![]() |
|
![]() |
  | Insertion relative to template |
  | Deletion relative to template |
  | Catalytic residue from the CSA |
  | |
Detailed help on interpreting your alignment |
  |   | 573 | . | . | . | . | . | . | 580 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 590 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 600 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 610 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 620 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 630 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 640 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 650 | . | . |
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | R | G | A | M | E | C | N | G | N | G | L | C | F | N | F | D | A | R | S | P | M | C | P | S | M | K | I | T | Q | N | R | I | H | S | P | K | G | R | A | T | L | V | R | E | W | L | R | L | L | A | D | R | G | V | D | P | L | K | L | E | Q | E | L | P | E | S | G | V | S | L | R | T | L | I | A | R | T | R | N | S |
Template Sequence |   | E | A | I | R | K | T | C | E | I | P | S | T | V | A | A | . | . | . | . | . | . | C | P | T | G | A | L | K | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | . | . | . | . | . | . | T | T | ![]() | ![]() | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | . | . | . | ![]() | ![]() | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||
  |   | 205 | . | . | . | . | 210 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 653 | . | . | . | . | . | . | 660 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 670 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 680 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | W | H | A | N | K | G | E | Y | D | F | S | H | E | V | K | E | A | M | S | G | C | L | A | C | K | A | C | S | T | Q | C | P | I | K | I | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Sequence |   | P | D | M | K | N | K | T | I | K | V | D | V | E | . | . | . | . | . | . | K | C | M | Y | C | G | N | C | Y | T | M | C | P | G | M | P | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | T | T | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | . | . | . | . | . | . | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 227 | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |
Download: | Text version |
No model constructed - rank, confidence too low
Phyre is for academic use only
Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
  | ||||||||
|
|