Job Description P52043 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:57 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 380 % Identity 27% Template c3eh7A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:4-hydroxybutyrate coa-transferase; PDBTitle: the structure of a putative 4-hydroxybutyrate coa-transferase from2 porphyromonas gingivalis w83 Resolution 2.05 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	T	Q	W	T	R	M	T	A	N	E	A	A	E	I	I	Q	H	N	D	M	V	A	F	S	G	F	T	P	A	G	S	P	K	A	L	P	T	A	I	A	R	R	A	N	E	Q	H	E	A	K	K	P	Y	Q	I	R	L	L	T	G	A	S	I	S	A	A	A	D	D	V	L	S	D	A	D	A	V	S	W
Query Conservation
Alig confidence																												.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	Y	A	S	R	I	V	S	A	E	E	A	V	K	H	I	K	N	G	E	R	V	A	L	S	H	.	.	A	A	G	V	P	Q	S	C	V	D	A	L	V	Q	Q	A	D	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	V	E	I	Y	H	X	L	C	L	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	G	G	G	G									T	T			T	T								.	.	G	G	G												S	T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.							B		T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																												.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.			.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.									.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	A	P	Y	Q	T	S	S	G	L	R	K	K	I	N	Q	G	A	V	S	F	V	D	L	H	L	S	E	V	A	Q	M	V	N	Y	G	F	F	G	D	I	D	V	A	V	I	E	A	S	A	L	A	P	D	G	R	V	W	L	T	S	G	I	G	N	A	P	T	W	L	L	R	A	K	K	V	I	I	E	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	R	A	D	F	I	P	V	F	F	Y	E	V	P	S	X	I	R	K	D	I	L	.	H	I	D	V	A	I	V	Q	L	S	X	P	D	E	N	G	Y	C	S	F	G	V	S	C	D	Y	S	K	P	A	A	E	S	A	H	L	V	I	G	E	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T						G	G	G							T	T	S	S	.			S											T	T	S					T	T	B		T	T									S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template SS confidence
																		65	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.		.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	H	Y	H	D	P	R	V	A	E	L	A	D	I	V	I	P	G	A	P	P	R	R	N	S	V	S	I	F	H	A	M	D	R	V	G	T	R	Y	V	Q	I	D	P	K	K	I	V	A	V	V	E	T	N	L	P	D	A	G	N	M	L	D	K	Q	N	P	M	C	Q	Q	I	A	D	N	V	V	T	F	L
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	R	Q	X	P	Y	V	H	G	D	N	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	H	I	S	K	L	D	Y	I	V	X	A	D	Y	P	I	Y	S	L	A	K	P	K	I	G	E	V	E	E	A	I	G	R	N	C	A	E	L	I
Template Known Secondary structure			T	T	S						S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			G	G	G		S																															T
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.						.	.	310	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																				.	.	.	.	.
Query Sequence		L	Q	E	M	A	H	G	R	I	P	P	E	F	L	P	L	Q	S	G	V	G	N	I	N	N	A	V	M	A	R	L	G	E	N	P	V	I	P	P	F	M	M	Y	S	E	V	L	Q	E	S	V	V	H	L	L	E	T	G	K	I	S	G	A	S	A	S	.	.	.	.	.	S	L	T	I	S	A	D	S	L
Query Conservation																																																																				.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.																														.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	G	A	T	L	Q	L	G	I	G	A	I	P	D	A	A	L	L	F	L	K	D	K	.	.	.	K	D	L	G	I	H	T	E	X	F	S	D	G	V	V	E	L	V	R	S	G	V	I	T	G	K	K	K	T	L	H	P	G	K	X	V	A	T	F	L	X	G	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T							S	S									T	T	T	T		.	.	.		S	B					S												T	T	S	B			T	T		S	S	S	T	T					S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Template SS confidence
												208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.				.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.		.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
Predicted Secondary structure																														.																																																.	.	.	.
Query SS confidence																														.																																																.	.	.	.
Query Sequence		R	K	I	Y	D	N	M	D	Y	F	A	S	R	I	V	L	R	P	Q	E	I	S	N	N	P	E	I	I	.	R	R	L	G	V	I	A	L	N	V	G	L	E	F	D	I	Y	G	H	A	N	S	T	H	V	A	G	V	D	L	M	N	G	I	G	G	S	G	D	F	E	R	N	A	Y	L	S	.	.	.	.
Query Conservation																														.																																																.	.	.	.
Alig confidence														.																.																										.																						.	.	.	.
Template Conservation														.																																										.
Template Sequence		E	D	V	Y	H	F	I	D	K	N	P	D	.	V	E	L	Y	P	V	D	Y	V	N	D	P	R	V	I	A	Q	N	D	N	X	V	S	I	N	S	C	I	E	I	D	L	X	G	Q	V	V	S	E	C	I	.	G	S	K	Q	F	S	G	T	G	G	Q	V	D	Y	V	R	G	A	A	W	S	K	N	G	K
Template Known Secondary structure									T	T		T	T	.										T						T	T	S	S	S								S				T	T							S	T	.	T	S			S	B				T											S	T	T
Template Predicted Secondary structure														.																																										.
Template SS confidence
		275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.		.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.		.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.
			392	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.				.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																					.	.	.
Query SS confidence		.																					.	.	.
Query Sequence		.	I	F	M	A	P	S	I	A	K	E	G	K	I	S	T	V	V	P	M	C	.	.	.	S	H	V	D	H	S	E	H	S	V	K	V	I	I	T	E	Q	G	I	A	D	L	R	G	L	S	P	L	Q	R	A	R	T	I	I	D	N	C	A	H	P	M	Y	R	D	Y	L	H	R	Y	L	E	N	A	P	G
Query Conservation		.																					.	.	.
Alig confidence		.																					.	.	.																																				.
Template Conservation																																																													.
Template Sequence		S	I	X	A	I	P	S	T	A	K	N	G	T	A	S	R	I	V	P	I	I	A	E	G	A	A	V	T	T	L	R	N	E	V	D	Y	V	V	T	E	Y	G	I	A	Q	L	K	G	K	S	L	R	Q	R	A	E	A	L	I	.	A	I	A	H	P	D	F	R	E	E	L	T	K	H	L	R	K	R	F	G
Template Known Secondary structure								S			T	T	T	T			S			S	S			T	T							T	T	T							T	T						T	T												.	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																													.
Template SS confidence
		353	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.		.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.