Job Description P25516 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:41:52 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 456 % Identity 22% Template c1l5jB_ PDB info PDB header:lyase Chain: B: PDB Molecule:aconitate hydratase 2; PDBTitle: crystal structure of e. coli aconitase b. Resolution 2.40 Å

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		51	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	W	Q	D	G	N	S	V	T	E	E	D	I	H	A	L	A	G	W	L	K	N	A	H	A	D	R	E	I	A	Y	R	P	A	R	V	L	M	Q	D	F	T	G	V	P	A	V	V	D	L	A	A	M	R	E	A	V	K	R	L	G	G	D	T	A	K	V	N	P	L	S	P	V	D	L	V	I	D	H	S
Query Conservation
Alig confidence																																																							.	.	.	.											.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																							.	.	.	.											.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	E	S	D	R	G	F	S	L	A	Q	K	M	V	G	R	A	C	G	V	K	G	I	R	P	G	A	Y	C	E	P	K	M	T	S	V	G	S	Q	D	T	T	G	P	M	T	R	D	E	L	K	D	L	.	.	.	.	A	C	L	G	F	S	A	D	L	V	.	.	.	.	.	.	M	Q	S	F	C	H	T
Template Known Secondary structure						S													T	T	S	S				T	T						B		S						T	T	T											T	.	.	.	.	T		S	S			S	S			.	.	.	.	.	.						S	S
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.											.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.					.	430	.	.	.	.	.	.	.	.							.	440	.	.	.	.	.
		131	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.		.
Predicted Secondary structure																																																																																.
Query SS confidence																																																																																.
Query Sequence		V	T	V	D	R	F	G	D	D	E	A	F	E	E	N	V	R	L	E	M	E	R	N	H	E	R	Y	V	F	L	K	W	G	K	Q	A	F	S	R	F	S	V	V	P	P	G	T	G	I	C	H	Q	V	N	L	E	Y	L	G	K	A	V	W	S	E	L	Q	D	G	E	W	I	A	Y	P	D	T	L	.	V
Query Conservation																																																																																.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	A	Y	P	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	V	D	V	N	T	H	H	T	L	P	D	F	I	M	N	R	.	G	G	V	S	L	R	P	G	D	G	V	I	H	S	W	L	N	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	L	L	P	D	T	V	G	T
Template Known Secondary structure		S	S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																T	T	.	T						T	T	S	B							G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G			T	T
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		446	.	.	.	450																.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.		.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.																.	.	.	.	490	.	.	.	.
		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.													.	.
Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	T	D	S	H	T	T	M	I	N	G	L	G	V	L	G	W	G	V	G	G	I	E	A	E	A	A	M	L	G	Q	P	V	S	M	L	I	P	D	V	V	G	F	K	L	T	G	K	L	R	E	G	I	T	A	T	D	L	V	L	T	V	T	Q	M	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	K
Query Conservation																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.
Template Sequence		G	G	D	S	H	T	R	F	P	I	G	I	.	.	.	S	F	P	A	G	S	G	L	V	A	F	A	A	A	T	G	V	M	P	L	D	M	P	E	S	V	L	V	R	F	K	G	K	M	Q	P	G	I	T	L	R	D	L	V	H	A	I	P	L	Y	A	I	K	Q	G	L	L	T	V	E	K	K	G	K	K
Template Known Secondary structure			S	S	T	T				S	S	S		.	.	.																S	B															S				T	T																		T	S	B		S		S	T	T
Template Predicted Secondary structure														.	.	.
Template SS confidence
		495	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.				.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.
		278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	G	V	V	G	K	F	V	E	F	Y	G	D	G	L	D	S	L	P	L	A	D	R	A	T	I	A	N	M	S	P	E	Y	G	A	T	C	G	F	F	P	I	D	A	V	T	L	D	Y	M	R	L	S	G	R	S	E	D	Q	V	E	L	V	E	K	Y	A	K	A	Q	G	M	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.																																																											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.
Template Sequence		N	I	F	S	G	R	I	L	E	I	E	G	.	.	L	P	D	L	K	V	E	Q	A	F	E	L	T	D	A	S	A	E	R	S	A	A	G	C	T	I	K	L	N	K	E	P	I	I	E	Y	L	N	S	N	I	V	L	L	K	W	M	I	A	E	G	Y	G	D	R	R	T	L	E	R	R	I	Q	G	M	E
Template Known Secondary structure		B	T	T	T	T	S						S	.	.		T	T												G	G	G	G	G	T		S																													T		B
Template Predicted Secondary structure														.	.
Template SS confidence
		572	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.			.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.
									350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370		.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																						.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.																						.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	W	R	N	P	G	D	E	P	I	F	T	S	T	L	E	L	D	M	N	D	V	.	E	A	S	L	A	G	P	K	R	P	Q	D	R	V	A	L	P	D	V	P	K	A	F	A	A	S	N	E	L	E	V	N	A	T	H	K	D	R	Q	P	V	D	Y	V	M	N	G	H	Q	Y	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.																						.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																						.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	W	L	A	N	P	E	L	L	E	A	D	A	D	A	E	Y	A	A	V	I	D	I	D	L	A	D	I	K	E	P	I	L	C	A	P	N	D	P	D	D	A	R	P	L	S	A	V	Q	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						S								T	T				S							G	G	G			S						T	T		T	T									T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700
		422	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	P	D	G	A	V	V	I	A	A	I	T	S	C	T	N	T	S	N	P	S	V	L	M	A	A	G	L	L	A	K	K	A	V	T	L	G	L	K	R	Q	P	W	V	K	A	S	L	A	P	G	S	K	V	V	S	D	Y	L	A	K	A	K	L	T	P	Y	L	D	E	L	G	F	N	L	V	G	Y	G	C
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.													.													.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.													.													.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	K	I	D	E	V	F	I	G	S	C	M	T	.	N	I	G	H	F	R	A	A	G	K	L	L	.	.	.	.	.	.	D	A	H	K	G	Q	L	P	T	R	L	W	V	A	P	P	T	R	M	D	A	A	Q	L	T	E	E	G	Y	Y	S	V	F	G	K	S	G	A	R	I	E	I	P	G	C
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	B		S						S	T	T		.													.	.	.	.	.	.			S		S			S	S							S	B										T	T									T						S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.													.													.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						701	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.		.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.							.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		502	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.			.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																			.	.
Query SS confidence																																																																			.	.
Query Sequence		T	T	C	I	G	N	S	G	P	L	P	D	P	I	E	T	A	I	K	K	S	D	L	T	V	G	A	V	L	S	G	N	R	N	F	E	G	R	I	H	P	L	V	K	T	N	W	L	A	S	P	P	L	V	V	A	Y	A	L	A	G	N	M	N	I	.	.	N	L	A	S	E	P	I	G	H	D	R	K	G
Query Conservation																																																																			.	.
Alig confidence												.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																								.	.
Template Conservation												.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Template Sequence		S	L	C	M	G	N	Q	A	R	V	.	A	D	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	V	V	S	T	S	T	R	N	F	P	N	R	L	G	T	.	G	A	N	V	F	L	A	S	A	E	L	A	A	V	A	A	L	I	G	K	L	P	T	P	E	E	Y	Q	T	Y	V	A	Q	V	D	K	T	A
Template Known Secondary structure		G	G	G	T		S	S	S			.		T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S	S				T	T	S	S	S	T	.	T																		S	B													T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure												.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Template SS confidence
		770	.	.	.	.	.	.	.	.	.		780	.	.	.											.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.		800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.
		580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	P	V	Y	L	K	D	I	W	P	S	A	Q	E	I	A	R	A	V	E	Q	V	S	T	E	M	F	R
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.
Template Conservation						.	.	.
Template Sequence		V	D	T	Y	.	.	.	R	Y	L	N	F	N	Q	L	S	Q	Y	T	E	K	A	D	G	V	I	F	Q
Template Known Secondary structure					T	.	.	.					G	G	G										T
Template Predicted Secondary structure						.	.	.
Template SS confidence
		838	.	840	.				.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.