Job Description P77234 Confidence 97.04% Date Thu Jan 5 12:26:39 GMT 2012 Rank 33 Aligned Residues 124 % Identity 21% Template c2e2eA_ PDB info PDB header:lyase Chain: A: PDB Molecule:formate-dependent nitrite reductase complex nrfg subunit; PDBTitle: tpr domain of nrfg mediates the complex formation between heme lyase2 and formate-dependent nitrite reductase in escherichia coli o157:h7 Resolution 2.05 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.			.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.			.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.																																					.	.
Query SS confidence													.	.																																					.	.
Query Sequence		S	I	D	E	I	I	E	R	A	E	K	.	.	G	D	C	E	A	Q	Y	I	V	G	F	Y	Y	N	R	D	S	A	I	D	S	P	D	D	E	K	A	F	Y	W	L	K	L	A	A	E	.	.	Q	G	H	C	E	A	Q	Y	S	L	G	Q	K	Y	T	E	D	K	S	R	H	K	D	N	E	Q	A	I	F
Query Conservation													.	.																																					.	.
Alig confidence													.	.																.	.	.	.	.																	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	L	Q	A	L	Q	D	K	I	R	A	N	P	Q	N	S	E	Q	W	A	L	L	G	E	Y	Y	L	W	.	.	.	.	.	Q	N	D	Y	S	N	S	L	L	A	Y	R	Q	A	L	Q	L	R	G	E	N	A	E	L	Y	A	A	L	A	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure															S															.	.	.	.	.	T	T																		S											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		58	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.						.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	L	K	K	A	A	L	Q	G	H	T	F	A	S	N	A	L	G	W	T	L	D	R	G	E	A	P	N	Y	K	E	A	V	V	W	Y	Q	I	A	A	E	S	G	M	S	Y	A	Q	N	N	L	G	W	M	Y	R	N	G	N	G	V	A	K	D	Y	A	L	A	F	F	W	Y	K	Q	A	A	L	Q	G	H
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	D	A	Q	N	N	L	A	D	L	Y	E	D	G	K	G	V	A	Q	N	K	T	L	A	A	F	W	Y	L	K	S	A	Q	Q	G	N	R	H	A	Q	F	Q	I	A	W	D	Y	N	A	G	E	G	V	D	Q	D	Y	K	Q	A	M	Y	W	Y	L	K	A	A	A	Q	G	S	V	G	A	Y	V	N	I	G
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.			.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.			.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.																																								.	.
Query SS confidence																													.	.																																								.	.
Query Sequence		Y	M	Y	K	H	G	Q	G	V	E	K	D	Y	Q	A	A	F	E	W	F	T	K	A	A	E	C	N	.	.	D	A	T	A	W	Y	N	L	A	I	M	Y	H	Y	G	E	G	R	P	V	D	L	R	Q	A	L	D	L	Y	R	K	V	Q	S	S	G	T	R	D	.	.	V	S	Q	E	I	R	E	T	E	D
Query Conservation																													.	.																																								.	.
Alig confidence		.	.																										.	.															.	.	.	.																						.	.
Template Conservation		.	.																																										.	.	.	.
Template Sequence		.	.	V	L	Y	Y	Q	A	S	Q	H	M	T	A	Q	T	R	A	M	I	D	K	A	L	A	L	D	S	N	E	I	T	A	L	M	L	L	A	S	D	A	F	M	.	.	.	.	Q	A	N	Y	A	Q	A	I	E	L	W	Q	K	V	M	D	L	N	S	P	R	I	N	R	T	Q	L	V	E	S	I	N	M
Template Known Secondary structure		.	.						T	T	T																		T	T															.	.	.	.	T	T															T			T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.																																										.	.	.	.
Template SS confidence
				116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.					.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions