Job Description P77748 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:32:29 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 409 % Identity 20% Template c2uuvC_ PDB info PDB header:transferase Chain: C: PDB Molecule:alkyldihydroxyacetonephosphate synthase; PDBTitle: alkyldihydroxyacetonephosphate synthase in p1 Resolution 1.99 Å

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		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.											.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	V	Q	L	V	L	N	F	L	Q	E	L	E	Q	Q	G	F	T	G	D	T	A	T	S	Y	A	D	R	L	T	M	S	T	D	N	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	Y	Q	L	L	P	D	A	V	V	F	P	R	S	T	A	D	V	A	L	I	A	R	L	A	A	Q	E	R	Y	S	S	L	I
Query Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.
Template Conservation																																																																												.	.	.
Template Sequence		P	P	K	Q	Y	P	E	F	V	R	E	L	K	A	F	F	L	P	D	Q	L	K	D	D	K	L	A	R	I	T	H	T	F	G	K	S	L	R	D	L	I	R	V	R	I	G	Q	V	K	N	A	P	D	L	I	V	L	P	H	S	H	E	E	V	E	R	L	V	Q	L	A	H	K	Y	.	.	.	N	V	V
Template Known Secondary structure																	S		G	G	G				S							T	T			S	S									T	T							S							S															.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.
Template SS confidence
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.				.	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.				.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.
Query Sequence		F	T	P	R	G	G	G	T	G	T	N	G	Q	A	L	N	.	.	.	Q	G	I	I	V	D	M	S	R	H	M	N	R	I	I	E	I	N	P	E	E	G	W	V	R	V	E	A	G	V	I	K	D	Q	L	N	Q	Y	L	K	P	F	G	Y	F	F	A	P	E	L	S	T	S	N	R	A	T	L	G	G	M
Query Conservation																		.	.	.
Alig confidence																		.	.	.										.
Template Conservation																														.
Template Sequence		I	I	P	M	G	G	G	S	N	I	V	G	A	I	E	P	V	E	R	F	T	V	S	I	D	M	R	R	.	M	N	K	V	L	W	V	D	R	R	E	M	T	A	C	I	Q	V	G	I	M	G	P	E	L	E	K	Q	L	H	K	Q	G	V	S	L	G	H	D	P	D	S	F	E	F	S	T	L	G	G	W
Template Known Secondary structure						S	S				S	S		T	T	S												T	T	.									T	T	T	T						T	T		B										T	T	T								T	T	G	G	G		B
Template Predicted Secondary structure																														.
Template SS confidence
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.		.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	N	T	D	A	S	G	Q	G	S	L	V	Y	G	K	T	S	D	H	V	L	G	V	R	A	V	L	L	G	G	D	I	L	D	T	Q	P	L	P	V	E	L	A	E	T	L	G	K	S	N	T	T	I	G	R	I	Y	N	T	V	Y	Q	R	C	R	Q	Q	R	Q	L	I	I	D	N	F	P	K	L	N	R
Query Conservation
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	A	T	C	S	S	G	H	Q	S	D	K	Y	G	D	I	E	D	M	A	V	S	F	R	T	V	T	P	T	G	T	L	E	L	R	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T				T	T																			T	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.			310	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																										.	.
Query SS confidence																																																																										.	.
Query Sequence		F	L	T	G	Y	D	L	R	H	V	F	N	D	E	M	T	E	F	D	L	T	R	I	L	T	G	S	E	G	T	L	A	F	I	T	E	A	R	L	D	I	T	R	L	P	K	V	R	R	L	V	N	V	K	Y	D	S	F	D	S	A	L	R	N	A	P	F	M	V	E	A	R	.	.	A	L	S	V	E	T
Query Conservation																																																																										.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																									.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	N	Y	K	H	I	I	L	G	S	E	G	T	L	G	I	I	T	E	A	V	M	K	V	H	A	V	P	Q	A	V	E	Y	Y	G	F	L	F	P	T	F	A	H	A	V	S	A	L	Q	Q	I	R	S	S	E	V	I	P	T	M	I	R	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T					T	T		T	T	T	T															S										S	S														T	T				S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	D	S	K	V	L	N	L	A	R	E	D	I	V	W	H	S	V	S	E	L	I	T	D	V	P	D	Q	E	M	L	G	L	N	I	V	E	F	A	G	D	D	E	A	L	I	D	E	R	V	N	A	L	C	A	R	L	D	E	L	I	A	S	H	Q	A	G	V	I	G	W	Q	V	C	R	E	L	A	G	V
Query Conservation
Alig confidence																																										.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	D	P	E	E	T	Q	L	S	F	A	W	K	P	M	V	K	K	Y	L	H	Y	I	R	S	F	D	F	K	N	V	C	L	S	I	I	G	F	E	G	.	P	K	K	V	V	D	F	H	R	T	S	V	F	D	I	L	S	K	N	A	A	F	G	L	G	S	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure												T	T											T	T	T	S		T	T	T											.																		T	T	T								S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																										.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.		.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.
		396	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	R	I	Y	A	M	R	K	K	A	V	G	L	L	G	N	A	K	G	A	A	K	P	I	P	F	A	E	D	T	C	V	P	P	E	H	L	A	D	Y	I	A	E	F	R	A	L	L	D	S	H	G	L	S	Y	G	M	F	G	H	V	D	A	G	V	L	H	V	R	P	A	L	D	M	C	D	P	Q	Q	E
Query Conservation
Alig confidence																																																				.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	K	T	W	A	E	K	R	Y	D	L	P	Y	I	R	D	F	L	L	D	H	N	M	W	V	D	V	A	E	T	T	V	S	Y	A	N	L	Q	T	L	W	K	D	A	K	Q	T	F	V	K	.	H	I	P	A	W	I	C	A	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	S	G	G	G	G	G	G	G	G											T	T																													.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																				.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		433	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.		.	.	.	.	.	.	.	490	.
		476	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	L	M	K	Q	I	S	D	D	V	V	A	L	T	A	K	Y	G	G	L	L	W	G	E	H	G	K	G	F	R	A	E	Y	S	P	A	F	F	G	E	E	L	F	A	E	L	R	K	V	K	A	A	F	D	P	H	N	R	L	N	P
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	S	H	T	Y	T	N	G	V	C	L	.	.	Y	F	I	F	A	S	K	Q	R	G	W	I	N	V	Y	R	S	L	K	E	T	I	D	P	K	D	I	C	N	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T					.	.										T														T	T			B	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template SS confidence
																				497	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.			.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.