Job Description P00956 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:57:19 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 338 % Identity 26% Template d2d5ba2 SCOP info Adenine nucleotide alpha hydrolase-like Nucleotidylyl transferase Class I aminoacyl-tRNA synthetases (RS), catalytic domain Resolution 1.80

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		48	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	K	T	F	I	L	H	D	G	P	P	Y	A	N	G	S	I	H	I	G	H	S	V	N	K	I	L	K	D	I	I	V	K	S	K	G	L	S	G	Y	D	S	P	Y	V	P	G	W	D	C	H	G	L	P	I	E	L	K	V	E	Q	E	Y	G	K	P	G	E	K	F	T	A	A	E	F	R	A	K	C	R
Query Conservation
Alig confidence																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	K	V	F	Y	V	T	T	P	I	Y	Y	V	N	A	E	P	H	L	G	H	A	Y	T	T	V	V	A	D	F	L	A	R	W	H	R	L	D	G	Y	R	T	F	F	L	T	G	T	D	E	H	G	E	T	V	Y	R	A	A	Q	A	A	G	E	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K
Template Known Secondary structure														T	T	S																							T	T													S											T	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.														.
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	Y	A	A	T	Q	V	D	G	Q	R	K	D	F	I	R	L	G	V	L	G	D	W	S	H	P	Y	L	T	M	D	F	K	T	E	A	N	I	I	R	A	L	G	K	I	I	G	N	G	H	L	H	K	G	A	K	P	V	H	W	C	V	D	C	R	S	A	L	A	E	A	E	V	E	Y	Y	D	K	T	S
Query Conservation
Alig confidence																									.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	F	V	D	R	V	S	G	R	F	K	R	A	W	D	L	L	G	I	A	Y	D	D	.	.	F	I	R	T	T	E	E	R	H	K	K	V	V	Q	L	V	L	K	K	V	Y	E	A	G	D	I	Y	Y	G	E	Y	E	G	L	Y	C	V	S	C	E	R	F	Y	T	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																		T	T				S		.	.				T	T	S																	T	T													T	T	T	T					T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																									.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.			.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.
		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	S	I	D	V	A	F	Q	A	V	D	Q	D	A	L	K	A	K	F	A	V	S	N	V	N	G	P	I	S	L	V	I	W	T	T	T	P	W	T	L	P	A	N	R	A	I	S	I	A	P	D	F	D	Y	A	L	V	Q	I	D	G	Q	A	V	I	L	A	K	D	L	V	E	S	V	M	Q	R	I	G	V
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		288	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	D	Y	T	I	L	G	T	V	K	G	A	E	L	E	L	L	R	F	T	H	P	F	M	G	F	D	V	P	A	I	L	G	D	H	V	T	L	D	A	G	T	G	A	V	H	T	A	P	G	H	G	P	D	D	Y	V	I	G	Q	K	Y	G	L	E	T	A	N	P	V	G	P	D	G	T	Y	L	P	G	T
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		368	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	P	T	L	D	G	V	N	V	F	K	A	N	D	I	V	V	A	L	L	Q	E	K	G	A	L	L	H	V	E	K	M	Q	H	S	Y	P	C	C	W	R	H	K	T	P	I	I	F	R	A	T	P	Q	W	F	V	S	M	D	Q	K	G	L	R	A	Q	S	L	K	E	I	K	G	V	Q	W	I	P	D	W
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	E	L	V	E	G	L	C	P	I	H	G	R	P	V	E	R	R	K	E	G	N	Y	F	F	R	M	E	K	Y	R	P	W	L	Q	E	Y	I	Q	E	N	P	D	L	I	R	P	E	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S	B	T	T	B		T	T	T		S	B													G	G	G	G										T		T	T	S			S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																	137	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
		448	.	450	.	.	.	.	.	.		.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.				.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.
Predicted Secondary structure											.												.	.	.
Query SS confidence											.												.	.	.
Query Sequence		G	Q	A	R	I	E	S	M	V	.	A	N	R	P	D	W	C	I	S	R	Q	.	.	.	R	T	W	G	V	P	M	S	L	F	V	H	K	D	T	E	E	L	H	P	R	T	L	E	L	M	E	E	V	A	K	R	V	E	V	D	G	I	Q	A	W	W	D	L	D	A	K	E	I	L	G	D	E	A	D	Q
Query Conservation											.												.	.	.
Alig confidence											.												.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	R	N	E	V	L	A	M	L	A	E	P	I	G	D	L	S	I	S	R	P	K	S	R	V	P	W	G	I	P	L	P	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											T	S											T	T	T			S	S				T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.
		524	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.				550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Predicted Secondary structure																												.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.
Query Sequence		Y	V	K	V	P	D	T	L	D	V	W	F	D	S	G	S	T	H	S	S	V	V	D	V	R	P	.	.	.	E	F	A	G	H	A	A	D	M	Y	L	E	G	S	D	Q	H	R	G	W	F	M	S	S	L	M	I	S	T	A	M	K	G	K	A	P	Y	R	Q	V	L	T	H	G	F	T	V	D	G	Q	G
Query Conservation																												.	.	.
Alig confidence		.	.																									.	.	.																																.
Template Conservation		.	.																																																											.
Template Sequence		.	.	D	E	N	H	V	T	F	V	W	F	D	A	L	L	N	Y	V	S	A	L	D	Y	P	E	G	E	A	Y	R	T	F	W	P	H	A	W	H	L	I	G	K	D	I	L	K	P	H	A	V	F	W	P	T	M	L	K	A	A	.	G	I	P	M	Y	R	H	L	N	V	G	G	F	L	L	G	P	D	G
Template Known Secondary structure		.	.														T					T	T	T	T	T	T								G	G	G							G	G	G						T										.	T					S											T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.																																																											.
Template SS confidence
				219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.		.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
		601	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630		.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.
Predicted Secondary structure																																.
Query SS confidence																																.
Query Sequence		R	K	M	S	K	S	I	G	N	T	V	S	P	Q	D	V	M	N	K	L	G	A	D	I	L	R	L	W	V	A	.	S	T	D	Y	T	G	E	M	A	V	S	D	E	I	L	K	R	A	A	D	S
Query Conservation																																.
Alig confidence																																.
Template Conservation
Template Sequence		R	K	M	S	K	T	L	G	N	V	V	D	P	F	A	L	L	E	K	Y	G	R	D	A	L	R	Y	Y	L	L	R	E	I	P	Y	G	Q	D	T	P	V	S	E	E	A	L	R	T	R	Y	E	A
Template Known Secondary structure		S				T	T	T	T																									S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.