Job Description P76217 Confidence 97.83% Date Thu Jan 5 12:20:42 GMT 2012 Rank 47 Aligned Residues 335 % Identity 18% Template d1k75a_ SCOP info ALDH-like ALDH-like L-histidinol dehydrogenase HisD Resolution 1.75

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		53	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	100	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	A	R	L	S	F	A	E	R	H	A	V	V	E	R	F	A	A	L	L	E	S	N	K	A	E	L	T	A	I	I	A	R	E	T	G	K	P	R	W	E	A	A	T	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	T	A	M	I
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	N	S	C	T	A	E	Q	Q	R	Q	L	L	X	R	P	A	I	S	A	S	E	S	I	T	R	T	V	N	D	I	L	D	N	V	K	A	R	G	D	E	A	L	R	E	Y	S	A	K	F	D	K	T	T	V	T	A	L	K	V	S	A	E	E	I	A	A	A	S	E	R	L	S	D	E	L	K	Q	A	X
Template Known Secondary structure		G	G	G	S									T																																				S	S	S					S		S	B													S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
		103	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.				.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.				.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.																							.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.																							.	.	.
Query Sequence		N	K	I	A	I	S	I	K	A	Y	H	V	R	T	G	E	Q	R	S	.	.	.	E	M	P	D	G	A	A	S	L	R	H	R	P	H	G	V	L	A	V	F	G	P	.	.	.	Y	N	F	P	G	H	L	P	N	G	H	I	V	P	A	L	L	A	G	N	T	I	I	F	K	P	S	E	L	T	P	W	S
Query Conservation																					.	.	.																							.	.	.
Alig confidence																					.	.	.																							.	.	.					.																								.	.
Template Conservation																																																					.																								.	.
Template Sequence		A	V	A	V	K	N	I	E	T	F	H	T	A	Q	K	L	P	P	V	D	V	E	T	Q	P	G	V	R	C	Q	Q	V	T	R	P	V	A	S	V	G	L	Y	I	P	G	G	S	A	P	L	F	.	S	T	V	L	X	L	A	T	P	A	S	I	A	G	C	K	K	V	V	L	C	S	P	.	.	P	P	I
Template Known Secondary structure														T	T											T	T											S									S	S	S				.														T		S								.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																					.																								.	.
Template SS confidence
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.		140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.			.	.	.
		177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210					.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.			.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.																												.	.
Query SS confidence																																				.	.	.	.																												.	.
Query Sequence		G	E	A	V	M	R	L	W	Q	Q	A	G	L	P	P	G	V	L	N	L	V	Q	G	G	R	E	T	G	Q	A	L	S	A	L	.	.	.	.	E	D	L	D	G	L	L	F	T	G	S	A	N	T	G	Y	Q	L	H	R	Q	L	S	G	Q	P	E	.	.	K	I	L	A	L	E	M	G	G	N	N	P	L
Query Conservation																																				.	.	.	.																												.	.
Alig confidence																	.				.	.														.	.	.	.																		.										.	.
Template Conservation																	.				.	.																																			.
Template Sequence		A	D	E	I	L	Y	A	A	Q	L	C	G	V	Q	D	.	V	F	N	.	.	V	G	G	A	Q	A	I	A	A	L	A	F	G	T	E	S	V	P	K	V	D	K	I	F	G	P	G	N	A	F	V	T	E	A	.	K	R	Q	V	S	Q	R	L	D	G	A	A	I	D	X	P	A	G	P	S	E	V	L	V
Template Known Secondary structure												T	T				.				.	.															S	S	S				S							S							.							S	T	T	S				S
Template Predicted Secondary structure																	.				.	.																																			.
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180		.	.	.			.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.		.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	I	D	E	V	A	D	I	D	A	A	V	H	L	T	I	Q	S	A	F	V	T	A	G	Q	R	C	T	C	A	R	R	L	L	L	K	S	G	A	Q	G	D	A	F	L	A	R	L	V	A	V	S	Q	R	L	T	P	G	N	W	D	D	E	P	Q	P	F	I	G	G	L	I	S	E	Q	A	A	Q	Q	V
Query Conservation
Alig confidence																									.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	A	D	S	G	A	T	P	D	F	V	A	S	D	L	L	S	Q	A	E	H	G	P	.	.	.	.	D	S	Q	V	I	L	L	T	P	A	A	D	X	A	R	R	V	A	E	A	V	E	R	Q	L	A	E	L	P	R	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T	T	S														T	T		T	.	.	.	.	T								S																		T		S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.					.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	T	A	W	Q	Q	L	E	A	M	G	G	R	P	L	L	A	P	R	L	L	Q	A	G	T	S	L	L	T	P	G	I	I	E	M	T	G	V	A	G	V	P	D	E	E	V	F	G	P	L	L	R	V	W	R	Y	D	T	F	D	E	A	I	R	M	A	N	N	T	R	F	G	L	S	C	G	L	V	S	P
Query Conservation
Alig confidence		.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Template Conservation		.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Template Sequence		.	E	T	A	R	Q	A	L	N	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	L	I	V	T	K	D	L	A	Q	C	V	E	I	S	N	Q	Y	G	P	.	E	H	L	I	I	Q	T	R
Template Known Secondary structure		.								T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S	S														.	S						S	T
Template Predicted Secondary structure		.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Template SS confidence
			296	.	.	.	300	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.		.	.	.	.	330	.	.	.
		411	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.		.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.									.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
Predicted Secondary structure															.												.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.												.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	R	E	K	F	D	Q	L	L	L	E	A	R	.	A	G	I	V	N	W	N	K	P	L	T	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	A	S	T	A	P	F	G	G	I	G	A	S	G	N	H	R	P	S	A	W	Y	A	A	D	Y	C	A	W	P	M	A	S	L	E
Query Conservation															.												.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.									.												.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.																																				.	.	.	.	.
Template Sequence		N	A	.	.	.	R	E	L	V	D	S	I	T	S	A	G	S	V	F	L	G	D	W	S	P	E	S	A	G	D	Y	A	S	G	T	N	H	V	L	P	.	.	.	.	.	T	Y	G	Y	T	A	T	C	S	S	L	G	L	A	D	F	Q	K	R	X	T	V	Q	E
Template Known Secondary structure		T		.	.	.				G	G	G					S					S	T	T									T	S	S	S						.	.	.	.	.		T	T	G	G	G	T						G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure				.	.	.																																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
		334	.				.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370						.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.