Job Description P0AC53 Confidence 93.99% Date Thu Jan 5 11:17:11 GMT 2012 Rank 47 Aligned Residues 323 % Identity 15% Template c3q2kB_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: B: PDB Molecule:oxidoreductase; PDBTitle: crystal structure of the wlba dehydrogenase from bordetella pertussis2 in complex with nadh and udp-glcnaca Resolution 2.13 Å

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		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	C	D	L	V	I	F	G	A	K	G	D	L	A	R	R	K	L	L	P	S	L	Y	Q	L	E	K	A	G	Q	L	N	P	D	T	R	I	I	G	V	G	R	A	D	W	D	K	A	A	Y	T	K	V	V	R	E	A	L	E	T	F	M	K	E	T	I	D	E	G	L	W	D	T	L	S	A	R	L	D	F
Query Conservation
Alig confidence										.								.							.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template Conservation										.								.							.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template Sequence		K	I	R	F	G	L	V	G	.	C	G	R	I	S	K	N	.	H	I	G	A	I	A	.	.	.	.	.	.	Q	H	G	D	R	A	E	L	V	E	I	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	T	N	P	E	A	L	Q	A	A	E	A	A	T	.	.
Template Known Secondary structure										.		S	T	T				.						T	.	.	.	.	.	.	T		T	T	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S												.	.
Template Predicted Secondary structure										.								.							.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.		.	.	20	.	.	.	.		.	.	.	.	.	30							.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	N	L	D	V	N	D	T	A	A	F	S	R	L	G	A	M	L	D	Q	K	N	R	I	T	I	N	Y	F	A	M	P	P	S	T	F	G	A	I	C	K	G	L	G	E	A	K	L	N	A	K	P	A	R	V	V	M	E	K	P	L	G	T	S	L	A	T	S	Q	E	I	N	D	Q	V	G	E	Y	F	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																					.																				.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																					.																				.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	G	A	R	P	F	S	S	L	S	D	M	L	A	Q	G	N	A	D	A	L	.	V	L	A	T	P	S	G	L	H	P	W	Q	A	I	E	V	A	Q	A	.	.	.	.	.	G	R	H	V	V	S	E	K	P	M	A	T	R	W	E	D	G	K	R	M	V	K	A	C	D	E	A	G	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.			B			S	S											S			.				S		G	G	G											T	.	.	.	.	.	T							S	S	S		S	S															T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																					.																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
								57	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.		.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.						.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.						.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.
Query Sequence		E	C	Q	V	Y	R	I	D	H	Y	L	G	K	E	T	V	L	N	L	L	A	L	R	F	A	N	S	L	F	V	N	N	W	D	N	R	T	I	D	H	V	E	I	T	V	A	.	.	.	.	.	E	E	V	G	I	E	G	R	W	G	Y	F	D	K	A	G	Q	M	R	D	M	I	Q	N	H	L	L	Q	I
Query Conservation																																																.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.																										.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.																										.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	.	.	L	F	V	V	K	Q	N	R	R	N	A	T	L	Q	L	V	K	K	A	I	E	Q	G	R	F	.	.	.	.	.	.	.	G	R	I	Y	M	V	T	V	N	V	F	W	T	R	P	Q	E	Y	Y	D	A	A	R	W	R	G	K	W	E	W	D	G	G	A	F	M	N	Q	A	S	H	Y	V	D	L
Template Known Secondary structure			.	.						G	G	G	G													T	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.		S											B							T	T	S	T	T	T	T		T	T	T	T								T
Template Predicted Secondary structure			.	.																										.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		125			.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150								.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	C	M	I	A	M	S	P	P	S	D	L	S	A	D	S	I	R	D	E	K	V	K	V	L	K	S	L	R	R	I	D	R	S	N	V	R	E	K	T	V	R	G	Q	Y	T	A	G	F	A	Q	G	K	K	V	P	G	Y	L	E	E	E	G	A	N	K	S	S	N	T	E	T	F	V	A	I	R	V	D	I
Query Conservation
Alig confidence							.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	D	W	L	V	.	G	P	V	E	S	V	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	Y	T	A	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	R	R	I	E	A	E	D	T	G	V	A	A	L	R	W
Template Known Secondary structure							.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S	S	S	S		S
Template Predicted Secondary structure							.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		196	.	.	.	200		.	.	.	.	.	.	.																												.	.	210	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	N	W	R	W	A	G	V	P	F	Y	L	R	T	G	K	R	L	P	T	K	C	S	E	V	V	V	Y	F	K	T	P	E	L	N	L	F	K	E	S	W	Q	D	L	P	Q	N	K	L	T	I	R	L	Q	P	D	E	G	V	D	I	Q	V	L	N	K	V	P	G	L	D	H	K	H	N	L	Q	I	T	K
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	H	.	.	.	.	G	A	M	G	S	I	N	V	T	M	L	T	Y	P	Q	N	L	E	G	S	I	T	I	L	G	E	K	G	T	V	R	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	V	A	V	N	R	I	D	E
Template Known Secondary structure		T	T	.	.	.	.	S									S	B		S	S	S											S	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		230	.					.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
		404	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	D	L	S	Y	S	E	T	F	N	Q	T	H	L	A	D	A	Y	E	R	L	L	L	E	T	M	R	G	I	Q	A	L	F	V	R	R	D	E	V	E	E	A	W	K	W	V	D	S	I	T	E	A	W	A	M	D	N	D	A	P	K	P	Y	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		W	K	F	A	E	P	H	P	D	D	D	K	F	G	H	P	L	Y	Y	D	N	V	I	N	C	L	R	G	D	C	E	P	E	T	D	G	R	E	G	L	Q	S	L	A	L	L	T	A	I	Y	R	S	A	R	D	G	V	R	I	P	L	P	L	D
Template Known Secondary structure					S	S			G	G	G																		T	S	S			S	S	B																						S				S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.