Job Description P77234 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:26:39 GMT 2012 Rank 1 Aligned Residues 312 % Identity 34% Template c2xm6A_ PDB info PDB header:unknown function Chain: A: PDB Molecule:protein corresponding to locus c5321 from cft073 e.coli PDBTitle: crystal structure of the protein corresponding to locus c5321 from2 cft073 e.coli strain Resolution 1.68 Å

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		13	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	D	E	I	I	E	R	A	E	K	G	D	C	E	A	Q	Y	I	V	G	F	Y	Y	N	R	D	S	A	I	D	S	P	D	D	E	K	A	F	Y	W	L	K	L	A	A	E	Q	G	H	C	E	A	Q	Y	S	L	G	Q	K	Y	T	E	D	K	S	R	H	K	D	N	E	Q	A	I	F	W	L	K	K	A
Query Conservation
Alig confidence																																	.
Template Conservation																																	.
Template Sequence		L	E	Q	L	K	Q	K	A	E	S	G	E	A	K	A	Q	L	E	L	G	Y	R	Y	F	Q	G	N	E	T	T	K	.	D	L	T	Q	A	M	D	W	F	R	R	A	A	E	Q	G	Y	T	P	A	E	Y	V	L	G	L	R	Y	M	N	G	E	G	V	P	Q	D	Y	A	Q	A	V	I	W	Y	K	K	A
Template Known Secondary structure											T	T															T	S	S	S			.															T	T															T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.		.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	L	Q	G	H	T	F	A	S	N	A	L	G	W	T	L	D	R	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	L	K	G	L	P	Q	A	Q	Q	N	L	G	V	M	Y	H	E	G	N	G	V	K	V	D	K	A	E	S	V	K	W	F	R	L	A	A	E	Q	G	R	D	S	G	Q	Q	S	M	G	D	A	Y	F	E	G	D	G	V	T	R	D	Y	V	M	A	R	E	W	Y	S	K	A	A	E	Q	G	N	V	W	S
Template Known Secondary structure				T	T															T	S	S	S																	T	T															T	S	S	S																	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
																																																				113	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	N	Y	K	E	A	V	V	W	Y	Q	I	A	A	E	S	G	M	S	Y	A	Q	N	N	L	G	W	M	Y
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		C	N	Q	L	G	Y	M	Y	S	R	G	L	G	V	E	R	N	D	A	I	S	A	Q	W	Y	R	K	S	A	T	S	G	D	E	L	G	Q	L	H	L	A	D	M	Y	Y	F	G	I	G	V	T	Q	D	Y	T	Q	S	R	V	L	F	S	Q	S	A	E	Q	G	N	S	I	A	Q	F	R	L	G	Y	I	L
Template Known Secondary structure												T	S	S	S																	T	T															T	S	S	S																T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
		143	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	N	G	N	G	V	A	K	D	Y	A	L	A	F	F	W	Y	K	Q	A	A	L	Q	G	H	S	D	A	Q	N	N	L	A	D	L	Y	E	D	G	K	G	V	A	Q	N	K	T	L	A	A	F	W	Y	L	K	S	A	Q	Q	G	N	R	H	A	Q	F	Q	I	A	W	D	Y	N	A	G	E	G	V	D	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		E	Q	G	L	A	G	A	K	E	P	L	K	A	L	E	W	Y	R	K	S	A	E	Q	G	N	S	D	G	Q	Y	Y	L	A	H	L	Y	D	K	G	A	E	G	V	A	K	N	R	E	Q	A	I	S	W	Y	T	K	S	A	E	Q	G	D	A	T	A	Q	A	N	L	G	A	I	Y	F	R	L	G	S	E	E
Template Known Secondary structure				T	T	T	S	S															T	T	T																B	T	T	B																	T	T															S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
		223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	Y	K	Q	A	M	Y	W	Y	L	K	A	A	A	Q	G	S	V	G	A	Y	V	N	I	G	Y	M	Y	K	H	G	Q	G	V	E	K	D	Y	Q	A	A	F	E	W	F	T	K	A	A	E	C	N	D	A	T	A	W	Y	N	L	A	I	M	Y	H	Y	G	E	G	R	P	V	D	L	R	Q	A	L	D	L
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		E	H	K	K	A	V	E	W	F	R	K	A	A	A	K	G	E	K	A	A	Q	F	N	L	G	N	A	L	L	Q	G	K	G	V	K	K	D	E	Q	Q	A	A	I	W	M	R	K	A	A	E	Q	G	L	S	A	A	Q	V	Q	L	G	E	I	Y	Y	Y	G	L	G	V	E	R	D	Y	V	Q	A	W	A	W
Template Known Secondary structure																T	T															T	S	S	S																	T	T															T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
		303	.	.	.	.	.	.	310		.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.
Query SS confidence										.
Query Sequence		Y	R	K	V	Q	S	S	G	.	T	R	D	V	S	Q	E	I	R	E	T	E	D	L	L
Query Conservation										.
Alig confidence										.
Template Conservation
Template Sequence		F	D	T	A	S	T	N	D	M	N	L	F	G	T	E	N	R	N	I	T	E	K	K	L
Template Known Secondary structure																							T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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