Job Description P77748 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:32:29 GMT 2012 Rank 12 Aligned Residues 413 % Identity 14% Template c2ipiD_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: D: PDB Molecule:aclacinomycin oxidoreductase (aknox); PDBTitle: crystal structure of aclacinomycin oxidoreductase Resolution 1.65 Å

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		45	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.			.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.	.
Query SS confidence																																																						.	.
Query Sequence		N	S	I	Y	Q	L	L	P	D	A	V	V	F	P	R	S	T	A	D	V	A	L	I	A	R	L	A	A	Q	E	R	Y	S	S	L	I	F	T	P	R	G	G	G	T	G	T	N	G	Q	A	L	N	.	.	Q	G	I	I	V	D	M	S	R	H	M	N	R	I	I	E	I	N	P	E	E	G	W	V	R	V
Query Conservation																																																						.	.
Alig confidence																																.	.	.																				.	.										.					.
Template Conservation																																.	.	.																															.					.
Template Sequence		N	G	R	F	R	G	R	P	D	V	V	Y	V	V	H	T	A	D	Q	V	V	D	A	V	N	Q	A	M	A	A	.	.	.	G	Q	R	I	A	V	R	S	G	G	H	C	F	E	G	F	V	D	D	P	A	V	R	A	V	I	D	M	S	Q	.	M	R	Q	V	.	F	Y	D	S	G	K	R	A	F	A	V
Template Known Secondary structure		S	T	T						S							S														T	.	.	.	T							S	S				T	T		G	G	G		T	T								T	T	.					.				T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.																															.					.
Template SS confidence
		30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.				60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.		90	.	.	.		.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.
		123	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.								.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																								.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	A	G	V	I	K	D	Q	L	N	Q	Y	L	K	P	F	G	Y	F	F	A	P	E	L	S	T	S	N	R	A	T	L	G	G	M	I	N	T	D	A	S	G	Q	G	S	L	V	Y	G	K	T	S	D	H	V	L	G	V	R	A	V	L	L	G	G	D	I	L	D	T	.	.	.	.	.	.	.	Q	P	L
Query Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.																																										.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.
Template Sequence		E	P	G	A	T	L	G	E	T	Y	R	A	L	Y	L	D	W	G	V	T	I	P	A	G	V	C	P	Q	.	V	G	V	G	G	H	V	L	G	G	G	Y	G	P	L	S	R	R	D	G	V	V	A	D	H	L	Y	A	V	E	V	V	V	V	D	A	S	G	R	A	R	K	V	V	A	T	S	A	A	D	D
Template Known Secondary structure			T	T	S	B													S	B						S		T	T	.	S	B					G	G	G	T				T	T							G	G	G	G											T	T	S											T	T
Template Predicted Secondary structure																														.
Template SS confidence
		105	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.		.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.
		196	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	V	E	L	A	E	T	L	G	K	S	N	T	T	I	G	R	I	Y	N	T	V	Y	Q	R	C	R	Q	Q	R	Q	L	I	I	D	N	F	P	K	L	N	R	F	L	T	G	Y	D	L	R	H	V	F	N	D	E	M	T	E	F	D	L	T	R	I	L	T	G	S	E	G	T	L	A	F	I	T	E	A	R
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	N	R	E	L	W	W	A	H	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	G	N	F	G	I	V	T	R	Y	W
Template Known Secondary structure		T	T							T	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		S	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.																																																									.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
		276	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	D	I	T	R	L	P	K	V	R	R	L	V	N	V	K	Y	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	S	A	L	R	N	A	P	F	M	V	E	A	R	A	L	S	V	E	T	V	D	S	K	V	L	N	L	A	R	E	D	I	V	W	H	S	V	S	E	L	I	T	D
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	R	T	P	G	A	T	G	T	D	P	S	Q	L	L	P	K	A	P	T	S	T	L	R	H	I	V	T	W	D	W	S	A	L	T	E	E	A	F	T	R	I	I	D	N	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	W	H	Q	S	N	S	A	A	G	T	P	Y	A	S	M	H	S	V	F	Y
Template Known Secondary structure					S	S			S	S		G	G	G	S	S		B			S											T	T	T														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S	S		S	S	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.													.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.
		340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	P	D	Q	E	M	L	G	L	N	I	V	E	F	A	G	D	D	E	A	L	I	D	E	R	V	N	A	L	C	A	R	L	D	E	L	I	A	S	H	Q	A	G	V	I	G	W	Q	V	C	R	E	L	A	G	V	E	R	I	Y	A	M	R	K	K	A	V	G	L	L	G	N	A	K	G	A	A	K	P	I
Query Conservation
Alig confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	N	S	R	A	A	G	Q	I	L	L	D	I	Q	I	D	G	G	L	D	G	A	E	A	L	L	N	D	F	V	A	A	V	N	E	G	T	G	V	E	P	A	V	Q	R	S	T	E	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	L	R	A	T	L	A	N	K	F	D	T	G	G	F	D	R	T	K	S	K
Template Known Secondary structure					T	T	T	S										T	T	S	T	T													T	T	T		S	S											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T							T	T
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		276	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.											.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
		420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440																.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	F	A	E	D	T	C	V	P	P	E	H	L	A	D	Y	I	A	E	F	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	L	D	S	H	G	L	S	Y	G	M	F	G	H	V	D	A	G	V	L	H	V	R	P	A	L	D	M	C	D	P	Q	Q	E	I	L	M	K	Q	I	S	D	D
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template Conservation																																																					.
Template Sequence		G	A	Y	L	R	K	P	W	T	A	A	Q	A	A	T	L	Y	R	H	L	S	A	D	S	Q	V	W	G	E	V	S	L	Y	S	Y	G	G	K	V	N	S	V	P	E	T	A	T	A	T	A	Q	.	R	D	S	I	I	K	V	W	M	S	A	T	W	M	D	P	A	H	D	D	A	N	L	A	W	I	R	E
Template Known Secondary structure						S	S																S			S	S											G	G	G	G	G	S		T	T	S	S	S				.		S		S										S		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																					.
Template SS confidence
		346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.		.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.
		485	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	V	A	L	T	A	K	Y	G	G	L	L	W	G	E	H	G	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	R	A	E	Y	S	P	A	F	F	G	E	E	L	F	A	E	L	R	K	V	K	A	A	F	D	P	H	N	R	L	N	P	G	K	I	C	P	P	E
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template Conservation																																																				.
Template Sequence		I	Y	R	E	I	F	A	T	T	G	G	V	P	V	P	D	D	R	T	E	G	T	F	I	N	Y	P	D	V	D	L	V	D	E	R	W	N	T	S	G	V	P	W	Y	T	L	Y	Y	K	G	.	N	Y	P	R	L	Q	K	V	K	A	R	W	D	P	R	D	V	F	R	H	A	L	S	V	R	P	P
Template Known Secondary structure							T	T	T	T	T	T	S			S	S	S	S	B					T	T	S			G	G	G	G		T	T	T	S			S	S								G	G	.	G													T	T			S			T	T
Template Predicted Secondary structure																																																				.
Template SS confidence
		425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.		.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.