Y	G	V	I	K	G	K	Y	L	S	I	P	Q	N	F	R	V	N	D	I	Q	L	D	N	T	H	L	A	Y	K	L	R	G	I	Q	I	S	A	G	N	A	V	S	F	V	A
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	S	I	E	I	K	G	D	T	A	N	K	A	W	H	R	L	V	H	V	N	N	V	Q	L	N	N	V	T	P	T	A	I	S	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	D	S	E	F	N	K	V	T	F	T	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	R	G	D	T	P	W	H	F	S	E
Template Known Secondary structure			S						B	T	T	T	T	B														S										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	S		S
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		537	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.											.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.												.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.
		366	.	.	.	370	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	T	N	I	E	M	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		V	K	N	V	K	V	D
Template Known Secondary structure								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		596	.	.	.	600	.	.