Job Description P0AC53 Confidence 97.00% Date Thu Jan 5 11:17:11 GMT 2012 Rank 21 Aligned Residues 321 % Identity 14% Template c3ec7C_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: C: PDB Molecule:putative dehydrogenase; PDBTitle: crystal structure of putative dehydrogenase from salmonella2 typhimurium lt2 Resolution 2.15 Å

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		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	V	I	F	G	A	K	G	D	L	A	R	R	K	L	L	P	S	L	Y	Q	L	E	K	A	G	Q	L	N	P	D	T	R	I	I	G	V	G	R	A	D	W	D	K	A	A	Y	T	K	V	V	R	E	A	L	E	T	F	M	K	E	T	I	D	E	G	L	W	D	T	L	S	A	R	L	D	F	C	N	L
Query Conservation
Alig confidence								.					.											.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.					.											.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	G	I	V	G	I	.	G	X	I	G	.	S	D	H	L	R	R	L	A	N	T	.	.	.	.	.	.	V	S	G	V	E	V	V	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	D	I	V	A	G	R	A	Q	A	A	L	D	K	Y	A	I	E	A	K
Template Known Secondary structure								.	S				.										T	.	.	.	.	.	.		T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S	T	T									T	T
Template Predicted Secondary structure								.					.											.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10		.	.	.	.		.	.	.	.	.	20	.	.	.	.							.	.	.	.	.	30	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	V	N	D	T	A	A	F	S	R	L	G	A	M	L	D	Q	K	N	R	I	T	I	N	Y	F	A	M	P	P	S	T	F	G	A	I	C	K	G	L	G	E	A	K	L	N	A	K	P	A	R	V	V	M	E	K	P	L	G	T	S	L	A	T	S	Q	E	I	N	D	Q	V	G	E	Y	F	E	E	C	Q
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.														.																				.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.														.																				.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.
Template Sequence		D	Y	N	D	.	.	.	.	.	.	Y	H	D	L	I	N	D	K	D	V	E	V	V	.	I	I	T	A	S	N	E	A	H	A	D	V	A	V	A	A	L	N	A	.	.	.	.	.	N	K	Y	V	F	C	E	K	P	L	A	V	T	A	A	D	C	Q	R	V	I	E	A	E	Q	K	N	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				S	S	.	.	.	.	.	.								T	T					.				S															T	.	.	.	.	.	T							S	S	S		S	S														T	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.														.																				.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.
Template SS confidence
		54	.	.	.							.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70		.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.						90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.
		172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.			.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.
Query SS confidence																											.	.
Query Sequence		V	Y	R	I	D	H	Y	L	G	K	E	T	V	L	N	L	L	A	L	R	F	A	N	S	L	.	.	F	V	N	N	W	D	N	R	T	I	D	H	V	E	I	T	V	A	E	E	V	G	I	E	G	R	W	G	Y	F	D	K	A	G	Q	M	R	D	M	I	Q	N	H	L	L	Q	I	L	C	M	I	A	M
Query Conservation																											.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.																											.															.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																																														.															.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	R	X	V	Q	I	G	F	X	R	R	Y	D	K	G	Y	V	Q	L	K	N	I	I	D	S	G	E	I	G	Q	P	L	X	V	H	G	R	H	Y	N	A	S	T	V	.	P	E	Y	K	T	P	Q	A	I	Y	E	T	L	I	.	H	E	I	D	V	X	H	W	L	L	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	T	S								G	G	G	G	S													T	T	T		S											S				.	T	T									T	T			.											T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																																														.															.
Template SS confidence
										117	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.		.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.		.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.
		250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	P	P	S	D	L	S	A	D	S	I	R	D	E	K	V	K	V	L	K	S	L	R	R	I	D	R	S	N	V	R	E	K	T	V	R	G	Q	Y	T	A	G	F	A	Q	G	K	K	V	P	G	Y	L	E	E	E	G	A	N	K	S	S	N	T	E	T	F	V	A	I	R	V	D	I	D	N	W	R	W	A
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	D	Y	K	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	V	Y	F	P	R	Q	S	S	L	V	T	T	L	R	D	P	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S			T	T			S	S			S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		187	.	.	190	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	V	P	F	Y	L	R	T	G	K	R	L	P	T	K	C	S	E	V	V	V	Y	F	K	T	P	E	L	N	L	F	K	E	S	W	Q	D	L	P	Q	N	K	L	T	I	R	L	Q	P	D	E	G	V	D	I	Q	V	L	N	K	V	P	G	L	D	H	K	H	N	L	Q	I	T	K	L	D	L	S	Y	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	V	V	X	E	T	T	S	G	I	N	I	V	V	E	V	F	V	N	C	Q	Y	G	Y	D	I	H	C	D	V	T	G	E	K	G	.	.	.	.	.	X	A	E	L	P	T	V	A	S	A	A	V	R	K	A	A	K	Y	S	T	D	I	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T										T	T		S	S											S	S		.	.	.	.	.															T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
																			211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.						.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.					430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.
Query Sequence		E	T	F	N	Q	T	H	L	A	D	A	Y	E	R	L	L	L	E	T	M	.	.	.	.	R	G	I	Q	A	L	F	V	R	R	D	E	V	E	E	A	W	K	W	V	D	S	I	T	E	A	W	A	M	D	N	D	A	P	K	P	Y	Q	A	G
Query Conservation																						.	.	.	.
Alig confidence					.																	.	.	.	.
Template Conservation					.
Template Sequence		V	D	W	.	K	Q	R	F	I	D	A	Y	D	I	E	F	Q	D	F	F	D	R	L	N	A	G	L	P	P	A	G	P	T	S	W	D	G	Y	L	A	A	V	T	A	D	A	C	V	K	S	Q	E	T	G	N	T	E	I	V	E	L	P	S	K
Template Known Secondary structure				G	.	G	G	T	T																	T	T					S	S																						S	S
Template Predicted Secondary structure					.
Template SS confidence
		269	270	.		.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.