Job Description P77748 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:32:29 GMT 2012 Rank 20 Aligned Residues 418 % Identity 16% Template c3js8A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:cholesterol oxidase; PDBTitle: solvent-stable cholesterol oxidase Resolution 1.54 Å

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		41	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.							.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110		.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.	.													.
Query SS confidence																																																												.	.	.	.	.	.													.
Query Sequence		M	S	T	D	N	S	I	Y	Q	L	L	P	D	A	V	V	F	P	R	S	T	A	D	V	A	L	I	A	R	L	A	A	Q	E	R	Y	S	S	L	I	F	T	P	R	G	G	G	T	G	T	N	G	Q	A	L	N	Q	G	.	.	.	.	.	.	I	I	V	D	M	S	R	H	M	N	R	I	.	I	E	I
Query Conservation																																																												.	.	.	.	.	.													.
Alig confidence																																				.	.	.																						.	.	.	.	.	.													.
Template Conservation																																				.	.	.
Template Sequence		F	K	N	W	A	G	D	I	K	V	D	D	V	W	T	C	A	P	R	S	A	D	E	V	V	K	V	A	N	W	A	K	D	N	.	.	.	G	Y	K	V	R	A	R	G	M	M	H	N	W	S	P	L	T	L	A	A	G	V	S	C	P	A	V	V	L	L	D	T	T	R	Y	L	T	A	M	S	I	D	A
Template Known Secondary structure					T	T	S													S	S															.	.	.	T								S				S	S		S	S			T	T		S	S		S						T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.
Template SS confidence
		19	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.				.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.
		114	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.											.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	P	E	E	G	W	V	R	V	E	A	G	V	I	K	D	Q	L	N	Q	Y	L	K	P	F	G	Y	F	F	A	P	E	L	S	T	S	N	R	A	T	L	G	G	M	I	N	T	D	A	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	G	S	L	V	Y	G	K	T	S	D	H	V	L	G	V	R	A	V
Query Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																			.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.
Template Sequence		S	G	P	V	A	K	V	T	A	Q	A	G	I	T	M	E	A	L	L	T	G	L	E	K	A	G	L	G	V	T	A	A	P	.	A	P	G	D	L	T	L	G	G	V	L	A	I	N	G	H	G	T	A	I	P	A	K	G	E	R	R	L	A	G	A	S	Y	G	S	I	S	N	L	V	L	S	L	T	A	V
Template Known Secondary structure		S	S	S	S							T	T	S	B											T	T				S				.	S		S		S	B							T	T					B				T	T					T	T			S	S		G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																			.
Template SS confidence
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.		.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
		184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	G	G	D	I	L	D	T	Q	P	L	P	V	E	L	A	E	T	L	G	K	S	N	T	T	I	G	R	I	Y	N	T	V	Y	Q	R	C	R	Q	Q	R	Q	L	I	I	D	N	F	P	K	L	N	R	F	L	T	G	Y	D	L	R	H	V	F	N	D	E	M	T	E	F	D	L	T	R	I	L	T	G
Query Conservation
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	Y	D	K	A	S	G	A	Y	A	L	R	K	F	A	R	N	D	P	Q	I	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	A
Template Known Secondary structure					T	T	T	T									T	T	S	G	G	G			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	200
		264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.							.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																														.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	E	G	T	L	A	F	I	T	E	A	R	L	D	I	T	R	L	P	K	V	R	R	L	V	N	V	K	Y	D	S	F	D	S	A	L	R	N	A	P	F	M	V	E	A	R	A	L	S	V	E	T	V	D	S	K	V	L	N	L	.	.	.	.	.	.	A	R	E	D	I	V	W	H	S	V	S	E	L	I
Query Conservation																																																														.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.																											.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.																											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	V	G	.	R	S	L	I	V	E	A	T	L	Q	A	A	P	N	Q	R	L	R	C	Q	S	W	F	N	I	P	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	E	M	F	A	A	A	G	S	G	G	R	T	F	A	S	Y	L	D	S	A	G	R	V	E	A	I	W	F	P	F	T	S	N	P	W	L	K	V	W	T
Template Known Secondary structure			T	T	.	S	S																							S		.	.	.	.	.	.	.	.					T			S	S			S	S									T	S								T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure					.																											.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		201	.	.		.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.									230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
		338	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Query SS confidence																																																																																.	.
Query Sequence		T	D	V	P	D	Q	E	M	L	G	L	N	I	V	E	F	A	G	D	D	E	A	L	I	D	E	R	V	N	A	L	C	A	R	L	D	E	L	I	A	S	H	Q	A	G	V	I	G	W	Q	V	C	R	E	L	A	G	V	E	R	I	Y	A	M	R	K	K	A	V	G	L	L	G	N	A	K	G	A	.	.
Query Conservation																																																																																.	.
Alig confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	T	P	N	K	P	L	F	S	R	Q	T	D	K	P	F	N	Y	P	F	S	D	N	L	P	D	E	V	T	D	L	A	N	K	I	L	S	L	G	D	G	K	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	P	A	F	G	K	A	Q	F	A	A	A	S	A	G	L	V	A	T	A	S	W	D	L	W	G
Template Known Secondary structure				S	S			T	T					S	S	S								S														T	S			G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			T	T		S
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.												.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340
															416	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.												.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	K	P	I	P	F	A	E	D	T	C	V	P	P	E	H	L	A	D	Y	I	A	E	F	R	A	L	L	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	G	L	S	Y	G	M	F	G	H	V	D	A	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	S	K	N	L	L	L	Y	V	K	P	T	T	L	R	V	T	A	N	G	Y	A	V	L	T	R	R	E	N	V	Q	R	V	L	N	E	F	V	T	F	Y	Q	A	R	V	Q	A	Y	Q	Q	Q	G	R	Y	P	M	N	G	P	V	E	I	R	V	T	G	L	D	D	P	S	E	A	A	L	S	G	G	V	A
Template Known Secondary structure												T	T	S						B								G	G	G																						T	T						S												G	G	G	S	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		341	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
																				461	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.								.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.		.		.	.	.	.	.	510	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.																.		.									.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.																.		.									.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	H	V	R	P	A	L	D	M	C	D	P	Q	Q	E	I	L	M	K	Q	I	S	D	D	V	V	A	L	.	.	.	.	.	.	.	T	A	K	Y	G	G	L	L	W	G	E	H	G	K	G	.	F	.	R	A	E	Y	S	P	A	F	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.																.		.									.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.																.		.									.
Template Conservation
Template Sequence		P	A	L	S	A	I	R	P	R	P	D	H	P	E	W	N	V	A	V	W	L	D	I	L	T	L	P	G	T	P	Y	A	N	Q	F	Y	R	E	I	E	Q	W	I	E	A	N	F	N	G	S	Y	A	A	V	R	P	E	W	S	K	G	W	G	Y	T	D	Q	A	A	W	A	D	S	A	M	L	Q	T	T	I
Template Known Secondary structure			T	T		T	T				T	T		T	T													T	T		T	T																S		T	T	T							T	T	S	B		S			S	S		T	T								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		421	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
										513	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.		.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	F	G	E	E	L	F	A	E	L	R	K	V	K	A	A	F	D	P	H	N	R	L	.	N	P
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Conservation
Template Sequence		P	N	A	F	R	A	G	Q	P	A	A	A	N	W	D	A	A	K	A	A	L	A	A	Y	D	P	Y	R	L	F	S	S	P
Template Known Secondary structure					T	T	T	T			G	G	G	S													T	T			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		501	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.