Job Description P0AC53 Confidence 96.49% Date Thu Jan 5 11:17:11 GMT 2012 Rank 33 Aligned Residues 308 % Identity 17% Template c3e9mC_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: C: PDB Molecule:oxidoreductase, gfo/idh/moca family; PDBTitle: crystal structure of an oxidoreductase from enterococcus2 faecalis Resolution 2.70 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	A	C	D	L	V	I	F	G	A	K	G	D	L	A	R	R	K	L	L	P	S	L	Y	Q	L	E	K	A	G	Q	L	N	P	D	T	R	I	I	G	V	G	R	A	D	W	D	K	A	A	Y	T	K	V	V	R	E	A	L	E	T	F	M	K	E	T	I	D	E	G	L	W	D	T	L	S	A	R	L	D
Query Conservation
Alig confidence											.								.									.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.								.									.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	K	I	R	Y	G	I	X	S	.	T	A	Q	I	V	P	R	.	F	V	A	G	L	R	E	S	.	.	.	.	.	.	.	A	Q	A	E	V	R	G	I	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	R	R	L	E	N	A	Q	K	X	A	K	E	L	A
Template Known Secondary structure											.			T	T				.								S	.	.	.	.	.	.	.	S	S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S											T	T
Template Predicted Secondary structure											.								.									.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10		.	.	.	.	.	.	.		.	.	20	.	.	.	.	.								.	.	.	.	30	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		F	C	N	L	D	V	N	D	T	A	A	F	S	R	L	G	A	M	L	D	Q	K	N	R	I	T	I	N	Y	F	A	M	P	P	S	T	F	G	A	I	C	K	G	L	G	E	A	K	L	N	A	K	P	A	R	V	V	M	E	K	P	L	G	T	S	L	A	T	S	Q	E	I	N	D	Q	V	G	E	Y	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence						.				.	.	.	.	.	.														.																							.	.	.	.	.																									.
Template Conservation						.				.	.	.	.	.	.														.																							.	.	.	.	.
Template Sequence		I	P	V	A	.	Y	G	S	.	.	.	.	.	.	Y	E	E	L	C	K	D	E	T	I	D	I	I	.	Y	I	P	T	Y	N	Q	G	H	Y	S	A	A	K	L	A	L	S	Q	G	K	P	.	.	.	.	.	V	L	L	E	K	P	F	T	L	N	A	A	E	A	E	E	L	F	A	I	A	Q	E	Q	G
Template Known Secondary structure					B	.		S	S	.	.	.	.	.	.						T		T	T		S			.						T	T												T	T			.	.	.	.	.					S	S			S	S														T	T
Template Predicted Secondary structure						.				.	.	.	.	.	.														.																							.	.	.	.	.
Template SS confidence
		50	.	.	.		.	.	.							.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.		70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.						.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.
				167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.			230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																																																																.	.
Query SS confidence		.	.																																																																.	.
Query Sequence		.	.	F	E	E	C	Q	V	Y	R	I	D	H	Y	L	G	K	E	T	V	L	N	L	L	A	L	R	F	A	N	S	L	F	V	N	N	W	D	N	R	T	I	D	H	V	E	I	T	V	A	E	E	V	G	I	E	G	R	W	G	Y	F	D	K	A	.	.	G	Q	M	R	D	M	I	Q	N	H	L	L	Q
Query Conservation		.	.																																																																.	.
Alig confidence		.	.											.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.																											.	.								.
Template Conservation														.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.																																				.
Template Sequence		V	F	L	X	E	A	Q	K	S	V	F	L	.	.	.	.	.	P	I	T	Q	K	V	K	A	T	I	Q	E	G	G	L	.	.	.	.	.	.	.	G	E	I	L	W	V	Q	S	V	T	A	Y	P	N	V	D	H	I	P	W	F	Y	S	R	E	A	G	G	G	A	L	H	G	S	G	.	S	Y	P	L	Q
Template Known Secondary structure									S	G	G	G		.	.	.	.	.												T	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.		S											S			T	T		T	T	T	T		S	S	S	S		S						T	.
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.																																				.
Template SS confidence
		117	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.						.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.								.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.		.	180	.	.	.
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	L	C	M	I	A	M	S	P	P	S	D	L	S	A	D	S	I	R	D	E	K	V	K	V	L	K	S	L	R	R	I	D	R	S	N	V	R	E	K	T	V	R	G	Q	Y	T	A	G	F	A	Q	G	K	K	V	P	G	Y	L	E	E	E	G	A	N	K	S	S	N	T	E	T	F	V	A	I	R	V	D
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	L	Q	Y	V	L	G	K	E	I	Q	E	V	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	A	T	Y	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	G	A	T	D	S	Q	C	N	L	A	L	K
Template Known Secondary structure							S	S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	200	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	D	N	W	R	W	A	G	V	P	F	Y	L	R	T	G	K	R	L	P	T	K	C	S	E	V	V	V	Y	F	K	T	P	E	L	N	L	F	K	E	S	W	Q	D	L	P	Q	N	K	L	T	I	R	L	Q	P	D	E	G	V	D	I	Q	V	L	N	K	V	P	G	L	D	H	K	H	N	L	Q	I	T
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.																	.														.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.																	.														.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	A	E	.	.	.	.	G	T	L	G	N	I	F	I	N	V	G	L	K	I	P	S	.	E	X	T	I	C	G	T	K	G	Q	I	V	I	.	.	.	.	.	P	N	F	W	K	T	D	C	A	Y	Y	T	D	A	Q	G	N	T	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			T	T	.	.	.	.	S										S						.							T	T						.	.	.	.	.		T	T	T	T		S							S	S	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.																	.														.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		217	.	.					220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.		.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.						.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430					.	.	.	.	.		.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.						.
Query SS confidence																														.	.	.	.						.
Query Sequence		K	L	D	L	S	Y	S	E	T	F	N	Q	T	H	L	A	D	A	Y	E	R	L	L	L	E	T	M	R	.	.	.	.	G	I	Q	A	L	.	F	V	R	R	D	E	V	E	E	A	W	K	W	V	D	S	I	T	E	A	W	A	M
Query Conservation																														.	.	.	.						.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.						.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	S	E	Q	F	T	S	E	F	T	Y	E	I	N	H	V	N	Q	C	L	Q	D	K	K	L	T	S	P	V	X	T	K	E	L	T	I	A	T	V	K	I	V	E	S	F	Y	Q	E	W	F	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S																T	T		S	S		S	S	S																				T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
												269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.