Job Description P0A8E1 Confidence 96.37% Date Thu Jan 5 11:07:36 GMT 2012 Rank 275 Aligned Residues 154 % Identity 15% Template d1wpxa1 SCOP info alpha/beta-Hydrolases alpha/beta-Hydrolases Serine carboxypeptidase-like Resolution 2.70

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		25	.	.	.	.	30	.		.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.						.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.										.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.																											.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.																											.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	D	P	D	V	R	L	.	I	S	Y	S	T	R	H	P	K	H	D	M	Q	H	L	L	K	E	V	D	K	M	L	Q	L	N	.	.	.	.	.	V	D	E	R	P	L	I	C	G	V	G	L	G	G	Y	W	A	E	R	I	G	F	L	C	D	I	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	V	I	F	N
Query Conservation									.																											.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.																											.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	N	V	G	F	S	Y	S	G	S	S	G	V	S	N	T	V	A	A	G	K	D	V	Y	N	F	L	E	L	F	F	D	Q	F	P	E	Y	V	N	K	G	Q	D	F	H	I	A	G	E	S	Y	A	G	H	Y	I	P	V	F	A	S	E	I	L	S	H	K	D	R	N	F	N	L	T	S	V	L	I	G	N
Template Known Secondary structure		T	T	S	T	T		B		S	S					S																				T					T										T	T																S	S		S	S									S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		97	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	N	L	F	P	Y	E	N	M	E	G	K	I	D	R	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	L	T	D	P	L	T	Q	Y	N	Y	Y	E	P	M	A	C	G	E	G	G	E	P	S	V	L	P	S	E	E	C	S	A	M	E	D	S	L	E	R	C	L	G	L	I	E	S	C	Y	D	S	Q	S	V	W	S	C	V	P	A	T	I	Y	C	N	N	A	Q	L	A	P	Y	Q	R	T	G	R	N	V	Y
Template Known Secondary structure										G	G	G						T	T		S	S	S				S																																											T						T	T	B		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
																																																						106	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	Y	A	D	I	A	T	K	C	V	T	N	F	R	E	K	N	R	D	R	C	L	V	I	L	S	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	I	R	K	D	C	E	G	G	N	L	C	Y	P	T	L	Q	D	I	D	D	Y	L	N	Q	D	Y	V	K	E	A	V	G	A	E	V	D	H	Y	E	S	C	N	F	D	I	N	R	N	F	L	F	A	G	D	W	M	K	P	Y	H	T	A	V	T	D	L	L	N	Q	D	L	P	I	L	V	Y	A	G	D
Template Known Secondary structure			T	T	S	B			S	S	T	T	S		T	T									T	S								T			S	S	S			S	B										T	T	T		T	T			T	T									T	T									T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.
		134	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.			.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Query Sequence		N	D	E	A	L	N	S	Q	R	T	S	E	E	L	H	H	Y	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	I	V	W	D	E	E	Q	T	H	K	.	.	F	K	N	I	S	P	H	L	Q	R	I	K	A	F	K	T
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	D	F	I	C	N	W	L	G	N	K	A	W	T	D	V	L	P	W	K	Y	D	E	E	F	A	S	Q	K	V	R	N	W	T	A	S	I	T	D	E	V	A	G	E	V	K	S	Y	K	H	F	T	Y	L	R	V	F	N	G	G	H	M	V	P	F	D	V	P	E	N	A	L	S	M	V	N	E	W	I	H
Template Known Secondary structure		T		S	T	T														S	T	T							S								T	T	T		S									T	T							T	T			S	S																		T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		337	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions