Job Description P0AC53 Confidence 89.69% Date Thu Jan 5 11:17:11 GMT 2012 Rank 57 Aligned Residues 335 % Identity 13% Template c3v5nA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:oxidoreductase; PDBTitle: the crystal structure of oxidoreductase from sinorhizobium meliloti Resolution 2.80 Å

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		17	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	K	G	D	L	A	R	R	K	L	L	P	S	L	Y	Q	L	E	K	A	G	Q	L	N	P	D	T	R	I	I	G	V	G	R	A	D	W	D	K	A	A	Y	T	K	V	V	R	E	A	L	E	T	F	M	K	E	T	I	D	E	G	L	W	D	T	L	S	A	R	L	D	F	C	N	L	D	V	N	D	T
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	G	G	A	F	I	G	A	V	H	R	I	A	A	R	L	.	.	.	.	.	.	.	D	D	H	Y	E	L	V	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	L	S	S	T	P	E	K	A	E	A	S	G	R	E	L	G	L	D	P	S	R	V	Y	S	D
Template Known Secondary structure		S																.	.	.	.	.	.	.	T	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S	S												T			G	G	G	B		S
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		21	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.								.	.	.	40	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.
		97	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	A	F	S	R	L	G	A	M	L	D	Q	K	N	R	I	T	I	N	Y	F	A	M	P	P	S	T	F	G	A	I	C	K	G	L	G	E	A	K	L	N	A	K	P	A	R	V	V	M	E	K	P	L	G	T	S	L	A	T	S	Q	E	I	N	D	Q	V	G	E	Y	F	E	E	C	Q	V	Y	R	I	D
Query Conservation
Alig confidence																				.																				.	.	.	.	.
Template Conservation																				.																				.	.	.	.	.
Template Sequence		F	K	E	X	A	I	R	E	A	K	L	K	N	G	I	E	A	V	.	A	I	V	T	P	N	H	V	H	Y	A	A	A	K	E	F	L	K	R	.	.	.	.	.	G	I	H	V	I	C	D	K	P	L	T	S	T	L	A	D	A	K	K	L	K	K	A	A	D	E	S	D	A	L	F	V	L	T	H	N	Y
Template Known Secondary structure													T	T			S			.				S		T	T	S										T	T	.	.	.	.	.	T							S	S	S		S	S															S	S							G	G
Template Predicted Secondary structure																				.																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.		.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110						.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
		177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	Y	L	G	K	E	T	V	L	N	L	L	A	L	R	F	A	N	S	L	F	V	N	N	W	D	N	R	T	I	D	H	V	E	I	T	V	A	E	E	V	G	I	E	G	R	W	G	Y	F	D	K	A	G	Q	M	R	D	M	I	Q	N	H	L	L	Q	I	L	C	M	I	A	M	S	P	P	S	D	L	S
Query Conservation
Alig confidence					.	.																		.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.																		.																	.	.
Template Conservation					.	.																		.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.																		.																	.	.
Template Sequence		T	G	Y	.	.	P	X	V	R	Q	A	R	E	X	I	E	N	G	D	I	G	A	.	.	.	.	.	.	.	V	R	L	V	Q	X	E	Y	.	.	.	.	.	.	.	P	Q	D	W	L	T	E	N	G	G	S	T	G	D	I	G	T	.	H	A	Y	N	L	G	C	F	V	S	G	L	E	L	E	E	.	.
Template Known Secondary structure		G	G	S	.	.												T	T	T	T		S	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.				T	T	S									T			.																	.	.
Template Predicted Secondary structure					.	.																		.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.																		.																	.	.
Template SS confidence
		148	.	150			.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.								.	.	170	.	.	.	.	.								.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.		.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.
		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	D	S	I	R	D	E	K	V	K	V	L	K	S	L	R	R	I	D	R	S	N	V	R	E	K	T	V	R	G	Q	Y	T	A	G	F	A	Q	G	K	K	V	P	G	Y	L	E	E	E	G	A	N	K	S	S	N	T	E	T	F	V	A	I	R	V	D	I	D	N	W	R	W	A	G	V	P	F	Y	L	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	A	D	L	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	V	G	G	R	Q	L	D	D	N	A	H	V	L	X	R	F	R	E	K	D	G	T	R	A	K	G	X	L	W
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	T	T			S													B	T	T	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																													229	230	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
		337	.	.	340	.	.			.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.
Query SS confidence								.	.
Query Sequence		T	G	K	R	L	P	.	.	T	K	C	S	E	V	V	V	Y	F	K	T	P	E	L	N	L	F	K	E	S	W	Q	D	L	P	Q	N	K	L	T	I	R	L	Q	P	D	E	G	V	D	I	Q	V	L	N	K	V	P	G	L	D	H	K	H	N	L	Q	I	T	K	L	D	L	S	Y	S	E	T	F	N	Q
Query Conservation								.	.
Alig confidence								.	.																		.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		C	S	Q	V	A	P	G	H	E	N	G	L	X	V	R	V	Y	G	T	K	G	G	L	E	W	.	.	.	.	.	T	Q	K	D	P	N	Y	L	W	Y	T	P	F	G	E	P	K	R	L	L	T	R	.	.	.	.	.	.	.	.	A	G	A	G	A	S	P	A	A	A	R	V	S	R	I	P	S	G	H	P
Template Known Secondary structure				S			T	T		S	S									S	S						.	.	.	.	.		T	T	S	T	T							T	T	S							T	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	T	T							T	T			S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290						.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.									.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.
		415	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430								.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	H	L	A	D	A	Y	E	R	L	L	L	E	T	M	R	.	.	.	.	.	.	.	G	I	Q	A	L	F	V	R	R	D	E	V	E	E	A	W	K	W	V	D	S	I	T	E	A	W	A	M	D	N	D
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	G	Y	L	E	G	F	A	N	I	Y	S	E	A	A	R	A	I	Y	A	K	R	A	D	P	S	V	I	Y	P	T	I	D	D	G	X	R	G	X	T	F	V	D	A	C	V	R	S	S	E	R	N	G	A
Template Known Secondary structure																					T	T				T	T																									T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		333	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.