Job Description P25516 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:41:52 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 456 % Identity 23% Template d1l5ja3 SCOP info Aconitase iron-sulfur domain Aconitase iron-sulfur domain Aconitase iron-sulfur domain Resolution 2.40

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		53	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	D	G	N	S	V	T	E	E	D	I	H	A	L	A	G	W	L	K	N	A	H	A	D	R	E	I	A	Y	R	P	A	R	V	L	M	Q	D	F	T	G	V	P	A	V	V	D	L	A	A	M	R	E	A	V	K	R	L	G	G	D	T	A	K	V	N	P	L	S	P	V	D	L	V	I	D	H	S	V	T
Query Conservation
Alig confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.					.	.				.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.					.	.				.
Template Sequence		S	D	R	G	F	S	L	A	Q	K	M	V	G	R	A	C	G	V	K	G	I	R	P	G	A	Y	C	E	P	K	M	T	S	V	G	S	Q	D	T	T	G	P	M	T	R	D	E	L	K	D	L	.	.	.	.	.	.	.	A	C	L	G	.	.	F	S	A	.	D	L	V	M	Q	S	F	C	H	T	A	A
Template Known Secondary structure				S												T	T	T	S	S				T	T						B		S						T	T	T											T	.	.	.	.	.	.	.	T			S	.	.			S	.	S								S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.					.	.				.
Template SS confidence
		378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.								.	430	.	.			.	.	.		.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
		133	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.		.	210	.
Predicted Secondary structure																																																																														.
Query SS confidence																																																																														.
Query Sequence		V	D	R	F	G	D	D	E	A	F	E	E	N	V	R	L	E	M	E	R	N	H	E	R	Y	V	F	L	K	W	G	K	Q	A	F	S	R	F	S	V	V	P	P	G	T	G	I	C	H	Q	V	N	L	E	Y	L	G	K	A	V	W	S	E	L	Q	D	G	E	W	I	A	Y	P	D	T	L	.	V	G	T
Query Conservation																																																																														.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	P	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	V	D	V	N	T	H	H	T	L	P	D	F	I	M	N	R	.	G	G	V	S	L	R	P	G	D	G	V	I	H	S	W	L	N	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	L	L	P	D	T	V	G	T	G	G
Template Known Secondary structure		S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																T	T	.	T						T	T	S	B							G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G			T	T						S
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		448	.	450																.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.		.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.																.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.
		212	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.						.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																								.	.	.	.	.
Query Sequence		D	S	H	T	T	M	I	N	G	L	G	V	L	G	W	G	V	G	G	I	E	A	E	A	A	M	L	G	Q	P	V	S	M	L	I	P	D	V	V	G	F	K	L	T	G	K	L	R	E	G	I	T	A	T	D	L	V	L	T	V	T	Q	M	L	R	K	H	G	V	V	.	.	.	.	.	G	K	F	V	E
Query Conservation																																																																								.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.																																																									.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.
Template Sequence		D	S	H	T	R	F	P	I	G	I	S	.	.	.	F	P	A	G	S	G	L	V	A	F	A	A	A	T	G	V	M	P	L	D	M	P	E	S	V	L	V	R	F	K	G	K	M	Q	P	G	I	T	L	R	D	L	V	H	A	I	P	L	Y	A	I	K	Q	G	L	L	T	V	E	K	K	G	K	K	N	I
Template Known Secondary structure		S	T	T				S	S	S			.	.	.															S	B															S				T	T																	T	T	S	B		S		S	T	T			B	T
Template Predicted Secondary structure													.	.	.
Template SS confidence
		497	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.				.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.
		287	.	.						290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	Y	G	.	.	.	.	.	D	G	L	D	S	L	P	L	A	D	R	A	T	I	A	N	M	S	P	E	Y	G	A	T	C	G	F	F	P	I	D	A	V	T	L	D	Y	M	R	L	S	G	R	S	E	D	Q	V	E	L	V	E	K	Y	A	K	A	Q	G	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation					.	.	.	.	.																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	S	G	R	I	L	E	I	E	G	L	P	D	L	K	V	E	Q	A	F	E	L	T	D	A	S	A	E	R	S	A	A	G	C	T	I	K	L	N	K	E	P	I	I	E	Y	L	N	S	N	I	V	L	L	K	W	M	I	A	E	G	Y	G	D	R	R	T	L	E	R	R	I	Q	G	M	E	K	W	L	A
Template Known Secondary structure		T	T	T	S						S		T	T												G	G	G	T	T	T		S																												T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		574	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.
					350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370		.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																						.
Query SS confidence		.	.	.																						.
Query Sequence		.	.	.	W	R	N	P	G	D	E	P	I	F	T	S	T	L	E	L	D	M	N	D	V	.	E	A	S	L	A	G	P	K	R	P	Q	D	R	V	A	L	P	D	V	P	K	A	F	A	A	S	N	E	L	E	V	N	A	T	H	K	D	R	Q	P	V	D	Y	V	M	N	G	H	Q	Y	Q	L	P	D	G
Query Conservation		.	.	.																						.
Alig confidence		.	.	.																						.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	P	E	L	L	E	A	D	A	D	A	E	Y	A	A	V	I	D	I	D	L	A	D	I	K	E	P	I	L	C	A	P	N	D	P	D	D	A	R	P	L	S	A	V	Q	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S								T	T				S							G	G	G			S						T	T		T	T					G	G	G	T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		654	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700
		426	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	V	V	I	A	A	I	T	S	C	T	N	T	S	N	P	S	V	L	M	A	A	G	L	L	A	K	K	A	V	T	L	G	L	K	R	Q	P	W	V	K	A	S	L	A	P	G	S	K	V	V	S	D	Y	L	A	K	A	K	L	T	P	Y	L	D	E	L	G	F	N	L	V	G	Y	G	C	T	T	C	I
Query Conservation
Alig confidence														.													.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.													.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	I	D	E	V	F	I	G	S	C	M	T	.	N	I	G	H	F	R	A	A	G	K	L	L	.	.	.	.	.	.	D	A	H	K	G	Q	L	P	T	R	L	W	V	A	P	P	T	R	M	D	A	A	Q	L	T	E	E	G	Y	Y	S	V	F	G	K	S	G	A	R	I	E	I	P	G	C	S	L	C	M
Template Known Secondary structure		B								S	T	T		.													.	.	.	.	.	.			S		S			S	S							S	B										T	T									T						S	S		G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure														.													.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		701	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.		.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.							.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.
		506	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	N	S	G	P	L	P	D	P	I	E	T	A	I	K	K	S	D	L	T	V	G	A	V	L	S	G	N	R	N	F	E	G	R	I	H	P	L	V	K	T	N	W	L	A	S	P	P	L	V	V	A	Y	A	L	A	G	N	M	N	I	N	L	A	S	E	P	I	G	H	D	R	K	G	D	P	V	Y	L	K
Query Conservation
Alig confidence					.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																						.	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Template Conservation					.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																						.	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Template Sequence		G	N	Q	.	A	R	V	A	D	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	V	V	S	T	S	T	R	N	F	P	N	R	L	G	T	.	G	A	N	V	F	L	A	S	A	E	L	A	A	V	A	A	L	I	G	K	L	.	.	.	.	.	P	T	P	E	E	Y	Q	T	.	.	.	.	.	Y	V	A
Template Known Secondary structure			S	S	.	S				T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S	S	S				T	T	S	S	S	T	.	T																		S	B		.	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure					.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																						.	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Template SS confidence
		774	.	.		.	.	.	780	.	.	.											.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.		800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820						.	.	.	.	.	.	.	.						.	830	.
		586	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	I	W	P	S	A	Q	E	I	A	R	A	V	E	Q	V	S	T	E	M	F	R	K	E	Y	A	E	V	F
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Q	V	D	K	T	A	V	D	T	Y	R	Y	L	N	F	N	Q	L	S	Q	Y	T	E	K	A	D	G	V	I
Template Known Secondary structure					T	T					T					G	G	G										T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		832	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860