Job Description P08202 Confidence 99.98% Date Thu Jan 5 11:00:56 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 444 % Identity 14% Template c3a9rA_ PDB info PDB header:isomerase Chain: A: PDB Molecule:d-arabinose isomerase; PDBTitle: x-ray structures of bacillus pallidus d-arabinose2 isomerasecomplex with (4r)-2-methylpentane-2,4-diol Resolution 1.77 Å

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		11	.	.	.	.	.					.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.		50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.																																		.
Query SS confidence								.	.	.	.																																		.
Query Sequence		F	V	I	G	S	Q	.	.	.	.	H	L	Y	G	P	E	T	L	R	Q	V	T	Q	H	A	E	H	V	V	N	A	L	N	T	E	A	K	L	P	C	K	L	V	.	L	K	P	L	G	T	T	P	D	E	I	T	A	I	C	R	D	A	N	Y	D	D	R	C	A	G	L	V	V	W	L	H	T	F	S	P
Query Conservation								.	.	.	.																																		.
Alig confidence								.	.	.	.																																		.																				.
Template Conservation																																																																	.
Template Sequence		T	I	D	G	R	R	K	G	V	R	E	S	L	E	E	T	T	M	N	M	A	K	A	V	A	K	L	L	E	E	N	V	F	Y	Y	N	G	Q	P	V	E	C	V	I	A	D	T	C	I	G	G	V	K	E	A	A	E	A	A	E	K	F	A	.	R	E	G	V	G	V	S	I	T	V	T	P	C	W	C	Y
Template Known Secondary structure		B					T	T	T	T	T	T	T	T																				B		T	T	S		B							S	S		B		S													.			T									S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																	.
Template SS confidence
		19	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.		.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150					.	.	.					.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.				.	.	.	.
Query SS confidence																																																																			.	.	.	.				.	.	.	.
Query Sequence		A	K	M	W	I	N	G	L	T	M	L	N	K	P	L	L	Q	F	H	T	Q	F	N	A	A	L	P	W	D	S	I	D	M	D	F	M	N	L	N	Q	T	A	H	G	G	R	E	F	G	F	I	G	A	R	M	R	Q	Q	H	A	V	V	T	G	H	.	.	.	.	W	Q	D	.	.	.	.	K	Q	A	H
Query Conservation																																																																			.	.	.	.				.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.				.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	T	E	T	M	D	M	D	P	H	I	P	K	A	V	W	G	F	N	.	.	.	G	T	E	R	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	V	Y	L	A	A	V	L	A	G	Y	N	Q	K	G	L	P	A	F	G	I	Y	G	K	D	V	Q	D	A	G	D	T	N	I	P	E	D	V	K
Template Known Secondary structure										T	T	S									.	.	.		S	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																T									S	S				T	T
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		98	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.				.	.	.	120	.														.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220			.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.
Query Sequence		E	R	I	G	S	W	M	R	Q	A	V	S	K	Q	D	T	R	H	L	K	V	C	R	F	G	D	N	M	R	E	V	A	V	T	D	G	D	K	V	A	A	Q	I	K	F	G	F	S	V	N	T	W	A	V	G	D	L	V	Q	V	V	N	S	.	.	I	S	D	G	D	V	N	A	L	V	D	E	Y	E	S
Query Conservation																																																																	.	.
Alig confidence																																																																	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	K	L	I	R	F	A	K	A	G	L	A	V	A	M	M	K	G	K	S	Y	L	S	I	G	S	V	S	M	G	I	A	G	S	V	V	Q	E	D	F	F	Q	N	Y	L	G	M	R	N	E	Y	V	D	M	S	E	F	V	R	R	I	E	L	G	I	Y	D	K	E	E	Y	E	R	A	L	K	W	V	K	E
Template Known Secondary structure																		T	T							S	S			T	T		G	G	G	S																			T									T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.				.	.	.	.	.	290	.	.	.
Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.
Query SS confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.
Query Sequence		C	Y	T	M	T	P	A	T	Q	I	H	G	K	K	R	Q	N	V	L	E	A	A	R	I	E	L	G	M	K	R	F	L	E	Q	G	G	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	A	F	T	T	T	F	E	D	L	H	G	.	.	.	L	K	Q	L	P	G	L	A	V
Query Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.
Alig confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	C	K	V	G	P	D	N	N	R	D	G	F	K	R	T	E	E	Q	K	E	K	D	W	E	I	S	V	K	M	A	L	I	A	R	D	L	M	V	G	N	K	K	L	E	E	M	G	Y	G	E	E	A	L	G	R	N	A	I	V	A	G	F	Q	G	Q	R	Q	W	T	D	Y	F	P	N	G	D	F	M	E
Template Known Secondary structure					B					S		G	G	G																																		T	T																		T	T	T	T	T	T	T	S			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
		294	.	.	.	.									.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.																.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	R	L	M	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	G	Y	G	F	A	G	E	G	D	W	K	T	A	A	L	L	R	I	M	K	V	M	S	T	G	L	Q	G	G	T	S	F	M	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	T	Y	H	F	E	K	G	N	D	L	V	L	G	S	H
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.
Template Sequence		T	I	L	N	S	S	F	D	W	N	G	K	R	A	P	Y	I	F	A	T	E	N	D	N	L	N	G	I	S	M	L	F	G	Y	L	L	T	N	T	.	.	.	.	A	Q	I	F	A	D	V	R	T	Y	W	S	P	E	A	V	K	R	V	T	G	Y	T	L	E	G	R	A	A	N	G	I	I	H	L	I	N
Template Known Secondary structure						S	S			T	T											T	T																	S	.	.	.	.																					S					G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.
Template SS confidence
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360					.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
		351	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	370	.		.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.																			.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.																			.
Query Sequence		M	L	E	V	C	P	S	I	A	A	E	E	K	P	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	V	Q	H	L	.	G	I	G	G	K	D	D	P	A	R	L	I	F	N	T	Q	T	G	.	P	A	I	V	A	S	L	I	D	L	G	D	R	Y	R	L	L
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.																			.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.																			.
Template Conservation
Template Sequence		S	G	A	A	A	L	D	G	T	G	E	Q	T	K	D	G	K	P	V	I	K	P	Y	Y	E	L	T	D	E	D	I	K	K	C	L	E	A	T	Q	F	R	P	A	S	T	E	Y	F	R	G	G	G	Y	S	T	D	F	L	T	K	G	G	M	P	V	T	I	S	R	L	N	I	V	K	G	L	G	P	V	L
Template Known Secondary structure		S	S				G	G	G	G						T	T							G	G	G												T								T	T	T		T	T								B			S	S												T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
			407	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.										420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.								.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.														.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.														.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	V	N	C	I	D	T	V	K	T	P	H	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	L	P	V	A	N	A	L	W	K	A	Q	P	.	.	.	.	.	.	.	D	L	P	T	A	S	E	A	W	I	L	A	G	G	A	H	H	T	V	F	S	H	A	L	N	L	N	D	M	R	Q	F	A	E	M	H
Query Conservation		.														.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.														.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.							.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.
Template Conservation																															.	.																							.	.	.	.
Template Sequence		Q	I	A	E	G	Y	T	V	D	L	P	E	E	V	H	D	V	L	D	K	R	T	D	P	T	W	P	T	T	.	.	W	F	V	P	N	L	T	G	E	G	A	F	K	D	V	Y	S	V	M	N	N	W	.	.	.	.	G	A	N	H	C	S	I	S	Y	G	H	I	G	A	D	L	I	T	L	A	S	I	L
Template Known Secondary structure																						T	T		T	T	S		B		.	.								S	S	G	G	G	S	S							T		.	.	.	.		S	S							S
Template Predicted Secondary structure																															.	.																							.	.	.	.
Template SS confidence
		478	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.			.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.					.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.
		470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	I	E	I	T	V	I	D	N	D	T	R
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	I	P	V	N	M	H	N	V	P	E	E
Template Known Secondary structure		T										G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		552	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.