Job Description P77748 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:32:29 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 438 % Identity 17% Template c3fwaA_ PDB info PDB header:flavoprotein Chain: A: PDB Molecule:reticuline oxidase; PDBTitle: structure of berberine bridge enzyme, c166a variant in complex with2 (s)-reticuline Resolution 1.50 Å

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		17	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.											.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	F	L	Q	E	L	E	Q	Q	G	F	T	G	D	T	A	T	S	Y	A	D	R	L	T	M	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	N	S	I	Y	Q	L	L	P	D	A	V	V	F	P	R	S	T	A	D	V	A	L	I	A	R	L	A	A	Q	E	R	Y	S	S	L	I	F	T	P	R	G	G
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.
Template Conservation																																																																						.	.	.
Template Sequence		D	L	L	S	C	L	T	F	N	G	V	R	N	H	T	V	F	S	A	D	S	D	S	D	F	N	R	F	L	H	L	S	I	Q	N	P	L	F	Q	N	S	L	I	S	K	P	S	A	I	I	L	P	G	S	K	E	E	L	S	N	T	I	R	C	I	R	K	G	.	.	.	S	W	T	I	R	L	R	S	G
Template Known Secondary structure										T	T									S		T	T	S									T				G	G	G		S	T	T	S				S							S													T	T	.	.	.	T							S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.
Template SS confidence
		26	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.				.	.	.	.	.	.	100	.	.
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.				.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.
Query SS confidence												.	.	.
Query Sequence		G	T	G	T	N	G	Q	A	L	N	.	.	.	Q	G	I	I	V	D	M	S	R	H	M	N	R	I	I	E	I	N	P	E	E	G	W	V	R	V	E	A	G	V	I	K	D	Q	L	N	Q	Y	L	K	P	F	G	Y	F	F	A	P	E	L	S	T	S	N	R	A	T	L	G	G	M	I	N	T	D	A	S
Query Conservation												.	.	.
Alig confidence												.	.	.										.					.
Template Conservation																								.					.
Template Sequence		G	H	S	Y	E	G	L	S	Y	T	S	D	T	P	F	I	L	I	D	L	M	N	.	L	N	R	V	.	S	I	D	L	E	S	E	T	A	W	V	E	S	G	S	T	L	G	E	L	Y	Y	A	I	T	E	S	S	S	K	L	G	F	T	A	G	W	A	P	T	V	G	T	G	G	H	I	S	G	G	G	F
Template Known Secondary structure					T	T		T	T	S			S	S								T	T	.					.				T	T	T	T						T	T		B													S	S							S		T	T	S	B							T
Template Predicted Secondary structure																								.					.
Template SS confidence
		103	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.		.	.	.	.		.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	Q	G	S	L	V	Y	G	K	T	S	D	H	V	L	G	V	R	A	V	L	L	G	G	D	I	L	D	T	Q	P	L	P	V	E	L	A	E	T	L	G	K	S	N	T	T	I	G	R	I	Y	N	T	V	Y	Q	R	C	R	Q	Q	R	Q	L	I	I	D	N	F	P	K	L	N	R	F	L	T	G	Y	D
Query Conservation
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	M	M	S	R	K	Y	G	L	A	A	D	N	V	V	D	A	I	L	I	D	A	N	G	A	I	L	D	R	Q	A	M	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			T	T							G	G	G	G									T	T												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		181	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.		.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.
Query SS confidence																																																				.
Query Sequence		L	R	H	V	F	N	D	E	M	T	E	F	D	L	T	R	I	L	T	G	S	E	G	T	L	A	F	I	T	E	A	R	L	D	I	T	R	L	P	K	V	R	R	L	V	N	V	K	Y	D	.	S	F	D	S	A	L	R	N	A	P	F	M	V	E	A	R	A	L	S	V	E	T	V	D	S	K	V	L	N
Query Conservation																																																				.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	V	F	W	A	I	R	G	G	G	G	G	V	W	G	A	I	Y	A	W	K	I	K	L	L	P	V	P	E	K	V	T	V	F	R	V	T	K	N	V	A	I	D	E	A	T	S	L	L	H	K	W	Q	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T	S		T	T	S	S															S																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
													215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	A	R	E	D	I	V	W	H	S	V	S	E	L	I	T	D	V	P	D	Q	E	M	L	G	L	N	I	V	E	F	A	G	D	D	E	A	L	I	D	E	R	V	N	A	L	C	A	R	L	D	E	L	I	A	S	H	Q	A	G	V	I	G	W	Q	V	C	R	E	L	A	G	V	E	R	I	Y	A	M	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	V	A	E	E	L	E	E	D	F	T	L	S	V	L	G	G	A	D	E	K	Q	V	W	L	T	M	L	G	F	H	F	G	L	K	T	V	A	K	S	T	F	D	L	L	F	P	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	V	E	E	D	Y	L	E	M	S	W	G	E	S	F	A	Y	L	A	G	L
Template Known Secondary structure		.	.					S		T	T											T	T											S	S														G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.				G	G	G														T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.									.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				460	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	K	A	V	G	L	L	G	N	A	K	G	A	A	K	P	I	P	F	A	E	D	T	C	V	P	P	E	H	L	A	D	Y	I	A	E	F	R	A	L	L	D	S	H	G	L	S	Y	G	M	F	G	H	V	D	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	L	H	V
Query Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	T	V	S	Q	L	N	N	R	F	L	K	F	D	E	R	A	F	K	T	K	V	D	L	T	K	E	P	L	P	S	K	A	F	Y	G	L	L	E	R	L	S	K	E	P	N	G	F	I	A	L	N	G	F	G	G	Q	M	S	K	I	S	S	D	F	T	P	F	P	H	R	S	G	T	R	L	M	V	E	Y
Template Known Secondary structure		S		G	G	G	G	G		T	T	S		S													S	S																T		T	T										G	G	G	G	T	S		T	T	S	S	S					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		339	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.
		464	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.		.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Query Sequence		R	P	A	L	D	M	C	D	P	Q	Q	E	I	L	M	K	Q	I	S	D	D	V	V	A	L	T	A	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	G	L	L	W	G	E	H	G	K	G	F	.	R	A	E	Y	S	P	A	F	F	G	E	E	L	F	A	E	L
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.												.
Template Conservation																																																																												.
Template Sequence		I	V	A	W	N	Q	S	E	Q	K	K	K	T	E	F	L	D	W	L	E	K	V	Y	E	F	M	K	P	F	V	S	K	N	P	R	L	G	Y	V	N	H	I	D	L	D	L	G	G	I	D	W	G	N	K	T	V	V	N	N	A	I	E	I	S	R	S	W	G	E	S	Y	F	L	S	.	N	Y	E	R	L
Template Known Secondary structure							G	G	G	G	G	G																T	T	T	S			S	S					G	G	G			G	G	G					T	T							T														G	G	.	G
Template Predicted Secondary structure																																																																												.
Template SS confidence
		419	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.		.	.	.	.	.
		522	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	K	V	K	A	A	F	D	P	H	N	R	L	N	P	G	K	I	C	P	P
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		I	R	A	K	T	L	I	D	P	N	N	V	F	N	H	P	Q	S	I	P	P
Template Known Secondary structure										T	T			S			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		498	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.